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ASCO主持人鼓吹比较基因组学与狗,海狮模型作为癌症线索的来源

芝加哥(GenomeWeb)——研究人员正在继续扩大用于研究各种癌症遗传基础的动物模型,与会者在本周末的美国临床肿瘤学会年会上获悉。

作为进化、医学和癌症会议的一部分,北卡罗来纳州立大学基因组学研究员马修·布林描述了他的团队进行比较肿瘤学研究的基本原理,重点介绍了对狗和海狮膀胱癌进行分子研究的结果。

长期以来,研究人员一直依赖小鼠模型来研究癌症。但布林指出,实际上,小鼠自发癌症的发病率相对较低,因此在对其进行研究之前,必须通过基因操纵或其他策略来诱导疾病。

相比之下,他解释说,越来越清楚的是,其他动物——包括家养狗——确实会自发发生恶性肿瘤,可能是通过类似于人类疾病的途径。

布林指出,狗也和它们的人类同伴一样暴露在同样的环境中,这暗示着美国家庭中大约8300万只狗可能会帮助寻找与人类疾病相关的癌症相关基因和相关环境因素。

事实上,几乎所有发生在人类身上的癌症都在狗身上出现,布林说。一些品种特别容易患某些类型的癌症,这表明可能存在遗传性癌症易感性序列,可以在狗的研究中剔除。

在一篇发表于公共科学图书馆遗传学例如,今年早些时候,布林和来自美国和瑞典的同事描述了一项全基因组关联研究的发现未发现免疫相关位点与金毛猎犬的犬b细胞淋巴瘤和血管肉瘤有关,金毛猎犬患血癌的风险分别为6%和20%。

同一团队的成员在狗的基因组中检测了几十个位点与遗传性骨肉瘤有关通过另一项GWAS报告,在灵缇犬、罗特韦尔犬和爱尔兰猎狼犬中发现基因组生物学2013年12月。

狗也一直是其他癌症相关研究的焦点。2013年的一项研究中《公共科学图书馆•综合》, Göttingen大学和Chronix生物医学的研究人员强调了使用液滴数字PCR的可能性选择染色体断点从狗血液样本中提取的循环无细胞肿瘤DNA与犬乳腺肿瘤相吻合。

在ASCO的演讲中,Breen首先描述了一项关于慢性髓系白血病的分子细胞遗传学研究的发现,该研究发现了狗的BCR和ABL基因之间的融合,类似于人类中引起aml的经典“费城染色体”。

他指出,不仅所有的犬类CML肿瘤都包含BCR-ABL融合,而且患有CML的狗似乎对用于治疗人类疾病的酪氨酸激酶抑制剂类型的治疗有反应。

布林还讨论了一项膀胱癌研究,该研究从狗开始,最终在海狮身上得到验证。

在那里,他和他的同事们复制了患有移行细胞癌(TCC)或尿路上皮细胞癌的膀胱癌狗的数量分析,每年有数百万只狗被怀疑患有这种癌,但仍然很难诊断。

为了更好地了解这种膀胱癌的人类形式,并在狗身上开发基于尿液的疾病分析方法,该团队确实复制了犬TCC病例的数字分析。

不过,研究人员并没有将他们的分析局限于狗的染色体,而是将狗的序列与携带相应同源序列的人类染色体排列在一起。

在对狗的数据进行“重新编码”后,布林解释说,在狗基因组中第13、19和36号染色体上发现的膀胱癌相关的增益、损失和放大,与人类尿路上皮癌相关的拷贝数变化一致或相似。

为了排除这些地点之间的巧合重叠,研究人员转向了另一种动物:加州海狮。

布林解释说,每年有数百只海狮被冲到该州的海岸上,最终生活在海洋中心,在那里,很大一部分动物患上了非常严重的泌尿生殖系统肉瘤。

他说,对这些海狮肿瘤的拷贝数测试再次发现了得失,当重组到与人类染色体模式相匹配时,大致对应了人类和狗膀胱癌的拷贝数变化特征。

在这些结果的支持下,布林和他的同事们现在正在狗和其他动物身上开发额外的DNA和RNA资源。

Breen是犬类比较肿瘤学和基因组学联盟的董事会成员,也是海狮癌症联盟的特许成员。他还指出了通过国家癌症研究所的比较肿瘤学项目参与比较癌症研究的机会。

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