纽约——Qiagen公司和Exosome诊断公司，一家位于明尼阿波利斯的子公司Bio-Techne该公司本周表示，他们正在开发一种新的工作流程，将数字PCR和基于外泌体的液体活检检测尿液样本中的膀胱癌突变。
两家公司预计将在今年6月的美国肿瘤学会(ASCO)虚拟会议上展示一项临床比较研究的完整结果，该研究使用工作流程检测尿路上皮癌患者的FGFR突变。
膀胱癌工作流程是Qiagen最近推出的临床应用类型的早期演示QIAcuity数字PCR(dPCR)研究-使用系统。
在周二举行的虚拟分子医学trii - con会议上，Qiagen公司数字PCR检测开发的高级科学家Ronny Kellner讨论了当前尿路上皮癌组织检测的障碍和新工作流程的计划。
Kellner在演讲结束后的一封后续邮件中说:“对于尿路上皮癌患者来说，细胞镜检查是一种需要麻醉的痛苦过程，通常会导致尿道损伤和出血。”“基于尿液的FGFR检测将消除采用障碍，并允许频繁的重新检测……并为监测肿瘤进展和随着时间的推移产生耐药性创造一个新的市场。”
Kellner表示，Qiagen公司的QIAcuity系统包含QIAcuity dPCR仪、纳米板、Evergreen和Probe PCR试剂盒，以及用于下游分析的软件套件。该系统将单个PCR反应分解为数千个单独“分区”内的更小的反应。在使用整合片段探针的分析的端点PCR过程中，只有包含目标的分区才会产生荧光信号。
Kellner在他的Tri-Con演讲中解释说:“使用正分区和负分区的数量，可以计算出分析体积中分子的绝对数量。”“这带来了几个优点，包括绝对目标量化、对抑制剂的更高耐受性、增加的分析灵敏度……以及更高的重复性。”
Kellner指出，分区、循环和成像在系统上都是完全自动化的，每个纳米板包含24或96个更大的孔，包含8500到26000个分区。他说，该平台在不到两小时内就能产生结果，每次反应可以可靠地检测和量化20万份拷贝。
Kellner指出，提出的工作流程将有助于解决Qiagen公司基于组织的一些挑战RT-PCR Therascreen FGFR试剂盒该公司用于识别尿路上皮癌患者FGFR2/3基因的改变，以指导Janssen制药公司的转移性膀胱癌药物erdafitinib (Balversa)的治疗。该测试涵盖了组织来源RNA的四个点突变和五个融合。
“Therascreen的工作流程很简单，但它也有一定的缺点，因为它依赖于侵入性组织活检，”Kellner说。“新的工作流程将结合基于外泌体的液体活检和数字PCR”
新的工作流程包括收集多达20毫升的患者尿液，而不是传统的福尔马林固定石蜡包埋组织。Exosome Dx的RNA分离工具用于提取外泌体RNA，并使用Qiagen公司的Therascreen FGFR RT-PCR试剂盒合成互补DNA。然后使用数字PCR Therascreen FGFR法分析样品。
为了进行比较，该小组将平行分析尿液样本Qiagen公司的Therascreen FGFR RGQ PCR试剂盒使用Qiagen公司的转子基因Q qPCR仪鉴定FGFR2/3突变患者。两家公司还将比较基于尿液的结果与传统基于组织活检的FGFR筛查结果。
Exosome Dx的科学总监丹尼尔·恩德尔(Daniel Enderle)在谈话中说，为了测试工作流程，公司设计了一项临床研究，将对大约50名尿路上皮癌患者进行研究。该团队将从德国分子病理公司Stratifyer的临床网络收集匹配的尿液和组织样本以及临床数据。
Enderle说，该团队将从患者身上收集5毫升至20毫升的尿液样本，并将其分为两个样本队列:一个使用Therascreen RGQ组织工作流程进行测试，一个使用基于尿液的外泌体RNA数字PCR工作流程进行测试。
Enderle说:“我们将[建立]组织活检与液体活检的一致性，我们也有FGFR3生物标志物表达的实验数据。”
虽然两家公司将在ASCO上展示该研究的全部结果，但Enderle提供了来自11名尿路上皮癌患者的试验性队列的初步数据。他指出，使用尿液外泌体RNA的初步研究数据“显示出有希望的结果”，与患者组织100%一致。
Enderle补充说:“我们在外泌体RNA中检测到的突变比在组织中检测到的多一些，但在更大的研究中观察它会更有趣。”
Qiagen和Exosome Dx扩大现有的独家合作和许可协议。
Kellner在邮件中说:“外泌体中可以包含泌尿系生物标志物这一事实促使我们进行了初步的可行性研究，以证明通过Qiagen公司的平台，结合外泌体分离和RNA纯化的新进展，我们是否可以检测和匹配取自同一患者的突变一致性组织。”“基于尿液的检测将有更高的采用率，并导致检测量的增加，这很可能会导致恶性病变的早期发现，并增加研究的报名人数。”
Kellner表示，Qiagen公司打算利用液体活检技术探索其他微创生物标志物分析方法。vwin德赢ac米兰合作
虽然Kellner无法就Qiagen的具体计划和未来将致力于的癌症发表评论，但他指出，该公司将与“有需要和兴趣扩大市场准入的地方”的制药合作伙伴密切合作。