纽约 - 一项新现象的关联研究发现，遗传性癌基因的致病变异可能会影响其他恶性，但也会影响非恶性特征。
国家人类基因组研究所和其他地方的研究人员说，检查与遗传性癌基因相关的其他表型可能会更好地理解疾病的病因和改善的治疗方法。
像他们报道周四JAMA肿瘤学，研究人员从214,000多人中进行了遗传和表型数据的Phewas，复制已知的基因 - 表型关联并揭示了新的基因。这些新的关联不仅与其他肿瘤状况有关，而且还与慢性胃炎或胰腺炎等其他一系列特征。
“这些研究结果表明，EHR数据集中的PPEMAS有可能扩大我们对遗传性癌症基因的病原和可能致病性变异患者的表型和疾病过程的潜力，”来自Nhgri和同事的高级作者Joshua Denny写在纸质中。
使用来自三个队列的数据 - 电子医疗记录和基因组学测序队列，英国Biobank和遗传性癌症登记处 - 研究人员在大约二十二个癌症相关基因和不同表型中检测了种系致病或可能致病变异的关联。分析包括BRCA1，BRCA2和PTEN等基因以及ATM，CHEK2和PALB等基因，并从参与者的健康记录中获取ICD-9-CM和ICD-10-CM代码作为表型。
通过他们的分析，研究人员证实了38个主要基因癌协会中的38个，以及在MAN数据库中在线Mendelian继承中记录的近70％的基因 - 表型关联。他们进一步确定了OMIM中的19个新关联，影响了13个遗传癌基因。
新型关联包括与其他肿瘤条件的新联系。例如，CHEK2中的致病性或可能的致病变异与白血病和浆细胞肿瘤均与ATM中的致病性或可能的致病变异有关，与胃癌和胰腺癌有关。他们还指出，MUTYH中的双质致病性或可能的致病性变异与肾癌有关。
同时，其他协会是非恶性条件。BRCA1和BRCA2在BRCA1和BRCA2中的病原或可能的病原变体与卵巢囊肿相关，而PTEN变体与慢性胃炎和MEN1变异有关的急性胰腺炎。研究人员注意到，在分析中除去具有先前癌症的个体后，研究人员举行了这些协会。
通过进一步研究参与者的电子健康记录和其他数据，研究人员发现其中一些关联可能源于潜在疾病的症状。例如，研究人员指出，RET和复视的致病变异之间存在联系，但建议双重视力可能是由于神经内分泌疾病在内，包括肿瘤。
Denny及其同事指出，还需要进行其他研究来确认这些新的关联。他们仍然说，他们的发现表明，Phewas可以帮助揭示与遗传性癌基因变体相关的其他表型。
在一个相关评论JAMA肿瘤学，来自克利夫兰诊所的Kailin Yang和Jacob Scott表示，这项研究的影响可能会扩展到其与遗传性癌基因中与致病性变异相关的表型的扩展。他们补充说，这项研究表明，可以通过整合测序和电子健康记录数据来收集新信息。
他们说，这种方法可以列入更多样化的研究参与者，他们说。超过一半的丹尼和同事分析的参与者是女性，尽管他们指出的是，包括非欧洲血统群体的群组，从21.9％到6％。
Yang和Scott补充说：“制定策略，使来自不同种族背景的患者参与其中，并将其应用于低收入和中等收入国家，将大大扩大Phewas对全球规模的影响。”