纽约(基因组网)-根据一项新的研究，体细胞靶向下一代测序面板的平均成本为607欧元(754美元)。
法国的研究人员开始评估下一代测序测试在临床环境中是否可以负担得起。INSERM的Patricia Marino和她的同事们追踪了15个法国基因实验室在体细胞和种系面板测试过程中每一步的花费。正如他们本周报道的那样在欧洲人类遗传学杂志研究人员发现，消耗品通常是测试成本的主要驱动因素。
马里诺和她的同事写道:“这项工作是为未来的成本效益分析提供输入的第一步。”
在他们的研究中，研究人员在2014年3月至2015年11月期间观察了法国实验室，并计算了从分析前阶段到测序、技术和生物验证的整个测试过程的生产成本。在每个步骤中，他们确定所使用的资源，如人员、消耗品和设备。他们确定每种资源的成本，无论是根据消耗品的实际单位购买价格，还是根据人员的工作时间。他们还在分析中包括了其他非特定的成本，如培训人员所需的时间、间接成本等。
利用所有这些，马里诺和她的同事估计，每位患者体细胞检测的总成本在376至968欧元之间，而种系检测的总成本在322至727欧元之间。根据他们的分析，试剂等消耗品在很大程度上推动了测序检测的成本。对于体细胞检测，消耗品占成本的48%，而它们占生殖系基因检测成本的41%。
研究人员发现，由于依赖消耗品，检测过程的富集步骤是最昂贵的，其次是测序本身，这也使用了许多消耗品。
如果消耗品的成本下降25%，研究人员估计，体细胞下一代测序测试的成本将下降约15%，生殖系测试的成本将下降约13%。
间接费用和其他与测序不直接相关的费用——如研究和开发——占两种测试类型成本的30%左右。劳动力分别拉动了体细胞和种系检测成本的14%和18%。
研究人员指出，实验室工作人员的工资下降25%，只会使体细胞检测的平均成本降低7%，使种系检测的平均成本降低5%。然而，他们补充说，随着更多的时间花在分析和解释结果上，劳动力成本预计将大幅上升，而由于规模经济和竞争，消耗品和设备成本可能会下降。
Marino和她的同事注意到，他们的分析仅限于体细胞组的热点突变和种系组的验证基因，并补充说，添加额外的目标可能会增加成本。
他们补充说:“除了成本评估方面的考虑，与更有针对性的方法相比，这些新的测序技术的推广将引发对其效率的质疑，以及它们在常规诊断背景下的附加值。”