罗氏NimbleGen将生产、营销和销售两家公司上周表示，Signature基因组实验室将在全球范围内设计用于细胞遗传学研究的比较基因组杂交阵列，而Signature将为罗氏阵列客户提供和支持软件分析工具。
斯波坎,洗。Signature此前曾在安捷伦技术公司生产的细菌人工染色体阵列平台和寡核苷酸平台上提供服务。
作为新协议的一部分，该公司将仅在罗氏nimblegen制造的阵列平台上提供服务，并将在今年年底前停止使用其BAC阵列平台。
Signature的首席医疗官Bassem Bejjani表示，这笔交易“在生命科学领域具有独特的深度”，“不仅仅是采用一个新的平台”。贝贾尼表示，Signature最近从安捷伦转向罗氏NimbleGen，原因是“他们的产品质量以及这样的合作将为我们两家公司提供的战略机会。BioArray新闻上周。
Signature成立于2003年，最初在一个自制的BAC阵列平台上提供服务，然后在2007年引入了安捷伦制造的oligo设计禁止10/23/2007)．该寡核苷酸阵列被称为SignatureChip OS，提供了超过150种染色体综合征的覆盖，每个阵列包含105,000个特征，平均每个临床靶点有50个寡核苷酸。该阵列每35kb也有一个寡核苷酸的主干。
Bejjani说Signature公司由罗氏公司制造的新阵列与安捷伦公司制造的阵列设计相似。他说:“我们的目标是已知或怀疑在器官发生、模式形成、发育和其他重要功能中发挥重要作用的基因，此外还设计了一个跨基因组的‘主干’。”
Bejjani说Signature“专注于技术”，“总是在评估能够满足我们需求的最佳技vwin德赢ac米兰合作术”。他说，该公司最近决定在2009年底前停止生产BAC阵列。“在可预见的未来，我们将只使用罗氏NimbleGen阵列。”
在解释技术转换时，Bejjani提到vwin德赢ac米兰合作了罗氏的阵列制造技术，他说该技术“允许阵列上寡核苷酸密度的无限增加”以及“其他阵列无法提供的多路复用”。
两个平台之间的具体差异包括密度差异。例如，Roche NimbleGen的HD2阵列平台在一个阵列上提供210万个寡核苷酸探针。与此同时，安捷伦的SurePrint G3阵列为用户提供了每个阵列100万个oligo的访问。
Bejjani说，随着样品数量的增加，使用高密度阵列的能力和每个阵列处理更多样品的能力的结合对Signature的工作流程有“许多影响”。Bejjani举例说BioArray新闻3月，Signature自成立以来已经运行了超过35000个数组禁止3/24/2009)．上周，他说该公司的数据库中现在有4万多个样本。
“互利”
罗氏NimbleGen上周宣布了其新的signature设计的NimbleGen CGX阵列，用于染色体异常的全基因组分析。
该阵列将于本月晚些时候推出，格式为每张幻灯片3个样本和每张幻灯片12个样本。据该公司称，每张幻灯片6个样本的格式将于2010年初推出。
根据Roche NimbleGen的说法，全基因组寡核苷酸阵列使用户能够调查200多个细胞遗传学相关区域，超过675个功能显著基因，5兆碱基的端粒和周中心区域，每10千碱基覆盖一个寡核苷酸，每10 kb覆盖一个寡核苷酸的伪常染色体区域，以及每35 kb覆盖一个寡核苷酸的全基因组主干。
NimbleGen CGX阵列由威斯康星州麦迪逊。此外，Signature还将向CGX客户提供Genoglyphix数据分析软件。
罗氏NimbleGen的CGH和CNV阵列产品经理Vanessa Ott告诉记者BioArray新闻上周说这些芯片只用于研究。虽然美国食品和药物管理局正在考虑加强对细胞遗传学检测中使用阵列的监督，但Ott说罗氏的目标是“保持对现行法规的遵守，并支持为此目的使用阵列的研究实验室”(见禁止10/13/2009)．
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罗氏正在欧洲和亚洲举办一系列研讨会，支持其CGX阵列的推广。上周，Signature首席执行官丽莎•谢弗(Lisa Shaffer)在比利时鲁汶(Leuven)的四个研讨会上发表了演讲;伦敦;德国慕尼黑;和日内瓦。未来一周，罗氏还将在北京、香港、台北、曼谷、新加坡、首尔和印度孟买举办CGX研讨会。
奥特说，该公司认为细胞遗传学研究是一个“巨大的增长市场”，也是“CGH最大的增长领域之一”，因为实验室使用了染色体组型和荧光等较老的技术原位杂化过渡到阵列CGH。
罗氏NimbleGen在阵列市场的主要竞争对手也试图进入这一领域。安捷伦一直保持着自称为“阵列代工”的角色，为牛津基因技术公司、BlueGnome、贝勒医学院医学遗传学实验室和亚特兰大埃默里遗传学实验室等公司和实验室生产芯片。vwin德赢ac米兰合作与此同时，Affymetrix和Illumina在各自的平台上开发了针对细胞遗传学研究的特定产品。
通过与Signature合作，罗氏NimbleGen正在其内部开发的平台上向市场提供外部设计的阵列。Ott指出，CGX阵列是罗氏“第一套由细胞遗传学家专门设计的产品”。
该公司的合作伙伴关系依赖于Signature的芯片设计，罗氏对阵列和相关试剂和仪器的制造和支持，以及客户对Genoglyphix的访问。基于web的界面允许用户将他们的结果与超过40,000个签名样本进行比较。
“Genoglyphix是由细胞遗传学家为其他细胞遗传学家开发的，”Ott说。“它有很多丰富的注释来帮助数据分析，该软件与Signature多年来分析的样本数据库相链接。”两家公司表示，Signature将为该软件提供技术支持。
Ott表示，罗氏与Signature已经有了几年的“合作关系”，尽管Signature在其服务中使用了安捷伦制造的阵列，但它一直是一个“标准客户”。她表示，这种“企业对企业的关系”源于Signature希望将自己的设计提供给其他客户。
她说:“这是一个互惠互利的协议。”她指出，虽然罗氏获得了一个不断增长的阵列市场，但Signature将受益于罗氏的全球影响力，这从最近一系列的欧洲和亚洲研讨会就可以看出。
Signature公司的Bejjani说，自成立以来，Signature公司一直“相信阵列CGH对细胞遗传学是一项非常有价值的技术”，并“致力于向所有对采用该技术感兴趣的细胞遗传学实验室推广阵列CGH的使用，因为它非常有用。”vwin德赢ac米兰合作
例如，谢弗被告知BioArray新闻在2005年，该公司正在考虑如何将其成功推广到其他实验室，但对为Signature的阵列提供技术支持持谨慎态度。“我不想在全国排查300个实验室，”她谈到Signature当时的立场时说禁止11/2/2005)．
Bejjani说，“有许多实验室不具备设计符合他们需求的阵列的专业知识”，通过与罗氏合作，该公司最终能够通过“共享我们的阵列”来“推动细胞遗传学领域向前发展”。