纽约- Caris生命科学公司希望一份新的出版物有助于更广泛地采用其今年春天推出的化疗个性化算法MI FOLFOXai。
的预测该研究使用Caris公司592基因肿瘤分析面板的数据，旨在识别可能受益于FOLFOX联合抗vegf药物贝伐珠单抗(Genentech公司的Avastin)一线治疗的结直肠癌患者，而不是在这种情况下可用的其他化疗方案，如FOLFIRI或FOLFIRINOX，两者结合。
MI FOLFOXai在精准肿瘤学军火库中有些独特。大多数已开发的标志性基因组和分子工具都是在靶向治疗的背景下开发的:确定符合特定药物或药物类别的患者的伴随或补充诊断。
其他著名的精确肿瘤学分析有助于预测患者预后或对化疗反应的总体可能性，但很少提供一种方法来帮助医生选择使用哪种特定的化疗方案。
由于缺乏预测个体患者反应的方法，FOLFOX和FOLFIRI被认为在治疗晚期结直肠癌的一线疗效上基本相同。虽然FOLFIRINOX和FOLFIRINOX的结合已经证明可以改善无进展生存期，但这种双重打击与许多患者无法忍受的毒性和副作用有关。
所有转移性结直肠癌患者通常都接受两种治疗，或联合治疗，或根据副作用情况或其他临床问题决定先使用哪种治疗。
Caris公司几个月前推出了MI FOLFOXai商用产品，该公司总裁兼首席科学官David Spetzler本周表示新出版的在临床癌症研究将成为推动采用的关键。
到目前为止，使用该算法的主要是医生，他们非常了解该公司和预测器背后的数据。斯佩茨勒说:“现在我们有了出版物，我们实际上可以向[更大的社区]提供这些信息，他们知道这是经过仔细审查和彻底审查的，现在他们可以认真对待它。”他补充说:“我认为，(在未来几个月)我们将了解市场的接受程度，以及有多少人开始使用它，我们将看到会发生什么。”
在这项研究中，Caris的研究人员报告说，他们最初使用现实世界的证据数据集训练MI FOLFOXai算法，其中包括63名记录在案的FOLFOX获益增加的患者和42名获益减少的患者。五倍交叉验证表明，67个基因签名可以持续分离受益增加和受益减少的患者。
为了进一步验证预测因子，研究小组将其应用于另一组独立的真实样本:412名接受一线FOLFOX/BV治疗的患者和55名接受一线FOLFIRI治疗的患者。对于50例患者，该模型没有预测获益增加或减少，但在其余患者中，结果有显著差异。预计MI FOLFOXai获益较大的患者中位生存期为42个月，而预计获益甚微的患者平均总生存期仅为24.5个月。
当应用于55例一线FOLFIRI治疗的队列患者时，该标记也显示出良好的特异性。这些患者的生存曲线是基于他们预测的FOLFOX获益。换句话说，与FOLFOX获益较低的患者(中位数OS为34.4个月)相比，FOLFIRI获益较高的患者(中位数总生存期为18.7个月)的预后较差。
最后，研究人员使用来自TRIBE2试验的271个样本进行了第二次盲法验证。作者报告说，MI FOLFOXai除了35个个体外，其他所有个体都进行了呼叫。该算法可预测FOLFOX和FOLFOXIRI试验中含有奥沙利铂的两个组的OS。
“目前的护理标准是……大多数患者要么先接受FOLFOX或FOLFIRI治疗，然后他们再接受另一种治疗，”斯佩茨勒说，他反思了研究结果所暗示的效用。
他补充说:“我们并不是说不给予其中一种，我们只是说应该给予它们的顺序……我认为，考虑简单地对这两种化疗方案进行不同的排序(基于我们在研究中看到的)可以给患者延长寿命是非常了不起的。”
今年5月，当Caris推出MI FOLFOXai时，它没有详细说明任何计划，可能将预测器扩展到其他癌症类型，在这些癌症类型中存在类似的关于铂基化疗选择的决策困境。
但在最新发表的研究中，作者报告说，他们还研究了该特征在预测晚期食管癌和胰腺导管腺癌中含奥沙利铂方案的益处方面的潜力，再次使用了真实世界的数据。
Caris高级副总裁兼首席数据官吉姆·亚伯拉罕(Jim Abraham)说:“我们想知道为什么这种方法在其他地方行不通。”“结直肠癌到底有什么原因会让它只在那里起作用?”
亚伯拉罕说，迄今为止关于胰腺癌和食道癌的数据只是初步的。“我们并不是在进行临床验证……因为我们没有盲样本，但我们将这样做[而且]迄今为止所有的数据都表明，这是一个泛肿瘤白金预测器，”他说。
除了胰腺癌，该公司还积极关注卵巢癌领域，斯佩茨勒认为，在任何使用类似药物的肿瘤类型中，都可能有潜在的效用。
他说:“根据特定的临床环境，可能有也可能没有其他的标准治疗方案。”“但即使在没有这种情况下，如果医生知道这个病人对铂类疗法不太可能有良好的反应，而他们仍然可能不得不给他们治疗，只是为了遵守指导方针，他们可能会增加看他们的频率或频率，更加关注潜在的副作用，以便更快地将他们转移到二线治疗。”
对于结直肠癌，一项随机前瞻性试验将是理想的随访，以巩固MI FOLFOXai确实改善了患者的预后。但斯佩茨勒表示，道德问题排除了下一步的可能性。
“我们已经与不同的群体进行了大量的对话……这里有一个根本的问题……你必须有患者(我们的测试)说他们应该先接受FOLFOX，并故意让其中一半的人先接受FOLFIRI，他们有基本的知识和信念(基于我们目前的数据)，他们会因为这个决定而缩短17个月的寿命。作为试验的一部分，你实际上是在伤害病人。这是完全不道德的。”
相反，Caris创建了一个前瞻性的注册表，随着时间的推移跟踪患者以积累更多的数据，这将有希望足以让临床医生相信使用这种预测器会带来真正的好处。
该公司不需要克服的一个障碍是报销，因为MI FOLFOXai并不与Caris用于计算的综合肿瘤分析面板分开收费。
“这没有额外的成本……(因为)它来自已经批准的测试。因此，我们根本不会改变我们的报销策略，只是试图最大限度地提高医生和患者从我们的服务中获得的临床效用。”
然而，对于患者来说，他们必须真正获得测序，尽管在全面基因组分析的指导方针认可方面取得了进展，对下一代测序分析的监管许可增加了，以及由此产生的公共和私人付款人覆盖政策的制度，但这仍然是该领域的一个挑战。
展望未来，斯佩茨勒和亚伯拉罕表示，公司相信将能够利用其MI平台开发更多的精准肿瘤学工具。
“我们正在对每个患者进行全外显子组和全转录组测序，我们的想法是，我们将发现更多这样的基因，”斯佩茨勒说。
他补充说:“我们认为我们可以超越治疗选择，”他强调了该公司进行的研究，着眼于区分哪些患者会出现脑转移等特定类型的结果，以及FOLFOX/FOLFIRI利基之外的其他药物决策领域的可能性。
“干预肿瘤生长的过程，无论是通过靶向治疗、IO还是化疗，都是对一个非常复杂的系统进行修改。因此，我们对该系统的当前状态了解得越多，我们就能更好地选择适当的干预措施。”
“我们发现这种方法不仅适用于化疗，而且适用于IO, IO-化疗组合……目前还没有一种治疗方法能在患者群体中100%有效。”
最后，Spetzler补充说，Caris还设想了在治疗过程中连续使用或在多个时间点使用新分子标记的潜在效用。为此，该公司必须能够将其分子智能平台生成的特征转化为液体活检，这也是该公司目前正在研究的问题。