这部分包括上周的内容短的读取上周不小心漏掉了在序列。
Life Technologies公布了1.07亿美元的第四季度合并费用亏损
Life Technologies上周公布第四季度亏损1.069亿美元,原因是去年11月应用生物系统公司(Applied Biosystems)和Invitrogen公司(Invitrogen)合并后产生的各种费用。
尽管该公司的收入低于分析师的预期,但Invitrogen的传统业务录得7%的有机收入增长。
这家总部位于加州卡尔斯巴德(Carlsbad)的公司在截至12月31日的第三季度总收入为5.406亿美元,而Invitrogen在2007年第四季度的总收入为3.364亿美元。这一数字低于分析师对该季度营收5.726亿美元的普遍预期。
该公司表示,在2008年第四季度的五周时间里,ABI作为Life Technologies的一部分贡献了1.91亿美元的收入。Invitrogen传统业务的有机收入同比增长7%。
除了ABI的收入外,公司的生物发现部门在2008年第四季度带来了2.401亿美元的收入,同比增长了0.5%,其中包括货币转换带来的4.5%的负面影响,而细胞系统部门的收入为1.137亿美元,同比增长了17%,其中包括货币转换带来的4%的收益。
Life Technologies本季度的研发支出为4730万美元,销售和管理支出为1.517亿美元。该公司计入了7440万美元的研发费用,以及2260万美元的业务整合费用。
由于合并相关的成本,Life Technologies公布了1.069亿美元的净亏损。每股89美元,而利润为4,110万美元。2007年第四季度,Invitrogen公司每股41美元。
2008年全年,Life Technologies的收入为16.2亿美元,而Invitrogen 2007年的收入为12.8亿美元。生物发现部门2008财年的收入为9.899亿美元,而细胞系统公司贡献了4.437亿美元,ABI公司作为母公司的一部分在五周内贡献了1.91亿美元。
Life Technologies今年的研发成本为1.425亿美元,全年销售管理和管理支出为4.993亿美元。
该公司公布利润为3,130万美元。相比之下,2007财年Invitrogen的利润为1.432亿美元,或每股1.34美元。
去年年底,Life Technologies获得了4.483亿美元的现金和投资。该公司还持有35亿美元的长期债务,公司管理人士在电话会议上表示,偿还债务是使用现金的首要任务。
Life Technologies表示,预计2009年有机营收将录得较低的个位数增长,预计货币折算带来的负面影响约为4%。它还预计非公认会计准则每股收益在2.40美元至2.55美元之间。
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尼安德特人草图基因组完成使用454,Illumina序列数据
位于莱比锡的马克斯·普朗克进化人类学研究所的研究人员上周表示,他们已经完成了尼安德特人基因组的草图。
上周在芝加哥举行的美国科学促进会年会上,MPI进化遗传学部门主任Svante Pääbo说,这些结果表明,从基因组的角度来看,尼安德特人与人类并没有太大的不同。更确切地说,尼安德特人的DNA序列通常与现代人类的遗传变异模式相同。
Pääbo解释说,在未来,研究人员希望通过比较人类、尼安德特人、黑猩猩和其他类人猿的基因组,并观察存在差异的区域,更好地了解人类进化。“获得尼安德特人基因组的吸引力在于,它是我们最近的亲戚。”
他的团队最近还完成了倭黑猩猩基因组的18倍草图序列,
一种濒临灭绝的普通黑猩猩的近亲(见按顺序5/13/2008).
Pääbo和他的团队对尼安德特人DNA的37亿碱基对进行了测序。而部分数据是由454生命科学公司(454 Life Sciences)在一项合作下生成的按顺序8/12/2008),科学家们在项目的最后阶段生成了Illumina序列数据,以实现一倍覆盖。目前的序列数据代表了尼安德特人基因组的63%。
Pääbo表示,与之前的研究相比,人类DNA污染的比例不到1%。基于线粒体序列数据,污染的估计值为0.3%,而基于y染色体数据的估计值为0.5%。
到目前为止,结果表明尼安德特人和人类参考序列之间大约有10%的差异。根据DNA和人群遗传变异的估计,结果表明尼安德特人和人类在30万到83万年前分道扬镳。
研究小组已经开始比较尼安德特人和人类基因组的特定区域。例如,他们发现尼安德特人有一种乳糖酶基因,不能让他们在断奶后消化牛奶。
当研究人员检查FOXP2基因这种基因与人类大脑功能有关,有助于语言表达,他们发现尼安德特人也有相同的两种基因FOXP2基因这种变化在人类身上发现,但在其他类人猿身上没有。这表明FOXP2基因发生在人类和尼安德特人共同的祖先身上。
此外,Pääbo表示,研究人员在第7号染色体上发现了一个区域,尼安德特人的序列与猿的序列相似,但与人类的序列不同,这表明人类基因组在该部分基因组中经历了选择性扫描。
Pääbo表示,在接下来的两到三年内,该团队计划对尼安德特人的基因组进行更深入的测序,可能是15到20倍。他们打算在今年晚些时候发表与尼安德特人基因组草图及其分析相关的结果。
贝勒、ABI为首1000个基因组数据发布贡献460千兆酶
Life Tech的应用生物系统部门本周表示,该公司与其合作伙伴贝勒医学院人类基因组测序中心一起,为1000个基因组计划的首次数据发布贡献了超过460千亿个“独特可映射”序列数据,这些数据是在SOLiD平台上生成的。
据该公司称,这比这两个组织最初计划提供的数据多了65%。
ABI表示,HGSC在2.6倍覆盖范围内对24人进行了测序,在26倍覆盖范围内对1人进行了测序,产生了256gb的总数据。ABI自己生成了超过206gb的数据。
ABI与HGSC的合作始于去年4月,当时该公司向该中心提供了6个SOLiD系统,以扩大其对1000个基因组计划试点阶段的贡献。当时,HGSC计划提供200千兆字节的序列数据。2008年6月,ABI以商业参与者的身份加入了该项目(见按顺序6/17/2008),并承诺贡献在SOLiD平台上生成的至少75gb的序列数据。
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英国中心拨款170万英镑用于小麦基因组测序
布里斯托尔大学、利物浦大学和英国约翰·英纳斯中心的科学家们将利用英国政府的170万英镑(240万美元)资助对小麦基因组进行测序,其中两家机构上周表示。
这些中心的科学家将从一个标准小麦品系和四个品种中提取序列。基因组测序大约需要一年时间才能完成。
布里斯托尔大学表示,该项目由生物技术和生物科学研究委员会资助vwin德赢ac米兰合作,将“通过探索新的测序技术和分析方法的应用,为面包小麦基因组的全面测序铺平道路”。
布里斯托尔大学谷物功能基因组学教授基思·爱德华兹在一份声明中说,通过为育种家提供识别各种小麦品种的方法,这项研究的数据“将大大提高育种新品种的效率,并识别基因组中具有关键性状的区域,如抗病性、提高质量和产量”。
Helicos将于12月向投资者发售股票
Helicos BioSciences上周向美国证券交易委员会(sec)提交了一份招股说明书,拟出售6840万股普通股,这些普通股由去年12月参与该公司私募的股东持有。
该公司表示,出售股票的股东根据招股书不时出售普通股,而Helicos将不会从这些股票的出售中获得任何收益。这约6840万股包括向行使认股权证的出售股东发行的近2570万股。
在去年12月的配售中,该公司向投资者出售了4280万股股票,总收益约1860万美元,投资者包括Atlas Ventures、Flagship Ventures、Highland Capital、Versant Ventures、Stephens、Vision Capital Advisors,以及斯坦福大学教授、Helicos联合创始人斯蒂芬·奎克(Stephen Quake)。
每个单位包括一股普通股和一份认股权证,以$的行权价格购买0.6股普通股。每股45美元。这些认股权证的期限为5年,在去年12月交易完成后立即可行使。
向美国证券交易委员会提交股票文件并不意味着投资者将出售这些股票。Helicos在文件中指出:“出售股东可能会出售部分、全部或不出售他们的股份。”
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Febit将参与海德堡生物标志物发现中心的建立
Febit本月将帮助建立海德堡生物标志物发现中心,该项目最近获得了德国联邦教育和研究部卓越集群计划的资助。
该项目是4000万欧元(5160万美元)拨款的一部分,用于在德国莱茵内卡尔地区发展一个生物技术卓越集群,用于开发创新药物、诊断和细胞和分子生物学技术。
作为其贡献的一部分,Febit上周表示,它将提供基于阵列和第二代测序的分析,以帮助新型生物标志物的开发和验证。该公司还将与德国癌症研究中心合作,研究确定各种癌症类型的标记物,并将这些标记物开发成标准化的诊断分析。
Genesis用软件版权换取Real Time Genomics的股份
Genesis Research and Development将用其基因组学数据查询软件包的销售权换取生物信息学初创公司Real Time genomics的股份。
总部位于新西兰奥克兰的Genesis公司上周表示,将把NetValue公司SLIM搜索软件(基于Genesis公司的笛卡尔技术)的特许权使用费转换为Real Time Genomics公司10%的股份。vwin德赢ac米兰合作Genesis的权益将由新西兰控股公司Gene Value持有。
该公司表示,SLIM搜索软件可以实时搜索和分析短基因组读数、454生命科学仪器生成的数据以及10千碱基及更大的读数。
表达分析与补体基因组公司进入英国服务合作伙伴关系
Expression Analysis上周表示,它正在与英国桑德兰的Complement Genomics合作,为英国市场提供基因组服务。
艺电表示,此次合作将使其能够扩大其客户基础,超越其在美国的主要市场。
Complement Genomics通过Geneblitz部门提供一系列服务,包括基因分型、DNA测序、法医测试、毒理学和药物分析协议。
两家公司计划将合作重点放在全基因组关联研究上,艺电表示,该领域已成为其业务“越来越大的一部分”。
研究小组序列普通感冒病毒收集
在一个纸出现在网上科学上周,来自威斯康星大学麦迪逊分校、J. Craig Venter研究所和马里兰大学医学院的研究人员报告说,他们已经对所有99种已编目的人类鼻病毒(导致普通感冒的病毒)的基因组进行了测序,同时还对10个新的现场样本进行了测序。
基因组序列和其他生物学数据一起为HRV生物学提供了新的见解,并为新的HRV系统发育树提供了基础,该树以前所未有的分辨率揭示了HRV菌株之间的关系。研究人员表示,这些发现最终可能会为普通感冒带来新的治疗方法和更好的诊断。
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马里兰大学医学院和基因组研究所(现在是J. Craig Venter研究所的一部分)的科学家们生成了足够的数据,对现有储存库中的所有99种HRV菌株以及10种新的现场分离株进行了大约6倍的覆盖。由于其他研究小组已经完成了部分测序工作,该团队不必从头开始:他们最终对大约80个历史菌株和10个现场样本进行了测序。
当研究人员使用新的序列数据、已发表的HRV-A和HRV-B序列数据以及HRV-C序列数据生成了一棵系统发育树时,他们得出了一棵不同于以往任何研究的树——不是因为以前的研究不准确,而是因为他们没有那么多可用的数据。
有了基因组和新的系统发育分析,现在有可能提出针对特定HRV亚VWIN娱乐网站群的新候选药物。
为了充实新的参考序列收集,并获得与各种菌株相关的临床特征的新见解,研究人员现在计划对从美国各地收集的1000个额外的HRV现场分离株进行测序。该项目的测序将可能在马里兰大学使用一种或多种类型的高通量测序方法完成。
- - - - - -安德里亚·安德森;原载于基因组网每日新闻
RNA-Seq为细菌生态位专业化提供线索
在网上发表的一篇论文PNAS上周,一个国际研究小组利用RNA测序揭示了与细菌适应两个不同生态位相关的基因表达和调节变化。
伯克cenocepacia可导致囊性纤维化患者和其他免疫功能低下患者的健康问题。为了更好地理解这种细菌的生态位适应,研究人员比较了两种细菌b . cenocepacia从囊性纤维化患者和土壤样本中分离出的菌株。
科学家们使用RNA-Seq比较了AU1054的基因表达和调控途径,AU1054是从囊性纤维化患者的痰中分离出来的菌株,而HI2424是从纽约州的农业土壤中分离出来的菌株。每个菌株都进行了多次测试,并在囊性纤维化和土壤提取物培养基中生长。
在模拟囊性纤维化和土壤条件的培养基和温度中培养菌株后,研究小组分离出RNA,富集信使RNA,并生成cDNA文库。美国能源部联合基因组研究所的研究人员随后在Illumina基因组分析仪上对cDNA进行了测序。
研究小组报告说,HI2424比AU1054有更多的高表达基因,尽管他们发现这两种菌株的差异基因表达取决于所使用的生长条件。
研究人员还发现,增长b . cenocepacia在囊性纤维样条件下诱导毒力因子,而在模拟土壤条件下提高了氮清除和环境感知相关基因的表达。
此外,研究人员还发现了13种新的非编码rna。其中有12种在土壤条件下优先表达,这加剧了人们对非编码rna可能有帮助的猜测b . cenocepacia土壤生存。
最后,当研究小组在相同条件下直接比较两种菌株时,他们发现在类痰条件下有179个基因表达差异,而在类土条件下有120个基因表达差异。
研究结果提供了对不同品系之间差异的深入了解,以及研究人员使用的适应性技术b . cenocepacia一般来说。而且,研究人员指出,通过研究囊性纤维化条件下特异性表达的AU1054基因,有可能找到关键的致病因子。
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丹娜-法伯癌症研究所将安装螺旋测序仪
丹娜-法伯癌症研究所计划本月安装一套Helicos基因分析系统,VWIN娱乐网站按顺序学会了。该仪器计划本周晚些时候从Helicos生物科学公司发货。
根据与Helicos的协议,Dana-Farber将免费在现场使用该仪器6个月。
DFCI分子生物学核心设施主任Paul Morrison说,在此期间,来自12个研究所实验室的研究人员计划运行总共600个样本——每两周50个样本——用于包括ChIP-Seq和癌症相关样本的数字基因表达分析在内的应用。实验室正在为这些项目所需的试剂支付费用。
莫里森表示,“只要我们把仪器从电梯里拿出来”,项目就会开始。
美国基因组中心将增加21台Illumina基因组分析仪
Illumina公司上周表示,该公司已与华盛顿大学(Washington University)达成原则协议,在未来几个月向其出售21台额外的基因组分析仪(Genome Analyzer)测序仪,用于其人类基因组学项目。
Illumina公司表示,这些新机器将使华盛顿大学医学院基因组中心的安装基础达到35个。该公司表示,有了额外的测序能力,在对系统进行“持续改进”后,该中心将能够以25倍的覆盖率每天对一个人类基因组进行测序。
基因组中心主任理查德·威尔逊(Richard Wilson)在一份声明中说:“我们大幅扩大这项技术的意vwin德赢ac米兰合作图反映了我们对大规模测序项目的承诺,这些项目旨在揭示各种人类疾病的潜在遗传基础。”“随着全基因组测序成本的迅速下降,我们认为现在是时候着手实施以前不可能实现的举措了。”
ABRF调查发现,一半的第二代音序器所有者计划购买更多音序器
生物分子资源设施协会DNA测序研究小组最近的一项调查(见按顺序1/13/2009)发现,目前拥有第二代测序仪的实验室中,约有一半计划在未来两年内购买另一套系统。
康奈尔大学的Peter Schweitzer在田纳西州孟菲斯举行的ABRF年会上告诉与会者。他说,这些结果只是第二代测序仪器当前状态的一个“快照”,并指出DSRG计划对调查数据进行进一步分析,并将其结果提交给该组织生物分子技术杂志vwin德赢ac米兰合作在不久的将来。
在调查的69个参与者中,主要包括美国的核心实验室和学术机构,37个目前有一个或多个来自罗氏/454、Illumina或生命技术部门应用生物系统的测序仪。其中,47%的人表示,他们计划在未来两年内至少再购买一种金融工具。
在那些目前没有第二代测序仪的参与者中,15人表示他们未来没有购买的计划,而15人表示他们正在考虑在未来两年内购买。
57%的受访者表示,他们最终计划购买第二代或第三代测序仪。其中,10家机构表示计划“立即”购买系统,20家表示计划在未来6个月内购买,17家表示计划在6至12个月内购买,12家表示计划在未来1至2年内购买。
Schweitzer说,这些受访者打算购买的平台组合在罗氏/454、Illumina和应用生物系统公司之间相对平均地分布。
在接受调查的实验室中,第二代测序最常见的应用是全基因组测序,其次是ChIP-Seq和转录组分析。最不常见的应用是数字基因表达和甲基化分析。
三个实验室表示,他们只使用他们的系统进行全基因组测序,而一个实验室只使用他们的仪器进行小rna测序。
调查结果表明,第二代测序对桑格测序产生了一些影响,但可能没有一些人预期的那么大:三个回应的实验室表示,由于第二代技术,他们对桑格测序的使用“急剧”减少,而10个实验室表示他们对桑格测序的使用“有所减少”。vwin德赢ac米兰合作
然而,大多数受访者表示,他们在桑格测序的使用方面几乎没有变化或没有变化:15个实验室报告说,他们在桑格测序的使用方面没有变化,而12个实验室报告说,他们对桑格测序的使用实际上有所增加。
- - - - - -作者:伯纳黛特·托纳,最初发表于基因组网每日新闻
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圣裘德白血病研究人员获得ABI测序奖
应用生物系统公司上周表示,圣裘德儿童研究医院的病理学研究员查尔斯·穆兰根(Charles Mullighan)赢得了该公司的“你会用1万美元的基因组做什么”资助,这笔资金将支持他对急性淋巴细胞白血病的研究。
根据该项目,Mullighan将与ABI研究人员合作,对圣裘德医院5名儿科患者的正常组织、诊断时的白血病细胞和复发样本进行测序。
研究人员计划生成60gb(7.5亿个标签)的测序数据,以识别与ALL(一种白细胞癌)相关的snp、大小插入/删除、易位和拷贝数变异。
ABI是Life Technologies的子公司,将对SOLiD 3进行样本处理、数据生成和初级数据分析。该项目旨在揭示与ALL相关的结构变异和其他基因组变化,以了解与复发相关的基因组变化,并确定疾病的新疗法。
Mullighan在佛罗里达州马可岛举行的年度基因组生物学和技术进展会议上获得了一等奖。vwin德赢ac米兰合作她从200多名申请者中脱颖而出。
罗氏表示GS FLX销售额在2008年几乎翻了一番,因为应用科学收入增长了11%
罗氏上周表示,其454 GS FLX测序仪的销量在2008年几乎翻了一番。其诊断部门2008年全年收入从2007年的94亿瑞士法郎下降到97亿瑞士法郎(84亿美元),下降了3%。
该部门包括多个业务领域,包括分子诊断业务,其收入下降2%至11亿瑞士法郎,以及应用科学业务,其收入增长11%至7.65亿瑞士法郎。应用科学包括454种生命科学。
在应用科学集团内部,罗氏表示,尽管来自竞争对手的压力越来越大,但其基因组测序器FLX系统的销量“几乎翻了一番”。应用科学领域的LightCycler 480实时PCR仪器和试剂的销售也出现了两位数的增长,在北美和中国的销售增长尤其强劲。
此外,罗氏表示,微阵列系统对应用科学集团的“全年销售额做出了重大贡献”。“自罗氏2007年8月收购NimbleGen以来,这些产品的连续季度销售增长一直稳定而强劲。”
罗氏包括诊断和制药部门在内的总营收下降1%,从461亿瑞士法郎降至456亿瑞士法郎。
诊断部门占公司总销售额的21%,药品部门占79%。
对于2009年,罗氏表示,预计这两个部门的全年销售额将“领先于市场,以当地货币计算,增幅将在个位数左右。”
罗氏表示,应用科学集团今年的优先事项包括“开发新的、更强大的NimbleGen微阵列,并提高研究市场基因组测序技术的灵活性和效率”。vwin德赢ac米兰合作该公司还计划更新LightCycler 480仪器和MagNa Pure样品准备系统。
应用科学组计划推出的产品包括高分辨率微阵列扫描仪和MagNa Pure 96高通量系统。
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Illumina第四季度营收增长43%,扭亏为盈
Illumina上周公布,其第四季度营收同比增长43%,由上年亏损转为盈利。
截至2008年12月28日的三个月期间,该公司的总收入为1.609亿美元,而2007年第四季度的总收入为1.126亿美元。其产品收入从1.011亿美元增加到1.528亿美元,而服务和其他收入从1150万美元下降到810万美元。
Illumina首席财务官Christian Henry在上周的电话会议上表示,受Infinium HD珠子芯片和测序试剂盒需求的推动,该公司本季度耗材收入同比增长76%,达到9860万美元。
他还表示,该公司的仪器收入从2007年第四季的4,180万美元增长23%至5,120万美元。
Illumina总裁兼首席执行官Jay Flatley在电话会议上表示:“我们的收入增长反映了我们在阵列和测序领域的强大市场地位。“根据我们的估计,我们相信我们在高多重基因分型市场拥有超过70%的市场份额,在下一代测序市场拥有超过60%的市场份额。”
弗拉特利表示,Illumina在本季度出货了“创纪录的”38套beadeexpress系统,每一套系统的“消耗品拉动率在我们预测的每年5万至10万美元区间的高端”。他没有提及本季度或2008年基因组分析仪(Genome Analyzer)测序仪的出货量。
Illumina公布利润为2890万美元。每股22美元,而净亏损为410万美元。每股04美元,2007年第四季度。2007年第四季度涉及和解诉讼的费用为5,450万美元。
研发支出从2010万美元增长41%至2830万美元,而销售与管理支出从3000万美元增长31%至3920万美元。
2008年全年,Illumina的收入从3.668亿美元跃升至5.732亿美元,增幅56%。该公司今年的产品收入为5.324亿美元,而2007年为3.267亿美元,而服务和其他收入则持平于4,080万美元。
Illumina 2008年的净利润为5,050万美元。相比之下,2007年净亏损2.784亿美元,合每股亏损2.57美元。2007年的业绩包括3.034亿美元的收购过程中研发费用,而2008年的类似费用为2470万美元。
今年的研发成本从2007年的7,390万美元增长35%至1亿美元,销售与管理费用支出从1.013亿美元增长46%至1.48亿美元。
2008年底,Illumina持有3.27亿美元现金和现金等价物。
该公司预计2009年第一季度营收在1.58亿美元至1.64亿美元之间,每股收益在美元之间。23美元和26美元。2009年全年营收预计在6.9亿美元至7.2亿美元之间,每股收益预计在1.1美元至1.20美元之间。
EMBL购买了Genomatix的软件
genome atix上周表示,欧洲分子生物学实验室已经安装了来自Genomatix software的第二代测序数据分析软件,用于其位于德国海德堡的基因组核心设施。
这家总部位于慕尼黑的公司表示,EMBL已经购买了该公司的采矿站,该采矿站提供SNP检测和基因分型、拷贝数分析和小RNA分析,以及其基因组分析仪软件,该软件可以对来自GMS的数据进行深度生物学分析。据Genomatix介绍,这些系统为分析原始的第二代测序数据提供了一个集成的解决方案。
EMBL的GeneCore专注于研究EMBL开发的新技术的效益和使用,并致力于提高实验室数据的质量、效率和相关性。
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ABRF研究探索microRNA分析平台
在生物分子资源设施协会的支持下,几个研究小组正在比较不同的微阵列平台和第二代测序在microRNA分析方面的叠加效果。
根据正在进行的研究的初步结果,在田纳西州孟菲斯举行的ABRF年会上提出。本周,来自Affymetrix、Illumina、Agilent和Exiqon的miRNA阵列在敏感性和可重复性方面都表现出不同的优点和缺点。
该研究由ABRF的微阵列研究小组和DNA测序研究小组联合进行,将四种阵列平台与应用生物系统公司的TaqMan miRNA分析进行了比较。参与者还将结果与Illumina基因组分析仪的miRNA数据进行了比较,但这部分项目尚未完成。
在概述初步结果的演讲中,美国环境保护署的Susan Hester指出,研究小组的目标是评估用于miRNA表达分析的第二代测序和微阵列的有效性。
参与的站点分析了大脑和肝脏的RNA,并在每个阵列平台上进行了三次重复。该研究使用了应用生物系统公司的RT-PCR平台作为比较不同阵列技术准确性的基线。
该研究评估了许多参数,包括每个平台可重复检测到的mirna的数量,在大脑和肝脏组织中以超过两倍的任意截止值差异表达的mirna的数量,以及平台内部和跨平台的可重复性。
Illumina阵列平台最敏感,检测到1146个mirna,而TaqMan检测到673个。Affy、Agilent和Exiqon平台分别检测到847、723和732个mirna。
Illumina平台在差异表达方面也是最敏感的,可以检测到394个折叠变化超过2倍的mirna。该类别中最低的是Affy平台,该平台测量了292个差异表达的mirna,截止折叠变化为2。
安捷伦平台与TaqMan平台的相关性最好,在所有平台上测量的mirna的灵敏度最高,其他平台生成的结果的可重复性也最高。
根据初步结果,在总体技术再现性方面,Affy领先,而Exiqon和Agilent平台显示出最佳的跨平台结果相关性。
虽然对数据的分析仍在进行中,但Hester表示,早期的结果表明,所有平台都“在一些敏感性参数上表现出优势和劣势”。
她说,导致结果差异的一种可能是不同平台的miRNA探针的差异,尽管她强调这只是猜测。
康奈尔大学的Peter Schweitzer讨论了他的小组通过Illumina基因组分析仪为这项研究生成miRNA数据的工作,但他指出,到目前为止,该小组只对大脑样本进行了测序。
Schweizer说,测序仪在该样本中检测到359个mirna,与安捷伦阵列结果的初步比较表明“良好的相关性”,但强调这只是初步结果。他没有提供该研究的测序部分预计完成日期的时间表。
- - - - - -作者:伯纳黛特·托纳,最初发表于基因组网每日新闻
美国食品药品监督管理局瞄准基因组学的新努力
美国食品药品监督管理局(FDA)上周表示,将在FDA首席科学家办公室增设一个新职位,专注于该机构的基因组学相关项目。
食品和药物代理专员弗兰克·托尔蒂在FDA网站上的每周讲话中提到了这一新职位。他说,新员工将致力于“协调和升级我们机构在基因组学和相关科学领域的活动,这些领域涉及复杂DNA、蛋白质和较小的表达平台的分析。”
第一个担任这一职位的人将是利兹·曼斯菲尔德,她曾在FDA和私营部门担任政策和科学职位。曼斯菲尔德将致力于FDA的目标,即为该机构的科学家提供能够对复杂基因数据进行高水平分析的工具和人员。
在他的演讲中,Torti表示,“对基因组学协调工作的强调”源于FDA去年夏天的一次会议,该会议聚焦于基因组学、FDA科学委员会的建议以及“我们自己的内部计划”。
Torti解释说,为了推进个性化医疗,“FDA必须使用最先进的工具来评估我们机构监管的新产品和经常高度复杂的产品。”“将最新的基因组技术进一步整合和协调到FDA的流程和决策中,将更好地保护和促进公众健康。”vwin德赢ac米兰合作
Linkage Biosciences在A轮融资200万美元
分子诊断公司Linkage Biosciences上周表示,该公司已完成200万美元的a轮融资。
Linkage Bio说,本轮融资由Greenhouse Capital Partners和Fisher Capital Corp. II的管理成员费舍尔(James R. Fisher)领投。Fisher Capital Corp. II专门与纽约私募股权公司Kohlberg Kravis Roberts合作。
该公司预计将利用这笔资金继续开发和销售其分子诊断产品,这些产品主要用于器官移植的人类白细胞抗原分型。该公司还在开发用于其他移植诊断和复杂遗传疾病的产品。