纽约(基因组网新闻)-一组澳大利亚和美国的研究人员已经生成了一种新的基因组遗传连锁图对于咸水鳄来说Crocodylus porosus根据今天在网上发表的一项研究BMC基因组学.
研究小组评估了数十只鳄鱼体内的200多个微卫星标记,得出了迄今为止最精细的咸水鳄鱼遗传图谱,其中包括14个连锁群。该图谱有望为更广泛的鳄鱼基因组特征描述和比较基因组学研究提供基础。如果是这样,研究人员说,这可能会使人们更好地了解鳄鱼和动物生物学,并改善鳄鱼养殖计划。
悉尼大学动物遗传学家、资深作者克里斯·莫兰(Chris Moran)和他的合著者写道:“我们已经为鳄鱼目动物或任何其他非鸟类爬行动物绘制了第一张连锁图。”
鳄鱼属于一种爬行动物,与恐龙有亲缘关系,最终演变为鸟类。它们的祖先被认为在大约3亿年前从进化成哺乳动物的群体中分离出来。
但是,作者指出,虽然基因组测序工作的目标是解开一些鸟类和爬行动物物种的基因组,但对鳄鱼群体的基因了解很少。2006年,澳大利亚研究人员发表了一篇论文识别四个鳄鱼遗传连锁群涉及10个位点。然而,在最新的研究中,莫兰和他的同事们开发了一个完整的遗传连锁图,包括最近发现的微卫星标记。
他们解释说:“鳄目动物综合遗传图谱的生成将为基因组序列组装提供有价值的支架,并将对旨在了解爬行动物和其他羊膜动物基因组分子进化的比较绘制工作具有内在价值。”
莫兰和他的同事们研究了来自澳大利亚北部达尔文鳄鱼农场的5个鳄鱼家族的83只鳄鱼的203个微卫星标记。研究小组对这些家族进行了两代人的跟踪调查,整合了鳄鱼谱系记录中的信息。
总的来说,该团队确定了14个连锁群,包括180个位点。不过,到目前为止,这些连锁基团还没有被映射到鳄鱼的染色体上。其余23个基因座被解除连接。
研究人员指出,雌性鳄鱼的重组图几乎是雄性鳄鱼的6倍大。虽然这种差异的原因尚不清楚,但他们推测这可能与鳄鱼的性别决定过程有关,这是基于温度的。
参与绘制鳄鱼基因图谱的人说,它应该为基因组测序工作、涉及其他鳄鱼物种的比较基因组学研究以及其他旨在揭示鳄鱼性状遗传基础的工作提供基础。因此,他们补充说,这张地图可能会对养殖鳄鱼产生影响,提供遗传信息,可以改善理想特征的选择。
他们写道:“随着研究人员继续努力阐明鳄鱼基因组,第一代地图为更详细的测绘调查奠定了基础,并为未来的基因组序列组装提供了有价值的支架。”