纽约——三项新的研究发现，液体活检可以帮助确定癌症患者可能最适合接受的治疗方法。
在一项研究中，圣路易斯华盛顿大学的研究人员检查了从尿液中分离出的肿瘤DNA是否可以预测哪些膀胱癌患者对化疗有病理完全反应，可能不需要根治性膀胱切除术。该团队还使用液体活检方法来区分恶性周围神经鞘肿瘤和良性前驱肿瘤。在另一项研究中，复旦大学上海癌症中心领导的团队研究了结合MRI分析血液样本中循环肿瘤DNA是否可以预测直肠癌放化疗患者的病理完全缓解。
这些研究都发现，基于液体活检的评估可以确定哪些患者可能从特定的治疗方法中受益。“这种方法的优点是它是非侵入性的，在未来可以应用于评估对新辅助治疗的反应，实现更好的个性化治疗，甚至可能帮助选择可以非手术治疗的患者，”WUSTL的Aadel Chaudhuri在一封电子邮件中说，他是其中两项研究的作者。
为一项研究发表在《公共科学图书馆·医学》杂志上Chaudhuri和他的同事使用深度测序的尿癌个性化分析(uCAPP-Seq)方法分析了42名局限性膀胱癌患者和15名健康成年人的游离DNA样本。这些样本是在患者接受根治性膀胱切除术之前收集的。
在这个队列中，38%的患者有病理完全缓解，而62%的患者有残留疾病，通过他们的手术样本来衡量。通过聚焦最小残留疾病基因组，研究人员从残留疾病患者的样本中发现了一组52个非沉默突变和17个沉默突变，该基因组包含49个经常突变的已知驱动膀胱癌的基因。MRD阳性检测与无病理完全缓解相关，敏感性和特异性为81%。此外，utDNA分析显示残留疾病最小的患者无进展生存期比无残留疾病的患者差。
此外，研究人员还发现，肿瘤突变负担可以从utDNA中推断出来，这表明基于尿液的肿瘤DNA分析可以通过识别可能接受膀胱保留手术的患者，以及识别可能受益于靶向或免疫疗法的患者，来帮助个性化膀胱癌治疗。
在一个独立的研究《公共科学图书馆·医学》杂志上Chaudhuri和他的同事还研究了细胞游离DNA的超低通全基因组测序是否可以区分恶性周围神经鞘肿瘤(MPNST)患者和良性前体疾病患者。MPNST是1型神经纤维瘤病癌症易感性综合征患者的常见死亡原因，但很难将其与良性前体丛状神经纤维瘤区分开来。
他们分析了14名MPNST患者、23名丛状神经纤维瘤患者和16名健康人的无细胞血浆样本。在此基础上，研究人员开发了一种分类器，该分类器使用全基因组拷贝数变化来估计来自肿瘤的细胞游离DNA的部分，然后可以以91%的特异性和75%的敏感性来判断患者是患有MPNST还是丛状神经纤维瘤。
据Chaudhuri说，这是“我们所知的第一次概念证明，我们可以通过液体活检无细胞DNA分析来区分遗传性癌症易感性综合征中的恶性肿瘤和恶性前病变。”
此外，通过连续进行这种分析，他们可以跟踪患者，并在影像学检查之前发现最小残留疾病，Chaudhuri补充道。
同时，复旦大学领导的研究小组分析了119例局部晚期直肠癌患者的血浆样本中描述的《公共科学图书馆·医学》杂志上他们的努力以评估循环肿瘤DNA是否有助于对患者治疗后复发的风险进行分层。目前，核磁共振被用于确定治疗反应，但根据研究人员的说法，它们预测完全病理反应的能力可以提高。
对放化疗有完全临床反应的患者可以采取观察和等待的方法，而不是接受标准的全肠系膜切除术手术。
研究人员分析了119例接受新辅助放化疗和全肠系膜切除术的局部晚期直肠癌患者的系列血液样本。他们对531份血浆样本中的422个癌症相关基因进行了深度定向面板测序。他们发现较高的ctDNA清除率与完全病理反应相关，在放化疗期间获得突变的患者有更高的可能性发生不完全病理反应。
研究人员注意到，大约一半被MRI误诊为具有完整临床反应的患者可以通过ctDNA信息进行准确分类。然后，通过将ctDNA数据与MRI收集的信息合并，研究人员开发了一个模型，可以更好地预测MRI单独的病理反应。
研究人员补充说，这可以帮助确定适合观察等待方法的患者，并指导有各种复发风险的患者的治疗。