纽约——单细胞技术公司正在利用本周美国人类遗传vwin德赢ac米兰合作学学会的虚拟会议来展示大大增加实验规模的新产品。
周三，华盛顿大学的分支机构Parse Biosciences开始商业化基于分裂池连接的转录组测序vwin德赢ac米兰合作科技公司宣布了一种新的试剂盒，可以一次从多达100万个细胞中制备转录组。Evercode Mega套件可以一次处理多达96个样本，使用组合索引技术。vwin德赢ac米兰合作和它之前的产品一样，该试剂盒与固定样品一起工作，在加工前可存储长达6个月。
在一次由10x基因组公司赞助的演讲中，陈思思，贝克曼研究所单细胞分析和细胞工程试点中心主任在加州理工学院，他提供了一个8万个细胞实验的分析，该实验使用了新的高通量分析铬X今年夏天发布的一种仪器也可以一次处理100万个细胞。在另一场演讲中，10x的首席现场应用科学家萨拉·帕森斯(Sarah Parsons)展示了一组公开的数据集，其中包含约24000个细胞，也是从Chromium X的高通量试验中获得的。
公司表示，规模的扩大将有助于降低每个电池的准备成本。每电池10倍索赔铬X的成本可以低至美元。，而Parse估计每个单元格的成本不到$。02美元，相比之下是美元。每个细胞配备10万个细胞套件。
“它改变了我们可以做的实验类型，”纽约基因组中心和纽约大学的单细胞基因组学专家拉胡尔·萨提亚(Rahul Satija)说，他使用过10x和Parse的产品。“即使我们一个实验不需要一百万个细胞，我们很可能总共需要一百万个细胞。”
随着单细胞基因组学的不断发展，扩大规模和降低成本变得越来越重要。”每个电池的成本是一个重要的指标。”“甚至在一年前，我们可以通过充足的资源来分析100万个细胞。限制并不在于你不能这么做，而是成本太高。”
解析创始人之一首席执行官Alex Rosenberg表示，公司直到本周才告诉客户Evercode Mega工具包将推出，但客户已经告诉公司他们想要它的功能。
＂客户一直在告诉我们，‘我们计划做这些更大的产品，’”他说。“这是我们一直在与他们进行的对话。”
一些研究人员甚至开始“入侵”现有产品，以提高每次运行可能产生的细胞数量。今年6月，奥地利科学院的研究人员发表一个方法使用组合索引和10x铬的液滴超载，一次获得100万个单细胞转录组。
10x的一位发言人在一封电子邮件中说，该公司在Chromium X运行时，每次运行的电池数量超过50万个。自8月以来，该仪器和高通量分析已经发货，客户正在使用它们生成数据。
更大的实验意味着新的实验类型。罗森伯格说，一百万个细胞可以检测到非常罕见的细胞类型。此外，研究人员“正在意识到需要做更多的重复。扩大样本和细胞规模可以产生更可靠的结果，”他说。
萨提亚强调，有用的不仅仅是在每个样本上运行更多的细胞。“我们不仅想从一个样本中获得100万个细胞;我们可能还想分析来自100个不同捐赠者的样本，或者来自多个时间点的样本。”
尤其对于Parse套件来说，处理固定单元格的能力可以提供优势。萨提亚说:“当研究几十个样品时，它们可能不会完全同时准备好。”有了Parse套件，他的实验室可以等到有足够的数量来证明使用更大的套件是合理的。“这给了我们很大的灵活性，”他说。
萨提亚指出，他对自己的第一轮“印象非常深刻”解析100000细胞工具包“无论是从我们能够分析的细胞数量，还是从我们接收到的每个细胞的数据质量来看。”他对Parse的低双重率也很满意。新的Evercode Mega套件为100万个单元提供3.2%的双重率。Satija也在使用X铬和高通量分析。
但单细胞研究的唯一趋势并不是变大。Parse还将提供一个准备大约10,000到20,000个单元格的“迷你”工具包。这里的目标客户是单细胞基因组学的新手，他们可能不愿意投入到更大的实验中，或者是有经验的研究人员，他们只是想在实验进行之前进行试点。