纽约(基因组网)-新的研究显示，乳腺癌的一个子集包含与DNA错配修复(MMR)缺陷一致的突变特征，这表明一些患者可能受益于免疫检查点封锁免疫疗法，类似于用于其他类型的MMR缺陷癌症的疗法。
威康信托基金会桑格研究所的研究人员海伦·戴维斯在一份声明中说:“[根据目前的临床标准]，这些肿瘤不会被检测出错配修复通路缺陷。”“我们已经证明，实际上还有另一类乳腺癌——错配修复有缺陷的乳腺癌。”
为了更全面地描述导致乳腺癌的突变特征，戴维斯和来自桑格研究所和世界各地其他中心的同事对640名乳腺癌患者的肿瘤和正常样本进行了全基因组测序。他们的分析导致了11个具有类似于mmr缺陷癌症中发现的突变特征的肿瘤，这些肿瘤往往对抗pd -1或抗pd - l1检查点封锁治疗有反应。概述这些和其他结果的论文出现在今天的癌症研究．
桑格研究所的人类遗传学研究员、资深作者塞丽娜·尼克-扎纳尔在一份声明中说:“由于这些肿瘤与结直肠癌等其他癌症具有相同的突变特征，理论上它们应该对相同的免疫治疗药物产生反应。”“我们的结果表明，扩大可能使用检查点抑制剂治疗的癌症患者队列，将这些错配修复缺陷的乳腺癌患者包括在内。”
影响MMR基因的种系突变，如MSH2, MSH6, MLH1或PMS2，因其在林奇综合征中的作用而闻名，林奇综合征是一种遗传性疾病，使个人易患结肠直肠癌和其他类型的癌症。
尽管如此，作者解释说，这些或其他基因(或相关调控序列)的体细胞突变也会导致MMR缺陷，从而导致DNA修复问题和猖獗的突变。考虑到这一点，他们开始仔细研究大量的乳腺癌病例，寻找与MMR缺乏相关的突变特征。
发表在自然医学今年3月，同一团队的成员描述道与BRCA1或BRCA2缺乏相关的突变特征在对560例乳腺癌病例的基因组测序分析中，几十个肿瘤中都出现了这种基因。
在最新的分析中，Davies、Nik-Zainal和他们的同事们专注于640名乳腺癌患者的肿瘤-正常对的全基因组序列数据，将这些样本的基因组序列读取与人类参考基因组进行比对，以帮助缩小肿瘤中大约380万个体细胞替换、近40万个小插入和删除以及超过83000个重排。
他们还分别使用Affymetrix和Illumina阵列分析了肿瘤中的拷贝数和DNA甲基化模式。通过免疫组化染色，研究人员观察了福尔马林固定、石蜡包埋的肿瘤样本中的MLH1、PMS2、MHS2和MSH6蛋白水平。
他们报道说，这11个突变特征与其他mmr缺陷肿瘤相似的肿瘤包括5个雌激素受体阳性肿瘤和6个er阴性病例。在类似mmr缺陷的肿瘤中，inddel似乎很猖獗，其中9个肿瘤有更广泛的高突变模式。
研究小组随后进行了一系列分析，以验证这11个肿瘤的MMR缺乏。事实上，有6个病例的基因或表观遗传变化有望使MMR途径基因失活。免疫组化染色发现11个肿瘤中有10个相关修复蛋白下降。
当他们将研究范围扩大到1100例之前通过外显子组测序评估的乳腺癌时，研究人员发现，使用蛋白质编码序列，其中1%的病例存在MMR缺陷。
英国癌症研究中心首席科学家Karen Vousden在一份声明中说:“下一步将在临床试验中测试这种方法，以确定这些模式并使用它们来调整乳腺癌治疗是否有助于提高生存率。”Karen Vousden没有直接参与这项研究。