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Inivata发布非小细胞肺癌液体活检的分析验证

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液体活检公司Inivata发布了其InVisionFirst-Lung测试的分析验证,这是一种靶向测序分析,可以检测肺癌患者血液中的突变,帮助医生决定用哪种药物治疗他们。

研究结果于本月公布《公共科学图书馆•综合》,说明该测试的分析性能很强。它可以在低频率、高特异性和高一致性的数字PCR检测结果中检测到突变。

因为在一个血液样本中,可能只有少量的突变癌症DNA,而有大量的正常DNA片段背景,所以液体活检检测需要高灵敏度,这可能会成为测试在不同领域的临床应用中开始竞争的一个区别点。

InVision是基于一种叫做vwin德赢ac米兰合作有针对性的扩增子测序(tamseq),由Tim Forshew和Muhammed Murtaza开发,并于2014年从剑桥大学Nitzan Rosenfeld的实验室分离出来。

Inivata目前的检测是针对非小细胞肺癌的,这正成为肿瘤学家在临床实践中开始采用液体活检的第一个领域。

这也是FDA批准将液体活检测试作为辅助诊断的第一种癌症类型——罗氏基于血液的Cobas EGFR突变测试v2。

然而,一些临床医生和临床研究人员注意到最近几个月,他们开始避免使用罗氏检测,而是使用其他使用数字PCR或下一代测序的检测方法,因为它们比罗氏试剂盒具有更高的灵敏度,或者因为它们允许对不同的改变进行多重分析。

Inivata的分析验证出版物强调了这些临床医生所面临的困境,不仅是关于评估fda批准的罗氏试验的竞争对手,而且可能是在越来越多的可用平台之间进行选择。

在报告中,Inivata写道,InVision在检测变异等位基因分数在0.25%到0.33%之间的单核苷酸变异时,表现出超过99%的灵敏度。在0.25% VAF条件下,对吲哚类药物的灵敏度超过92%。

根据Inivata首席执行官Michael Stocum的说法,这些数据优于其他液体活检平台在类似评估中的表现。

为了得出他们的结论,该公司的研究人员分析了近1000个样本,包括从非小细胞肺癌患者和健康志愿捐赠者收集的临床样本,以及设计用于代表广泛的遗传畸变和VAFs的人工样本。

重要的是,即使在VAFs越来越低的情况下(降至0.06%),研究人员报告说,他们仍然可以检测到超过一半的snv。

这一点很重要,因为Inivata试图用更多的证据来支持这些结果,证明测试的临床有效性,或者该测试在未来应用于真实患者样本时的表现。如果该公司不仅要将该测试推广到晚期非小细胞肺癌患者的分层,而且要推广到其他适应症,如在药物治疗期间或在早期患者手术后监测肿瘤DNA的存在,这也是至关重要的。

Stocum在上周的一次采访中表示,Inivata的临床验证研究始于2016年秋季,现在已经完成,这是去年秋季提交给医疗保险承包商Palmetto MolDx项目的一份文件的核心。

他说:“我们期待并希望这一进程取得积极成果。

为医疗保险患者提供InVision保险显然将支持Inivata进军诊所,并帮助其与Guardant Health等竞争对手保持同步当地覆盖决定草案还在等待最终定稿。

基因组健康退出从本月的NGS液体活检竞赛中,突显了基于小组的检测在说服临床医生其实用性方面面临的障碍,Stocum说,Inivata相信,至少在肺癌方面,医生有越来越强的理由转向综合检测而不是单基因检测。

随着效用问题的解决,Stocum说,有效性将成为临床应用竞争中更关键的因素。

基于其验证,Inivata对其在分析效度方面的竞争能力充满信心,他补充说,尽管“这将需要时间和市场利用率来观察如何发挥作用,以及哪种测试是最有效的。”

在某种程度上,美国食品和药物管理局(fda)的批准是临床医生了解一项医学检测在分析上是否有效的捷径。但随着实验室开发的检测在fda监管之外运行的兴起,癌症领域的情况发生了巨大变化,肿瘤学界在是否使用fda批准的罗氏Cobas EGFR检测、转向其他方法、甚至采用更广泛的NGS专家组方面存在分歧,这一事实证明了这一点。

Guardant Health是目前NGS液体活检公司中第一家宣布计划通过FDA的公司,该公司最近表示,其Guardant360测试获得了加速访问路径指定。

据Stocum称,Inivata目前还不能公布任何这方面的计划,但它正在考虑其他方案。

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