芝加哥——Massive Bio上周推出了一项雄心勃勃的计划,将应用人工智能来改善癌症患者的临床试验匹配。
这家总部位于纽约的生物信息学公司表示,他们希望通过名为“100K癌症临床试验奇点计划”(100K cancer clinical Trial Singularity Program)的项目,让10万人参加临床试验,以加速研究,改善全球癌症患者的治疗结果。
“奇点”是科技界的一个术语,描述的是一种假想的未来状态,在这种vwin德赢ac米兰合作状态下,超越技术的融合创造了一个新的现实。
他说:“我们正试图用这个东西在我们目前所在的地方创造指数变化。《Kurnaz,Massive Bio的联合创始人兼首席执行官。“为了提高入学率,你不能做同样的事情,却期望得到不同的结果。”
据Kurnaz说,该项目的主要目标是让Massive Bio尽可能早地“接触到”新诊断为晚期癌症的患者,以确定试验方案,然后为患者和他们的肿瘤医生提供所需的信息,以便他们在知情的情况下做出是否参加的决定。他说:“你越早发现这些患者,越早开始对临床试验进行教育和认识,就会取得更好的结果。”
库尔纳兹表示,该项目是Massive Bio重新思考试用招聘的方式。他说:“我们正在为一个临床研究问题带来工程层面的解决方案,而不是一个临床研究层面的解决方案。”
库尔纳兹补充说:“这个系统存在缺口。在这个新项目中,Massive Bio希望与新诊断的患者互动,为他们进行测序,并教育他们进行临床试验,同时协调下一代测序实验室和社区肿瘤学家之间的工作流程。
Massive Bio并不是唯一一家试图解决这个问题的公司。
数字健康初创公司TrialJectory最近通过一项研究发现对美国癌症患者的调查虽然大多数人都了解使用基因检测指导治疗决策的重要性,但只有不到一半的人在治疗过程中进行过NGS检测,以确定可操作的生物标志物。该公司一直在探索与诊断公司的合作关系和其他策略,以帮助患者获得NGS检测。
另一家创业公司Science 37也是如此帮助罗氏它的癌症基因组学检测子公司Foundation Medicine招募患者参加试验,而礼来公司与一家名为Care Access的公司签订了类似服务的合同。
自2018年以来,Massive Bio一直在建设一个全球临床试验匹配注册该公司将AI应用于基于基因组生物标记物和多变量分析的患者匹配。今年早些时候,Massive Bio推出了所谓的“nasa式”指挥中心,用于肿瘤临床试验的快速启动和患者登记。
Massive Bio有一个患者联系中心,可以直接获得试验候选人,还可以通过癌症中心、医生实践、NGS供应商、专业药店和付费预先授权单位识别患者。
“100K癌症临床试验奇点计划”(100K Cancer Clinical Trial Singularity Program)试图将这些服务和技术提升到另一个水平,并vwin德赢ac米兰合作专注于一个特定的目标,尽管库尔纳兹称10万是个随意的数字。库尔纳兹预计在未来两年内实现这一目标。Massive Bio在12个国家有业务,预计到2022年底将增加7个国家,将在全球招聘。
库尔纳兹表示,Massive Bio喜欢谈论“患者登记价值链的‘亚马逊化’”,这意味着数据和情报在后台流动的大规模自动化,在前端呈现无缝的用户体验。“这个项目是向世界临床研究展示规模和效率的一种方式。”
被广泛引用的2016年研究美国临床肿瘤学会的一项研究发现,只有不到5%的成年癌症患者参加了与他们癌症相关的临床试验,尽管有接近20%的人符合条件。
Kurnaz说:“这并不是说你可以一夜之间登记20%的病人。”“但我相信,像我们这样疯狂的人不得不说,这是可行的。”
该项目最初将包括宫颈癌、乳腺癌、前列腺癌、胃癌、胃食管交界处癌和胰腺癌,以及非霍奇金淋巴瘤、骨髓纤维化、中枢神经系统肿瘤、黑色素瘤、多发性骨髓瘤和各种儿童肿瘤。
根据Kurnaz的说法,对Massive Bio来说,专攻肿瘤学是很重要的,特别是在社区癌症中心和诊所,它们需要最多的支持,而且并不总是与分子实验室有关系。
阿图罗洛亚-Bonilla联合创始人兼首席营销官通过电子邮件表示,“100K癌症临床试验奇点计划”旨在将需要NGS生物标志物检测的患者与测序实验室连接起来,并将这些患者与基因组驱动的临床试验相匹配。loaisa - bonilla表示,Massive Bio正在通过该公司的SmartTrials研究服务与Foundation Medicine进行协调,同时还与Guardant Health、NeoGenomics和Caris Life Sciences等公司建立了关系,以协调信息交换。
库尔纳兹说,如果患者已经进行了测序,并同意加入试验池,Massive Bio就能够到分子实验室以电子方式检索测试结果,然后将数据集成到试验预筛选过程中。对于尚未进行检测的患者,该公司可以为他们提供当地NGS服务提供商的选择。
库尔纳兹说:“社区中的许多做法可能不一定有正确的工作流程,以使这些患者得到检测。”“从这个意义上说,下一代测序工作流程是我们战略的重要组成部分。”
这位Massive Bio首席执行官表示,他的公司不会因为选择一家NGS供应商而获得补偿。
库尔纳兹说,如果没有正确的生物标志物和临床数据,医疗保健提供者可能最终只能从ClinicalTrials.gov上获得十几个可能的试验选项,而没有一个很好的机制来确定哪个是最合适的。不过,ClinicalTrials.gov是一个静态数据库,往往比该网站列出的研究实际情况落后数月。
Massive Bio利用它的预筛选数据来帮助缩小这样的列表,并向治疗的肿瘤医生和患者提供一个更易于管理的最合适的选择列表。当然,患者没有注册的义务,但公司希望确保他们做出明智的决定。
库尔纳兹说,到目前为止,Massive Bio已经通过其联系中心确认了3.3万名患者,这还不包括通过供应商和其他企业渠道增加的患者。然而,他指出,患者接触的及时性至少与数量同样重要;试验发起者希望积极接受癌症治疗的患者。
库尔纳兹表示,Massive Bio正试图将自己定位为一个试验性配对中心;他看到过许多案例,多个合同研究机构来到公司,帮助完成同一项临床试验。该公司希望通过与患者维权组织、支付方和专业药房等建立合作关系来增加招聘,同时希望避免许多陷阱
一个具有里程碑意义的2017年研究来自纪念斯隆凯特琳癌症中心的研究人员发现,大约37%的接受测试的患者的癌症中有临床可操作的突变,但是,根据Neha范德比尔特大学医学院的癌症基因组学研究员Jain说中心在美国,许多突变不符合美国食品和药物管理局(fda)的立即免疫治疗试验注册标准,因此需要从非分子来源获得额外的合格证据。
杰恩是第一作者研究今年早些时候发表在临床肿瘤学杂志:临床癌症信息学该研究发现,仅使用患者的诊断和下一代测序数据将其与临床试验进行匹配的算法在88%的情况下产生了假阳性匹配。这些假阳性最常见的原因是有关试验的特定手臂注册状态的信息共享延迟和不连贯。
Jain称,Massive Bio在收集哪些试验实际开放的信息方面的合作,对于减少假阳性“可能非常重要”,但他表示,这只是第一步,因为试验登记就像试图击中一个移动的目标。她指出:“如果有新的辅助试验,那么你作为患者有资格参加的时间窗口期就非常短。”
尽管有许多依靠人工智能来改善试验匹配的努力,但Jain表示,100K癌症临床试验奇点计划之所以脱颖而出,是因为它规模庞大且雄心勃勃。
然而,Jain认为,这样的努力要想取得成功,不仅需要找到合适的患者和“非常好的患者数据模型”,技术系统还需要能够解析临床试验文件,而这些文件并不总是机器可读的。vwin德赢ac米兰合作最后一部分可能要求美国国家癌症研究所或其他资助机构对提交表格的语言进行标准化。
Jain也希望看到NCI在试验中去除一些冗余。“如果我们有无法填满所有试验的问题,那么开放这么多竞争性试验明智吗?”她想知道。