纽约(基因组网新闻)-一种叫做ATRX的基因的反复突变对应于神经母细胞瘤的诊断年龄,根据今天出版的一项研究美国医学协会杂志.
圣裘德儿童研究医院-华盛顿大学儿童癌症基因组计划的成员做到了对匹配的肿瘤正常样本进行基因组测序来自40名转移性成神经细胞瘤患者,他们被诊断为婴儿、儿童或青少年/年轻人。
四分之一的肿瘤基因组包含ATRX基因的突变或结构变化,该基因涉及端粒维持、染色质重塑和核小体组装。但这些突变在被诊断为青少年/年轻人或患有慢性疾病进展的儿童诊断肿瘤的个体中更常见,而在婴儿的肿瘤样本中没有出现——当研究人员在数十个成神经细胞瘤样本中寻找ATRX突变时,这种模式仍然存在。基因的改变也对应着肿瘤端粒的变长。
这些发现很有趣,因为更大的诊断年龄对应于更糟糕的成神经细胞瘤的结果和一些不同的疾病进展,暗示ATRX突变可能定义了成神经细胞瘤的一个独特的亚群。
“这表明我们可能需要根据患者是否有ATRX突变来考虑不同的治疗策略,”华盛顿大学基因组研究所所长、合著者理查德·威尔逊在一份声明中说。
研究作者指出,一段时间以来,人们已经知道成神经细胞瘤的疾病进展模式和结局不同,这取决于个体何时被诊断患有这种疾病。“根据目前的治疗方法,诊断年龄已被证明是结果最有力的预测因素之一。”
例如,虽然被诊断为成神经细胞瘤的婴儿的总体存活率约为88%,但在18个月至11岁之间被诊断为成神经细胞瘤的儿童的存活率降至49%。
对于那些被诊断为青少年和年轻人的患者,总体存活率更低,约为10%,尽管短期存活率往往更高。研究人员解释说,这是因为那些在12岁或12岁以上被诊断出患有成神经细胞瘤的人更容易患上慢性或“惰性”成神经细胞瘤,这可能会在患病多年后导致死亡。
为了更好地了解成神经细胞瘤背后的遗传特征,PCGP使用配对端Illumina测序对匹配的种系和诊断成神经细胞瘤肿瘤基因组进行测序,使用的样本来自纪念斯隆-凯特林癌症中心,收集时间超过20年。
这些样本来自40例4期转移性成神经细胞瘤患者,包括6名18个月以下的婴儿,29名12岁以下的儿童和5名12岁或以上的青少年/年轻人。研究作者指出,大约一半的神经母细胞瘤患者在诊断时已经晚期转移。
在所有5名在青少年或年轻人时期被诊断为成神经细胞瘤的个体的肿瘤基因组中,研究人员发现了ATRX的突变或结构变异。
相比之下,ATRX基因的改变在儿童时期确诊的成神经细胞瘤肿瘤中不太常见。在接受测试的29名儿童中,有5名儿童的肿瘤存在ATRX变化,而在所有婴儿的诊断性肿瘤中,都没有检测到该基因突变。
当他们在另外64名婴儿、儿童、青少年和年轻人的肿瘤样本中筛查ATRX变化时,研究人员再次发现,该基因突变在青少年/年轻人组和患有类似慢性成神经细胞瘤疾病模式的儿童中更为常见。
在通过基因组测序或靶向ATRX测试测试的所有104个肿瘤中,研究小组在被诊断为青少年/年轻人的肿瘤中发现了44%的基因突变,在17%的儿童肿瘤中发现了突变,而在所有婴儿肿瘤中都没有发现突变。
“我们发现的突变与年龄较大的患者有关,但它也首次确定了一个年轻患者的亚群,他们最终被证明患有惰性形式的成神经细胞瘤,”圣裘德的发育神经生物学研究员迈克尔·戴尔(Michael Dyer)在一份声明中说。
如果是这样,研究人员解释说,ATRX改变的存在或不存在可能最终有助于预测疾病进展,并指导新诊断的成神经细胞瘤患者的治疗。尽管如此,他们警告说,还需要做更多的工作来评估ATRX突变在更广泛年龄范围内的成神经细胞瘤中的后果。
据报道,圣裘德的研究人员正在筛选对含有ATRX突变的成神经细胞瘤细胞有活性的化合物,重点是已经被批准在美国使用的药物。