纽约(基因组网)-由英国布里斯托大学的一个研究小组领导的研究人员发现了近100种影响口腔溃疡(也称为口腔溃疡)风险的基因变异。
大约四分之一的年轻人和更高比例的儿童患口腔溃疡，虽然有些溃疡是由创伤、自身免疫或炎症引起的，但其他溃疡的起源尚不清楚。然而，之前的研究表明，这是一种基因影响。
研究人员进行了一项全基因组关联研究，确定了影响口腔溃疡风险的97种常见遗传变异。当他们报道自然通讯今天他们进一步发现，这些变异在免疫系统相关基因中富集，特别是那些参与调节T细胞的基因，而且这些基因中的许多位于现有药物靶向的通路中。
布里斯托尔医学院的研究员汤姆·杜丁是该研究的共同第一作者，他在一份声明中说:“目前，几乎没有令人满意的口腔溃疡药物治疗，因为目前的药物选择都是非特异性的，可能会导致副作用。”
他和他的同事使用来自英国生物银行的461106个人的数据进行了GWAS，这些数据将7000多个变异与发展口腔溃疡的风险联系起来。他们将这个列表缩减到97个独立的铅变体，然后在23andMe的355744人队列中进行测试。所有97个变量在两个队列中表现出方向一致性和相似的效应大小。
他们同样在其他三个具有更明确临床表型的队列中检查了这些变异，发现97个先导变异中的24个在所有队列中显示了一致的影响方向。
在对英国生物银行和23andMe队列进行meta分析后，与口腔溃疡相关的最强证据的信号是3号染色体上IL12A附近的一个常见变异。其他的顶级变异在IL10中，靠近CCR3和CCRL2中。研究人员还发现了HLA区域内与口腔溃疡风险增加有关的变异。
使用描绘工具优先考虑可能的因果基因，他们锁定了趋化因子或趋化因子受体作为可能的候选基因，如IL12A或IL12B。
这些和研究人员报告的其他信号分析强调了免疫系统在口腔疼痛风险中的作用。例如，基于描述的基因集分析发现，在参与T细胞调节的基因中，包括α - β T细胞分化和T细胞激活的口腔溃疡相关位点富集。使用s - predix工具从基因型数据预测基因表达的其他分析发现IL12A、SCHIP1和IL10影响口腔溃疡风险。
根据研究人员的说法，他们发现的变异似乎对口腔溃疡的风险有最大的影响，鼓励th1型免疫反应。他们说，这是一种生物学上可行的机制，也符合文献和临床实践中先前的报告。
此外，为了表征他们在HLA-B附近发现的信号，研究人员对推测的单倍型进行了分析，发现了20多个与口腔溃疡有关的单倍型。DRB1*0103是一种罕见的HLA-DRB1单倍型，编码HLA-DR异二聚体的β链，而HLA-DR异二聚体本身是一种T细胞受体配体。
研究人员发现，现有的药物针对的是这些基因和途径中的一些。其中一种叫做ustekinumab，是针对IL12蛋白的抗体。他们说，它被用来治疗牛皮癣和克罗恩病等疾病，也可能被用来治疗口腔溃疡。
杜丁说:“这类药物有可能被用于治疗口腔溃疡，尽管还需要进一步的研究来证明这一点。”