德国研究人员发现了两种亚型的胰腺癌，其中一种更具侵略性，但也可能容易受到靶向治疗的影响。
胰腺导管腺癌(PDAC)预后较差，5年生存率约为9%。为了研究这种导致大多数胰腺癌病例的疾病的突变格局，来自德国癌症研究中心(DFKZ)的研究人员从PDAC肿瘤和正常胰腺组织中提取出胰腺上皮细胞。
当他们在杂志上报道癌症的发现周四，研究人员发现，他们从患者身上分离出的肿瘤细胞根据甲基化模式分为两组。低甲基化的肿瘤也比高甲基化水平的肿瘤表达了不同的基因信号，其标志是干扰素信号的激活以及患者预后较差。这种低甲基化、高干扰素模式表明，这些肿瘤可能容易受到阻断干扰素信号的治疗，这表明可能存在靶向治疗。
来自DFKZ和海德堡干细胞技术和实验医学研究所(HI-STEM)的第一作者Elisa Espinet在一份声明中说:“基于肿瘤基因组的甲基化模式，我们能够定义两种完全不同的腺癌亚型，它们在致癌过程和侵袭性方面有所不同。”vwin德赢ac米兰合作
研究人员使用基于facs的方法从7例未经治疗的PDAC肿瘤患者的胰腺肿瘤和正常邻近组织中分离出上皮细胞，用于全基因组亚硫酸氢盐测序和RNA测序。与正常细胞相比，PDAC中有超过56000个DNA区域甲基化差异，肿瘤样本本身也根据甲基化模式分为两个簇。
转录组数据进一步强调了两个甲基化聚类(MC1和MC2)之间差异表达的320个基因，基因集富集分析指出，MC2样本富集IFN-ɑ和IFN-γ响应特征。
为了区分这两组，研究人员基于MC2中富集的IFN-ɑ和IFN-γ反应的基因开发了47个基因签名。研究人员指出，这种基因特征在PDAC患者的一个子集中高度表达，并补充说IFNsign高患者的总体结果明显更差。
当研究人员探索MC1和MC2样本之间甲基化的差异时，他们发现MC2细胞在重复重复元件、SINES和LTR/ erv周围的甲基化水平明显较低。根据他们的转录组数据，他们进一步发现LTR/ERV和line衍生转录本的表达增加，以及dsRNA反应和高IFN信号。他们在另外11名PDAC患者的样本中验证了他们的发现。
结果表明，甲基化的变化引发了一种病毒模拟反应，在这种反应中，肿瘤引发炎症反应，进一步刺激癌症生长。
但研究结果也表明，抑制IFN信号通路可能会破坏肿瘤生长。在小鼠模型中，研究人员发现，使用已批准的JAK/STAT抑制剂ruxolitinib治疗可降低干扰素相关基因的表达，并损害IFNsign的肿瘤生长高但不是IFNsign低细胞。
研究人员补充说，这建立了一个概念证明，即量身定制的IFN信号抑制可能有益于MC2 PDAC患者。来自DKFZ和HI-STEM的资深作者Andreas Trumpp在一份声明中说:“通过阻断不同部位的干扰素信号通路，我们能够显著减缓人类胰腺癌细胞转移到小鼠体内的癌症生长。”“然而，这些信号的调节是非常复杂的。我们现在正在寻找方法，不仅可以减缓肿瘤细胞的生长，而且还可以消除它们。”