纽约 - 由美国和英国的调查人员领导的国际团队已经确定了遗传变异，基因和细胞类型，具有型糖尿病的因果关系，以及有前途的新药物目标。
通过基因组 - 宽的关联研究，包括超过61,400个患有免疫芯片阵列的组织，研究人员追踪了数十个T1D相关的基因座 - 一个包含三十名网站的集合，其过去尚未报道过了有关的重要关联。
从那里，他们依赖于基于ATAC-SEQ的染色质易用性分析，染色质无障碍相关的定量特性基因座，或QTL，分析以及来自跨越多个祖先背景的个人中的样本中的其他细映射方法，以专注于潜在的因果贡献者自身免疫性疾病。
“我们通过增加样本大小，致密的基因分型和归责，包括不同的祖先群体，并优化了对精细绘图的优化分析方法，提高了许多T1D地区的推定因果关系和独立关联数量。”弗吉尼亚大学和约翰托德大学的一名研究员，牛津大学的JDRF / Wellcome糖尿病和炎症实验室，以及他们的共同作者在一个中写道学习出版于自然遗传学在星期一。
基于他们对多种细胞类型的新和公开的ATAC-SEQ数据的分析，研究人员展示了T1D风险变体在含有开放染色质区域的基因组的部分中可能特别常见，该区域响应CD4 + T细胞的免疫刺激。
例如，基于48个欧洲和67个非洲个体的CD4 + T细胞中的染色质可用性曲线，它们发现了与11种染色质无障碍峰重叠的基因组的五个相关部分。这些包括用于T1D的疑似因果变体的五个基因座。其中包括染色体6个基因座，其包括Bach2及其周围的变体，该基因编码用于先前涉及适应性免疫调节和其他方法的转录调节剂。
通过额外的微映射分析，该分析掺入染色质互动，表达QTL和其他数据，该团队在称为RS72928038的T1D相关的BACH2变体上缩小，所述TR72928038似乎影响了BACH2本身在CD4 + T细胞中的表达。
“我们在编码转录因子BACH2的T1D基因座中提出了一个遗传调节机制的遗传调节机制的令人兴奋的假设，”作者补充说，“将杂志与免疫蛋白质网络集成，我们识别目标T1D候选基因和网络的药物。”
通过它们的综合功能基因组学，蛋白质相互作用和遗传风险变异分析，研究人员还标记了十几种相关基因，这些基因已针对其他自身免疫条件的临床试验，尽管他们指出，其他候选人和因果关系可能会出现遗传研究继续扩大到额外的细胞类型和参与者人口中。
“虽然这种分析是根据遗传证据的最大和最全面的研究，优先考虑在T1D中的新基因靶点，扩大未来的遗传研究对基因组的分析和持续努力扩大各种人口的群组将进一步定义T1D的遗传景观，“作者结束了。