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天堂基因寻求合作伙伴将基因表达谱转化为临床检测

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纽约-天堂基因公司已经退出了隐形模式,从全血样本中发现的细胞中确定高度准确的疾病特异性基因表达谱,现在正在寻求商业化合作伙伴,将这些“生物谱”转化为临床基于基因表达的诊断分析。

到目前为止,这家总部位于伊利诺斯州诺斯布鲁克的公司已经开发了乳糜泻、重度抑郁症(MDD)和双相情感障碍的生物图谱,并正在研究几种癌症、肠化生、注意力缺陷多动障碍、创伤后应激障碍和纤维肌痛的生物图谱。

该公司成立于2011年,选择专注于全血细胞,正如CSO和联合创始人斯科特·马格努森(Scott Magnuson)所描述的那样,“从实用的角度来看,血液在你的全身循环,它能立即‘看到’每种生理状态下的每种不同疾病。”

从本质上讲,这个想法是与疾病相关的细胞信号,如肿瘤细胞相关的血管生成因子,触发其他循环细胞的反应,这反映在基因表达的变化中。天堂公司的技术检测到这vwin德赢ac米兰合作些变化,并将其映射到相应的生理状况。

这种方法在诊断领域并不常见,尽管潜在的生物过程是相当众所周知的。

例如,过去的研究发现,全血基因表达谱与蛛网膜下腔出血的血管痉挛、树突状细胞对病原体的反应以及身体对败血症的反应等相关。

斯坦福大学(Stanford University)医学教授、肿瘤基因表达谱专家阿什·阿里扎德(Ash Alizadeh)认为,嘈杂的背景可能会成为这种方法商业开发的绊脚石。

“从我目前所看到的来看,”他说,“我认为这些基因表达谱信号的[信噪比]谱还没有表现出足够的稳健性,可以被认为是用于诊断的黄金时段。”Alizadeh也是远见诊断该公司正在开发用于早期癌症检测的液体活检测试。

Paradise的联合创始人兼首席技术官Michael Falduto解释说,这正是该公司取得最vwin德赢ac米兰合作大进展的领域。在内部研究中,Paradise使用了其表达分析方法,该方法利用安捷伦的全基因组微阵列,将疾病状态与健康细胞区分开来,准确度从95%到100%不等。这种提高的准确性主要归功于专有的样品制备程序,Falduto和Magnuson在他们早期的企业GenUs BioSystems中对其进行了改进,该公司仍然是微阵列服务提供商。

他说:“杂交是我们能够大大减少背景的地方。”他解释说,对样品制备的高度重视有助于公司发现过程的高度可重复性。

“然后在数据分析中,”Falduto补充说,“因为它是如此的可重复,我们真的能够找到那些在相当低的水平上表达差异的基因。”

尽管天堂的工艺是一个商业秘密,但法尔杜托和马格努森解释说,其中大部分都是对众所周知的工艺进行了改进。

Magnuson说,与标准RNA测序技术相比,低信噪比也使Paradise能够在更宽的动态范围内检测信号,这有助于其分析技术的准确性。

例如,Paradise声称其92-mRNA乳糜泻生物档案在对22名活组织检查呈阳性的乳糜泻患者和16名未受影响的对照组的研究中,100%准确地诊断了这种疾病。

该公司目前正在探索与“几家”公司合作,希望将乳糜泻生物特征作为实验室开发的测试。

马格努森说:“我们宁愿不让CLIA实验室把它作为一个LDT来运行,因为那会占用我们所有的时间。”

Paradise还开发了双相情感障碍和重度抑郁症的基因表达谱,并声称仅四种mrna的表达就足以区分这两种疾病。Falduto说,在这些mrna的表达水平低于一定水平时,该公司可以100%准确地识别临床确诊的双相情感障碍患者,尽管少数重度抑郁症患者可能仍低于阈值,并被评估为双相情感障碍。

尽管如此,在快速鉴别这两种症状经常重叠的疾病方面的任何改进,都可以节省几个月的测试和分析,并降低误诊和被开出次优药物的风险。

Falduto说:“它们是非常不同的疾病,有非常不同的治疗方法和非常不同的药物。”“因此,进行生物测试来准确诊断双相情感障碍的潜力将对医疗实践产生巨大的影响。”

目前,对双相情感障碍、重度抑郁症和乳糜泻的研究处于最成熟的阶段,Paradise正在寻找合作伙伴来帮助进一步开发和商业化这两种疾病。该公司还有其他几种新药正在研发中,包括几种癌症适应症。

法尔杜托说:“结肠癌、肺癌和胃癌在我们的准确性水平以及我们对这些癌症的早期诊断方面也表现出了很好的希望。”

尽管在癌症液体活检领域有大量的参与者,Falduto和Magnuson认为他们的方法使他们在提供的技术方面独树一帜。vwin德赢ac米兰合作

Falduto说:“没有人真正像我们在癌症诊断领域那样进行发现。”

例如,该公司发现了三种基因,法尔杜托和马格努森说,这些基因的表达可以用来诊断非小细胞肺癌,而这些基因以前不知道与这种疾病有关。

Paradise目前有7名员工,专注于生物档案的发现和验证。

马格努森说:“目前,出于资金原因,我们需要保持这种状态,但我们会尽我们所能增长。”

该公司由私人投资,目前已筹集约250万美元。Paradise预计会有更多的融资,但目前还没有具体的时间表。

天堂公司希望在未来两年内在市场上进行可行的测试。

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