纽约-本周，Oncocyte公司增加了新的证据，证明它在其实验室中获得的det maio技术vwin德赢ac米兰合作收购Insight Genetics可以预测在越来越多的肿瘤类型中，哪些癌症患者可能对免疫检查点抑制剂(ICIs)有反应。
上周六，在美国癌症研究协会(American Association for Cancer Research)的年会上，该公司的研究人员分享了一项评估该公司膀胱癌检测性能的研究结果。数据还表明，27个基因表达评分可能识别不同的患者群体，而不是现有的免疫治疗生物标志物，如肿瘤突变负担。
根据Oncocyte的说法，膀胱癌(该公司针对的第三种肿瘤类型)的测试结果预示着该测试潜在的多癌症或泛癌症用途，类似于肿瘤突变负担(TMB)和微卫星不稳定/错配修复缺陷等生物标志物已经实现。
det maio测量了27个基因的表达，这些基因与影响免疫治疗敏感性和耐药性的肿瘤免疫微环境成分相关。然后使用专有算法对这些数据进行加权。
早期的研究已经证明，在接受四种美国食品和药物管理局批准的ICIs治疗的肺癌和乳腺癌患者中，该测试能够预测免疫治疗反应:pembrolizumab(默克的Keytruda)， nivolumab(百时美施贵宝的Opdivo)， atezolizumab (Genetech的Tecentriq)和durvalumab(阿斯利康的Imfinzi)。
在本周的AACR会议上，Oncocyte免疫肿瘤学主管Robert Seitz分享了他的团队对IMvigor210研究atezolizumab在转移性尿路上皮癌患者中的回顾性临床试验结果的前瞻性定义分析的新结果。
该研究队列包括119例被认为不适合铂化疗的患者，以及另外310例在铂治疗后进展的患者。尽管这两种适应症都获得了加速批准——前者适用于具有一定程度PD-L1阳性的患者，后者不需要生物标志物——但基因泰克最近主动撤回了第二个白金后的竞标。
Oncocyte团队在公开的348名试验患者的RNA-seq数据上运行了det maio签名，并将结果与这些患者两年的总生存期进行了比较。根据Seitz的说法，结果证明了det maio与结果之间的显著相关性，其“高度显著”的风险比为。612。
det maio确定的生存率提高的人群也相当大，占该研究中接受治疗的患者的41%。这组人平均存活了12.9个月，而那些测试呈阴性的人平均存活了8个月。
研究人员还能够使用该试验最初临床报告中发表的数据，以及后来在2018年发表的生物标志物分析中发表的数据，将癌细胞检测与其他生物标志物和生物标志物签名进行比较。
Seitz说，这些双变量分析的结果表明，det maio是独立于临床因素和这些替代生物标志物的，并表明它正在识别其他反应性患者，这些患者将被目前使用的测试遗漏，包括PD-L1和TMB。
TMB在这些统计比较中也保持了自己的独立性，这使得研究小组考虑这两个生物标志物是否可能在决策树模型中协同工作。
为了探索这一问题，他们将注意力集中在先前接受过铂化疗的试验患者的子集上，基因科技最近撤回了对atezolizumab批准的竞标。
对于这272例患者，det maio阳性和阴性患者的两年总生存风险比为。585，与整个队列非常相似。
Seitz和他的同事们假设了一个决策树设置，结合了det maio阳性结果或每兆酶至少15个突变的TMB，他们计算出他们可以确定一个代表近一半队列的改善生存组。
Seitz说，因为TMB单独使用时，只将研究中20%的患者分层到更高的生存曲线，因此加入det maio代表着显著的改善。
此外，观察双阳性患者(即det maio阳性和tmb高的患者)，在反应或生存率方面没有明显改善。Seitz补充说，这表明结合这两种工具的价值可能是将它们所识别的独特患者群体联合起来的结果，而不是识别携带这两种生物标志物的患者。
随着该领域努力寻找识别尽可能多的免疫治疗应答患者的方法，基因表达和RNA并不是唯一感兴趣的领域。其他的努力也在研究基因组特征，这些特征可以在TMB上分层，以捕获从这些药物中受益的其他群体。
例如，在同一届AACR会议的另一场演讲中，来自达纳-法伯癌症研究所的研究人员报告了他们对一组接受ICIs治疗的非小细胞肺癌患者的非整倍体水平的分析，得出的结论是，低非整倍体的肿瘤似乎具有独特的免疫微环境，对ICIs的结果更有利。
与Oncocyte用det maio观察到的结果相似，这种非整倍体方法提供的鉴别似乎也与PD-L1表达水平和TMB无关。
根据Oncocyte首席科学官Doug Ross的说法，该公司的膀胱癌数据特别令人兴奋，因为它说明了像det maio这样的工具可能有助于恢复失败的治疗指征。
他在一份声明中说:“随着时间的推移，我们期待着分享更多肿瘤类型的数据，并与生物制药公司和制药公司合作，以改善他们的试验结果。”
加州大学戴维斯综合癌症中心的医学肿瘤学家和助理教授Mamta Parikh在一份声明中进一步指出，考虑到最近铂难治性晚期膀胱癌患者自愿停用atezolizumab和durvalumab，基于随机III期研究的滞后疗效，Oncocyte的结果是“具有挑衅性的”。
“即使在这些研究中，”帕里克说，“仍然有患者受益于ICIs，并对治疗有持久的反应。因此，识别这些患者的生物标志物策略仍然是一个重大的未满足的医疗需求，并有可能解释在未选择的患者群体中缺乏疗效。”
她指出:“随着转移性尿路上皮癌的新治疗方法的出现，ICIs的更好的预测生物标志物作为一种手段变得更加重要，它可以识别那些可能受益于免疫治疗的患者，并免除那些不太可能受益的患者，以便他们可以使用其他活性药物进行治疗。”
到目前为止，Oncocyte围绕着DetermaIO所做的所有努力都是回顾性的，Seitz在演讲中表示，该公司的下一个数据将继续这一趋势，因为该公司正在与NeoTRIP试验的研究人员合作，完成对早期高危三阴性乳腺癌atezolizumab的回顾性数据的另一个前瞻性定义分析。
该公司还没有出售用于患者的测试，但已经在其CLIA实验室进行了验证，这将使其有可能用于药物试验。
在AACR演讲后的讨论中，默克公司转化肿瘤学副总裁亚历山德拉·斯奈德(Alexandra Snyder)表示，转录分析可以用来定义更有可能从检查点阻断中受益的患者子集，这一事实令人兴奋，但要将像det maio这样的特征“转化为可用于临床试验并最终应用于临床实践的测试”，仍然存在悬而未决的问题和障碍。
她说:“当治疗模式变化如此之快时，如何开发选择标记物是具有挑战性的……[以及]将从单一药物的回顾性分析中开发的生物标记物应用到正在进行的试验中。”
尽管Oncocyte希望它在多种肿瘤类型中不断增长的数据预示着泛癌症的效用，Snyder说，目前还不清楚哪些特征可能是肿瘤特异性的，哪些特征将是可靠的普遍的。
“正如最近关于TMB的争论所表明的那样，作为一个领域，我们确实在努力在开发泛癌症测试与适应证特异性测试的实际、监管和科学考虑之间取得平衡，”她补充说。