纽约-一项对高级别浆液性卵巢癌的多组学分析揭示了该疾病临床亚组间的分子差异。
根据美国国家癌症研究所(National cancer Institute)的数据，卵巢癌是一种常见且具有侵袭性的癌症，每年影响美国约22500人。它也表现出高度的肿瘤异质性和临床结果。
由德克萨斯大学MD Anderson癌症中心领导的研究人员分析了30名患有高级别浆液性卵巢癌(HGSC)的女性的肿瘤活检，其中一些人在手术后没有疾病的视觉证据，一些人对新辅助化疗反应良好，而另一些人对新辅助化疗反应较差。该分析表明，经过完全切除的肿瘤与其他亚组在分子上有所不同，而这些亚组之间的一些差异可以用于预测疾病反应。
MD Anderson的Anil Sood和他的同事在他们的论文中写道:“我们的发现提供了对HGSCs内异质性的理解。出现在周二细胞的报道．
在这项研究中，患者的肿瘤进行了腹腔镜评估，以确定是否可以完全切除(R0)并获得肿瘤组织。他们指出，原发性R0与更好的临床结果相关，尽管尚不清楚这是由于手术还是由于肿瘤类型适合手术切除。
他们收集了原发肿瘤组织和转移位点的组织，使用全基因组测序对其进行分析，平均体细胞覆盖率为118X，种系覆盖率为38X。他们还对这些样本进行了靶向深度测序、RNA测序、蛋白质组学和免疫分析。
在所有原发性和转移性样本中，最频繁突变的基因是TP53。然而，影响TP53的突变类型因肿瘤亚组而异。例如，接受新辅助化疗(NACT)的亚组更有可能出现无义TP53突变，而R0组则有错义突变。
其他改变因亚组而异。R0组约54%的肿瘤NF1拷贝数丢失，而NACT组NF1拷贝数丢失水平低得多，约18%。与NACT组相比，R0组NF1 mRNA和蛋白水平同样降低。研究人员指出，NF1可能是预测R0和NACT反应的一个标记。
与NACT亚组相比，R0亚组肿瘤表现出很强的结合新抗原特征。他们指出，这种新抗原特征与肿瘤免疫细胞浸润的增加有关。当他们检查肿瘤的免疫图谱时，研究人员发现，与NACT亚组相比，R0组表现出更多的浸润T细胞。相比之下，与R0组相比，NACT亚组巨噬细胞和B细胞增加。
同时，R0亚组肿瘤的发色率也低于其他亚组。此外，当这些肿瘤确实发生嗜色症时，它更有可能影响6号和19号染色体。相比之下，NACT亚组肿瘤的发色症更可能影响8号和17号染色体。
研究人员说，这些肿瘤亚组之间的差异可能会在未来指导患者的治疗。他们在论文中写道:“经证实，我们在这项研究中的发现——不同HGSC亚群之间的分子、蛋白质和免疫特征——可能增强对R0切除术的预测，并对HGSC患者的预后和治疗有意义。”