欧洲肿瘤医学学会周二发布了一套指南，详细说明了如何将下一代测序作为常规临床实践的一部分。
除了讨论NGS在各种癌症类型中的应用外，指南还讨论了广泛的NGS是否应该取代设计用于测试单个基因或少数基因的小型小组。
虽然NGS已在许多癌症中广泛应用，以指导分子匹配治疗的使用，但大型多基因测序板的临床效用和成本效益取决于肿瘤类型以及靶向药物的有效性和可用性。新的指南发表于肿瘤学年鉴，重点关注导致全球死亡人数最多的八种癌症，以及常规NGS可能合理的其他癌症。
该论文的第一作者、法国古斯塔夫·鲁西大学的费尔南达·莫泽莱在一份声明中说:“这是一个科学学会首次就NGS的使用提出建议。”“我们的目的是，他们将统一关于如何将NGS用于转移性癌症患者的决策。”
为了达成共识，ESMO转化研究和精准医学工作组的成员使用了ESMO分子靶标临床可操作性量表(ESCAT)，该量表将分子靶标和各自的治疗分为四个级别。
使用这一排名系统以及特定癌症患者中每种基因组改变的患病率，作者评估了需要多少患者接受NGS来匹配单个患者的有效药物。他们还考虑了关于使用多基因测序的成本效益研究，他们指出这在已发表的文献中是缺乏的。
根据癌症类型常规使用NGS
在晚期非鳞状NSCLC中，建议常规使用基于RNA或dna的NGS检测ESCAT I级匹配的突变和融合。作者写道，基础广泛的NGS也可以常规用于检测低于I级匹配的变化，但只有在与付款人达成具体协议时，才能考虑测试与小小组的成本。ESMO仅在国家或区域一级存在决策系统时，才根据NGS结果建议使用超说明书药物。他们举了荷兰的例子药物再利用研究，或DRUP。
ESMO还指出，进行临床试验的研究人员应该使用多基因NGS，因为找到低水平ESCAT匹配可能对药物开发有价值。这一建议在非小细胞肺癌以外的其他癌症类型中也是一致的。
在转移性乳腺癌中，作者写道，“目前没有必要在日常实践中进行肿瘤多基因NGS。”他们解释说，体细胞检测不能完全替代生殖系检测来检测可操作的BRCA突变，而可操作的PIK3CA突变可以用基于聚合酶链式反应(PCR)的检测来检测。他们补充说，HER2检测可以用免疫组化(IHC)来完成。
对于转移性结直肠癌，这些建议指出了PCR和免疫组化检测KRAS、NRAS和BRAF I级突变的实用性——靶向治疗已经证明了有效性——以强调为什么常规的多基因NGS是不必要的。然而，作者写道，“只有在与标准技术相比不产生额外成本的情况下”，它才可以作为一种替代方案。如果进行广泛的检测，应包括NTRK融合检测，以及ERBB2扩增和微卫星不稳定性检测，免疫检查点抑制剂可能是一种选择。
对于晚期前列腺癌，建议支持常规NGS来评估PARP抑制剂可获得的国家的BRCA体细胞突变。作者写道，如果使用广泛的测试，也应该包括AKT抑制剂、DNA修复基因和MSI特征的测试，但只有在付费方认为具有成本效益的情况下，才应该使用更广泛的测试。
作者不推荐多基因NGS用于转移性胃癌、胰腺癌或肝细胞癌患者。他们写道，对于这些癌症类型，“廉价的标准方法”可以用于检测MSI或NTRK融合状态，其中免疫检查点抑制剂和TRK抑制剂分别可能提供益处。但是，对于临床试验和药物开发，鼓励使用NGS。
最后，基于I级ESCAT匹配的存在，常规多基因NGS推荐用于转移性胆管癌和卵巢癌，以及原发不明的癌症，尽管没有I级匹配。
此外，该指南推荐NGS用于宫颈癌、高分化和中等分化神经内分泌肿瘤、唾液腺癌、外阴癌和甲状腺癌的TMB检测。除了这些肿瘤类型之外，证据还不足以证明常规TMB检测是正确的。
关于几种TRK抑制剂对NTRK融合阳性癌症的肿瘤不确定批准，作者建议NGS只用于检测NTRK融合，在其他技术推荐的癌症中，NTRK融合的发病率非常低。vwin德赢ac米兰合作
最终，患者和他们的医生应该负责决定对一大组基因进行测序是否合适，作者写道，“在不增加公共医疗系统的额外成本的前提下，以及如果患者被告知获益的可能性很低。”