芝加哥——癌症遗传学将在今年晚些时候扩大其基于阵列的检测菜单，包括为弥漫性大b细胞淋巴瘤和肾细胞癌患者提供治疗信息的检测。
该公司负责研发的副总裁简·霍尔兹沃斯(Jane Houldsworth)说，CGI公司的目标是在年底前获得适当的许可证，通过其符合clia标准的实验室提供新的检测服务。
霍尔兹沃斯接受了采访BioArray新闻在本周在这里举行的癌症细胞基因组微阵列联盟年会上。
位于新泽西州卢瑟福的CGI公司目前为临床医生提供两种基于阵列的测试服务。这些测试依赖于CGI内部设计的成熟b细胞肿瘤，或MatBA阵列，以识别在慢性淋巴细胞白血病和小淋巴细胞淋巴瘤中具有预后价值的基因组畸变。
CGI的MatBA-CLL测试于2010年获得CLIA认证，并于去年获得纽约州许可证。今年1月，纽约州颁发了第二张许可证，允许CGI测试SLL样本。安捷伦技术公司在其4x44K CGH平台上制造CGI的MatBA阵列，该平台允许CGI在每张幻灯片上的四个44,000标记阵列上运行样本。
根据holdsworth的说法，DLBCL的新检测将依赖于相同的MatBA阵列设计，而即将推出的肾细胞癌检测将使用第二种内部设计的名为UroGenRA的阵列。
后者主要用于肾癌、膀胱癌和前列腺癌。对于肾癌，该公司声称该阵列旨在对患者管理的几个级别进行肿瘤分类:诊断偶然发现的小肾肿块的图像引导针活检;对肿瘤较大的患者进行诊断，以对局部或局部晚期疾病的风险进行分层;对于那些患有转移性疾病的患者，目前的药物试验是基于术后肿瘤诊断;而且，潜在的，在诊断所谓的形态上未分类的肾癌。
根据霍尔兹沃思的说法，CGI向临床医生提供了更广泛的基于阵列的测试包。该公司还提供其他一些检测服务，包括测序、免疫组织化学和荧光原位杂交，给它的客户。
霍尔兹沃斯说:“我们决定以疾病为导向，所以我们为其中一些疾病提供一些专业检测，比如慢性淋巴细胞白血病。”在CLL的情况下，CGI提供了一个名为CLL Complete的包，包括MatBA-CLL测试，以及其他分析，包括FISH，核型分析，TP53和NOTCH1基因突变分析，以及IGHV重排突变状态分析。霍尔兹沃斯说，这种包容性的方法使公司能够向可能不熟悉微阵列技术的客户提供其阵列。vwin德赢ac米兰合作
霍尔兹沃斯说:“我们经常发现，那些给我们寄来样本进行IGHV突变分析的人开始流行起来，也开始做这种阵列。”她补充说，CGI可能会以同样的方式提供DLBCL和肾细胞癌的套餐。
CGI的一些客户确实特别要求数组分析。霍尔兹沃斯说，学术机构经常要求内部实验室进行某些测试，如FISH分析，并只允许外包他们内部不提供的测试，如CGI的基于阵列的测试。CGI还允许客户在治疗过程中订购单独的测试，而不是运行特定包中提供的所有测试，如CLL Complete。
在竞争对手方面，霍尔兹沃思描述了市场上大多数其他癌症细胞遗传学产品的范围更广。对于CLL，她说，许多营利性和学术实验室正在CLL上运行全基因组阵列，“因为从基因组的意义上讲，它是相对平静的，而且由于它是外周血，所以更容易研究。”
例如，贝勒医学院(Baylor College of Medicine)提供了针对2300个癌症相关基因的40万个标记阵列的癌症染色体微阵列分析。ARUP实验室还提供用于肿瘤检测的细胞基因组SNP阵列。珀金埃尔默公司的Signature Genomics公司通过其人类OncoChip提供癌症检测。然而，尽管CLL被命名为所有阵列的适应症，但这种芯片并不仅仅专注于这种疾病，霍尔兹沃思指出。
霍尔兹沃思说:“所有这些癌症都有不同的治疗方法。“例如，DLBCL是一种侵袭性淋巴瘤，与滤泡性淋巴瘤相比，它有一些问题需要回答，滤泡性淋巴瘤是一种相对惰性的疾病，直到发展到需要治疗的程度，”她说。因此，像它的竞争对手一样，CGI使用数组格式，但与某些竞争对手不同的是，它选择了一种有针对性的方法。
想要扩张
成立于马萨诸塞州坎布里奇。1999年，CGI最初专注于FISH和核型分析。2008年，当它搬到目前位于卢瑟福的17,936平方英尺的空间时，它选择扩大服务范围，包括染色体微阵列分析。
“作为研究人类癌症基因组畸变的自然延伸，我们认为阵列将是一个很好的领域，所以当我们搬到卢瑟福大学时，我们买了我们需要的设备，”霍尔兹沃思说。
除了MatBA和UroGenRA阵列，CGI还有另外两个正在开发中。第三组被称为UgenRA，主要针对妇科癌症——宫颈癌、卵巢癌和子宫内膜癌。第四种被称为LeukA，有望有助于白血病主要类型和亚型的鉴别诊断和预后。霍尔兹沃斯没有提供临床医生何时可以使用这两种方法的时间表。“在我们的研究实验室里，它们都处于不同的阶段，”她说。
去年12月，这家私人控股公司向美国证券交易委员会(sec)提交了一份招股说明书，根据今年5月的一份修订文件，该公司正寻求通过首次公开募股(ipo)筹集至多4900万美元。霍尔兹沃斯表示，迄今为止，CGI所有与阵列相关的业务都在美国，但该公司希望IPO所得将使其能够扩大在美国和海外的销售和营销工作。
霍尔兹沃斯说:“我认为销售队伍需要大幅扩大。”他补充说，赢得新客户需要对临床医生进行教育。她没有透露有多少CGI员工参与销售和营销。该公司目前的员工总数约为50人。她补充说，CGI还计划将IPO所得用于研发。
在5月份提交给SEC的文件中，CGI表示，约1,400万美元的净收益将用于扩大业务和为现有业务提供资金;1000万美元将用于雇用额外的销售和营销人员，并支持增加销售和营销活动;900万美元将用于偿还某些债务;900万美元将用于研发工作和科学合作。
当时，该公司表示，计划在纳斯达克全球市场以“CGIX”股票代码进行交易。根据这份文件，2011年，癌症遗传公司的收入为300万美元，比2010年的250万美元增长了20%，而净亏损从2010年的840万美元增加了一倍多，达到1990万美元。
2012年第一季营收增长1%，从上年同期的82.5万美元增至83.5万美元，净亏损从910万美元增至110万美元。
CGI表示，从1999年4月成立到2012年3月31日，该公司累计净亏损4330万美元。截至2012年第一季度末，该公司持有现金及现金等价物200万美元。