纽约-根据一项新的研究,ATM基因可能导致黑色素瘤易感性,因为它的功能丧失变异赋予了中等的疾病风险。
ATM中的种系变异与许多癌症的风险有关,虽然ATM中的snp与黑色素瘤风险有关,但ATM对黑色素瘤易感性的影响尚不清楚。ATM编码一种活跃在DNA损伤反应中的蛋白质,并被DNA双链断裂激活,包括由紫外线辐射引起的损伤。
利用来自美国、澳大利亚和欧洲22个地点的数据,来自genome和MelaNostrum财团的研究人员研究了ATM变异在黑色素瘤患者中的患病率,并与对照组进行了比较。正如他们在医学遗传学本周他们发现,与对照组相比,功能丧失的ATM变异在黑色素瘤队列中更常见,意义不确定的变异在较小程度上也更常见。
ATM作为黑色素瘤易感性基因的鉴定可能具有临床益处。热热亚大学的共同高级作者Paola giorzo和她的同事在他们的论文中写道:“在个性化医疗时代,DNA损伤修复基因是新型癌症治疗的有希望的靶点。”他们指出,PARP抑制剂被用于治疗brca1 /2阳性的乳腺癌、卵巢癌和胰腺癌,最近还用于治疗阉割抗性的atm缺陷前列腺癌。
在他们的回顾性分析中,研究人员收集了2104名不相关的皮肤黑色素瘤患者的种系ATM状态,包括家族性、多发性原发性和散发性黑色素瘤。这些个体通过面板、外显子组或基因组测序进行ATM基因分型。作为对照,研究人员使用了来自基因组聚合数据库的64,603名非芬兰欧洲血统的人的数据。
经过筛选,队列中有超过1000个独特的ATM变异,包括156个功能丧失变异和848个VUS。ATM功能丧失变异在队列中约1%的黑色素瘤病例中存在。
尽管如此,患有黑色素瘤的个体更有可能具有被归类为功能丧失变异或VUS的变异。特别地,他们发现LOF变体在他们的黑色素瘤队列中发现的可能性是gnomAD对照组的2.6倍,在家族性或多发性原发性黑色素瘤患者中甚至更丰富。
VUS也与黑色素瘤相关,尽管程度较轻。基于他们的两个研究中心提供的病例对照数据,研究人员同样注意到黑色素瘤患者中功能丧失变异和VUS的增加。
此外,家族数据发现ATM变体在29个家族中共分离,在9个黑色素瘤家族中部分分离。
研究结果表明,ATM可能是黑色素瘤的中等风险基因。Ghiorzo和她的同事们写道:“ATM在黑色素瘤发展中的意义是最近才发现的,但ATM/ATR通路在应对紫外线诱导的复制应激时的激活已经被记录在案。”“因此,这一途径的缺陷激活可能导致恶性转化,如果是这样的话,ATM外显率可能由紫外线照射和/或其他遗传性黑色素瘤易感性因素的共同存在所调节。”
研究人员进一步指出,这项研究是研究ATM和黑色素瘤的更广泛努力的一部分,该研究还旨在研究罕见的错义变异对黑色素瘤风险的贡献,并梳理ATM变异如何在功能上促进黑色素瘤的发展。