纽约——脱离隐形模式不到两年,生物技术初创公司Mammoth Biosciences的目标是将其产品组合中的CRISPR-Cas核酸酶转化为产品。
本月早些时候,该公司——由加州大学伯克利分校CRISPR研究员詹妮弗·杜德纳于2018年联合创立——与地平线探索公司签署了合作协议识别和优化猛犸拥有的新蛋白质,以开发工程细胞系。
两家公司正计划制造新一代基因工程CHO细胞,用于生产治疗性抗体等生物治疗药物。Horizon的生物生产业务部门目前为生物制药行业提供CHO细胞系和定制服务,以促进性能最佳的基因编辑细胞系的开发和鉴定。根据与Mammoth公司的协议条款,Horizon公司将有权使用Mammoth公司的CRISPR平台,两家公司将合作优化特定的CRISPR工具,以快速开发专有的CHO细胞系,其中选定的基因将被敲除,以提高生产力或纯化等性能参数。
在这笔交易之后,该公司宣布已完成超额认购的4500万美元B轮融资。Mayfield、NFX、Verily和Brook Byers参与了本轮融资,由德诚资本领投。到目前为止,Mammoth已经筹集了超过7000万美元的资金。
在退出隐身模式后不久,猛犸公司谈到了它的计划创建一个基于crispr的疾病检测平台它可以有家庭和医院使用的版本,使用Cas12和Cas13寻找DNA和RNA,以检测各种疾病。2019年3月,该公司成功了将新发现的Cas14核酸酶添加到它的组合中由于Cas14的体积非常小,并且不需要特定的原间隔相邻基元(PAM)来结合或分裂目标DNA序列,因此它的疾病检测平台比类似技术具有推定的优势。
该公司早期的重点似乎是诊断。在该公司获得Cas 14许可的时候,Mammoth的首席执行官Trevor Martin指出,该平台将能够有目的地利用任何CRISPR-Cas蛋白质,并且Cas蛋白质可以进行多路复用,以检测多种核酸,甚至同时检测DNA和RNA。
然而,除了开发自己的疾病检测平台,该公司还积极参与蛋白质发现工作,寻找新的和新颖的Cas核酸酶,它可以使用或工程。这些努力已经开始收到成效,Horizon交易就是一个例子。
马丁在一次采访中说:“这是我们第一次公开宣布利用这些我们已经获得的新型核酸酶,如Cas14,用于诊断以外的领域——在这种情况下,细胞生产线。”“从一开始,我们就知道我们的许多新核酸酶在诊断之外具有非常有趣和有用的特性,在治疗和基因编辑等领域。当然,我们的蛋白质发现管道正在不断生产用于诊断和治疗的蛋白质。”
该公司的蛋白质发现过程利用硅内方法搜索宏基因组数据库,并使用机器学习算法分析它们,以搜索CRISPR或类CRISPR系统。高通量在活的有机体内筛选然后用于识别CRISPR蛋白的特征和功能。
根据Martin的说法,Cas14的发现是发现和表征管道中最明显的成功例子科学研究卡斯14的发现者是卢卡斯·哈林顿,他当时是杜德纳实验室的一名研究员,现在是猛犸公司的联合创始人和首席发现官。但马丁也指出,该公司的流水线已经生产了许多目前还不能公开的其他蛋白质。
他说:“我们认为(这些蛋白质)真的能够实现下一代的新用途。”“以Cas14为例,其中一个特性当然是,它具有非常有用的诊断能力。但同时,从我们描述和开发它的那一刻起,很明显,这将是非常令人兴奋的治疗应用。”
鱼与熊掌兼得。
与Horizon的交易可能不是Mammoth在治疗领域的最后一笔交易。它的蛋白质发现和开发过程中很大一部分涉及到为特定应用量身定制核酸酶的能力。
马丁说:“我们肯定对真空中可能存在的随机参数不感兴趣。”“但我们在考虑合作关系的任何时候,例如,我们都会考虑产品需求,然后我们可以根据这些需求调整发现过程。”
例如,在诊断学中,这将需要观察一个核酸酶是否需要特定的活动时间或它需要在特定的温度下工作。在治疗学方面,该公司正致力于寻找或改造能够促进治疗的核酸酶在活的有机体内编辑。
目前,大多数基于基因编辑的治疗方法被应用体外马丁说,这对患者的时间、成本和风险都有影响。虽然Cas9作为一种可能的治疗剂有很多优点,但它在在活的有机体内编辑,如其大小。
“像Cas14这样的新型核酸酶具有明显的优势。最直接的是它的大小——它的大小可能是Cas9的三分之一左右,甚至更小。”“所以,这是非常令人兴奋的,因为它实现了以前效率不高或根本不可能实现的交付技术。”
他还指出,新的核酸酶可以有不同于Cas9的PAM要求,允许更精确的DNA靶向,或更少的脱靶效应。
他指出:“真正令人兴奋的是,我们已经识别出具有增强靶向能力的核酸酶,因此你可以靶向基因组中更多的地方,但这并不以有更多脱靶为代价。”“它不只是在基因组的任何地方,这就是为什么你可以瞄准更多的地方。你可以鱼与熊掌兼得。
马丁说:“在这方面,我认为这从根本上回到了我们的战略,即开始通过各种宏基因组数据进行公正的搜索,真正寻找新的CRISPR或类CRISPR蛋白质。”“当你有这种作为你开发的起点时,你就可以真正开始构建具有这些真正有趣功能的蛋白质,你不会拆东墙补西墙,这是你必须做的事情,当你从Cas9开始做标准的蛋白质工程时,你想瞄准更多的地方,但可能会得到更多脱靶效果。”
由于该公司预计将从蛋白质发现和鉴定管道中持续获得明显的好处,Mammoth计划将最近筹资的部分收益用于继续和扩大这项努力,然后寻求与Horizon类似的合作伙伴关系,以找到使用他们可能发现的核酸酶的最佳方法。
“(CRISPR蛋白质发现)是我们世界上最擅长的。我认为我们将继续如此,”马丁说。“与Horizon这样的公司合作,或者我们将在未来几年内宣布的其他合作伙伴合作,真的让我们能够真正实现这一战略,因为作为一家初创公司,我们不可能独自将产品推向所有这些不同领域的市场。Horizon交易令人兴奋的地方在于,他们是这个领域的世界领导者,而我们在这方面还不是专家。”
Martin补充说,Mammoth并没有与其他公司展开进一步合作的具体时间表,但他指出,该公司正在与诊断和治疗领域的公司进行积极的对话。
该公司还计划将刚刚筹集到的部分资金用于继续开发其疾病检测平台,并将其推进临床试验。