血液癌症早期检测公司Freenome宣布生物标志物发现协议这标志着其业务的重大转变。合作伙伴将使用Freenome的多组学平台开发方法，以确定弥漫性大b细胞淋巴瘤患者(DLBCL)最有可能对该制药公司的抗体-药物结合物loncastuximab tesirine (ADCT-402)治疗有反应。
尽管制药合作在各种基于组织和血液的组学平台的供应商之间很常见，但ADC项目是Freenome首次公开宣布的这类交易。此前，该公司只专注于癌症早期检测和筛查。
Freenome的首席执行官Gabe Otte坚持认为，公司转向更广泛的生物标志物发现领域不会阻碍其早期检测计划，但他表示，与ADC的交易不会是Freenome计划在未来一年宣布的唯一一笔交易。
奥特说:“这一直是我们的意图，但只是在正确的时间……所以，尽管这一直是我们计划的一部分，我们知道我们需要为它建立一个基础……而这个基础实际上是我们的多组学平台(和能力)来表征血液中的DNA、RNA和蛋白质，这些都是肿瘤和免疫驱动的。”
他补充说:“我们已经非常擅长控制变异，以及理解和结合免疫信号和肿瘤信号来了解(癌症)的各个方面。”
与ADC合作，Freenome将解决一种尚未成为生物标志物和伴随诊断成果典范的癌症类型。该制药公司目前正在评估ADCT-402在复发或难治性DLBCL患者中的关键II期临床试验。奥特表示，这一领域与Freenome的早期检测工作没有任何直接的协同作用，但它确实为该公司提供了一个展示其平台力量的好场所。
最近，其他一些对DLBCL患者反应进行分层的努力都取得了令人失望的结果。例如，Celgene和NanoString之间的一项合作——利用该公司的基因表达平台根据细胞来源特征来那度胺(Revlimid)治疗的患者的亚型——在去年年底未能达到其主要终点。
也就是说，ADC的抗体-药物结合物与Celgene的化合物属于不同的类别，尽管Otte没有详细描述Freenome计划捕获什么信号来对患者对ADCT-402的反应进行分层，但他表示，该公司相信其技术具有独特的潜力。vwin德赢ac米兰合作
Otte表示，Freenome公司已经开发出了一些策略，包括测量“免疫细胞与肿瘤接触时的分子生物学变化”，该公司认为这些策略特别有助于回答ADC希望解决的问题。
奥特补充说，尽管以这种方式扩展到晚期癌症的精确肿瘤学领域，Freenome仍计划在早期检测竞赛中保持势头。如前所述，该公司最初的目标是结肠直肠癌，但它相信其技术最终可以支持多种癌症类型的筛查。vwin德赢ac米兰合作
Freenome并不是唯一一家瞄准结直肠癌的公司。比如，Guardant Health也有把索赔今年5月，该公司表示将开始对1万人进行前瞻性试验。其他人也一直在收集特定的crc数据集，即使他们保持对泛癌症的关注。
据奥特说，那1.6亿美元提出了在上个月在B轮融资中，辉瑞已为开展自己的前瞻性试验做好准备，这将为提交给美国食品和药物管理局(fda)以及美国联邦医疗保险和医疗补助服务中心(Centers for Medicare and Medicaid Services)的平行审查做好准备。
这项研究看起来很像支持FDA批准Exact Sciences公司的Cologuard的DeeP-C试验，这是一种基于粪便的筛选试验，Freenome和其他公司现在希望用血液测试取代它。
Otte说:“血液检测的结果将与结肠镜检查的结果进行比较，以评估其敏感性和特异性。”
奥特说，尽管该公司多组学方法的完整数据要到明年才会公布BMC癌症上周Otte说，这说明了该公司的机器学习发现方法在定义肿瘤和免疫相关信号方面的力量，这些信号可以标记早期肿瘤的出现。
由于专注于CRC早期检测，Freenome一直面临单一检测方法的发展。在将其平台应用于药物开发的过程中，该公司现在打开了各种配套诊断应用的可能性。
与那些带着已确定的检测试剂盒或仪器进入生物标志物开发研究的公司不同，Freenome不营销或销售特定的诊断工具，因此它的发展道路是开放式的。
根据奥特的说法，Freenome并不认为CDx的开发与早期检测工作有多大不同。“该平台并不关心它是辅助诊断应用程序还是筛查应用程序。这实际上是关于解决问题的……灵敏度、特异性、成本和检测频率的最佳组合，”他说。
“在任何一种情况下，使用多组学引擎，你都可以针对一个特定的问题抛出一系列不同的分析对象，但如果你不知道如何使其具有成本效益……你就没有解决方案。”
“一旦你知道你在寻找什么，无论是通过PCR或elisa，还是通过一些可以做的分析……有很多方法可以解决下游的问题，”奥特说。“不过，我们没有低估这有多困难，”他补充说。“我们知道这是一条漫长的路。”