纽约 - 蛋白质组学分析已经发现了三重阴性乳腺癌的亚型，并突出了这些不同群体的潜在药物目标。
三阴性乳腺癌表现出高肿瘤异质性，转移性率和整体存活差。虽然以前对这种类型的癌症的研究重点是基因组和转录组变异，来自复旦大学和其他地方的研究人员现在已经分析了90名女性肿瘤和非癌症邻近组织的蛋白质蛋白质来检查肿瘤蛋白质景观。
他们报告了细胞报告周二，研究人员确定了四种肿瘤亚组，具有富集不同的途径或分子过程和不同的预期。它们同样进行网络分析和发现潜在的治疗靶标，例如NAE1和FASN / AKT1。
“我们的蛋白质组学工作延伸和深化了先前的基因组和转录组工作......通过显示TNBC的蛋白质在分子途径和网络的背景下互相互动的蛋白质，”来自北京的高级作者救生赛研究所在一封电子邮件中写道。“此外，由于蛋白质发挥了生物学功能的高管的作用，所以我们的多维蛋白质组的数据可以更容易地用作探索TNBC的生物标志物/药物靶标的蛋白质池。”
朱和他的同事分析了先前从90个个人收集的肿瘤和非癌症的邻近组织样本，为复旦大学上海癌症中心三重阴性乳腺癌（FUSCCTNBC）队列。样品接受了全蛋白质组分析，磷脂蛋白谱和DNA结合分析。
蛋白质组和磷脂蛋白酶数据的一致聚类揭示了四种亚型IP-1，通过IP-4，具有预后的差异。特别是，IP-2与最短的存活，最高淋巴结等级和最古老的患者年龄相关。
簇也具有明显的富集途径，因为IP-1高度富集用于细胞周期，DNA复制和伸长率和mRNA剪接途径，而IP-2富集用于雄激素受体信号和脂质代谢途径。同时，分别富集IP-3和IP-4分别用于免疫相关途径和细胞外基质相关途径。
亚型与先前定义的三阴性乳腺癌亚型重叠。例如，落在IP-1或IP-2中的大多数样本也在FUSCC BIS和Lar亚型和代谢MPS2和MPS1亚型中。然而，IP-4中的肿瘤，映射到不同的转录组和代谢亚型，表明转录组和蛋白质组之间存在一些分歧。
研究人员还与先前收集的基因组和来自群组的转录组数据结合进行三种蛋白质组学数据集的支架和共表达网络分析。在亚型IP-2中，它们发现AKT1作为治疗目标的高潜力，因为它可以磷酸化多种转录因子和激酶，包括FoxO1，MTOR和PRKCD。他们注意到AKT1抑制剂，如Capivasertib和Ipatasertib，在一些临床试验中据报道是对三阴性乳腺癌有效的。
同时，转录因子校长稳压因子的分析发现NEA1是IP-1内的签名蛋白，表明它可能具有治疗承诺。研究人员随后用NAE抑制剂MLN4924治疗人的三阴性乳腺癌细胞系，以发现细胞活力下降，否则具有高NAE1蛋白表达的细胞系。
这些发现可以帮助进一步研究参与三阴性乳腺癌的分子机制以及可能的药物靶标。朱镕基补充说，他和他的团队正在寻找合作伙伴或合作者，以帮助继续努力进入他们所确定的潜在药物目标。