纽约——随着俄罗斯入侵乌克兰进入第二个月，这场战争不仅给数百万乌克兰人带来了难以想象的困难，引发了二战以来欧洲最大的难民危机，而且深刻影响了两国基因组研究人员的生活和工作，以及他们与美国和其他地方同事的关系。
身处俄罗斯军队袭击城市的乌克兰科学家们，在他们的研究所、住所和基础设施被摧毁之际，他们只是在努力求生，而在俄罗斯，一些不同意政府行动的研究人员在国内看不到职业前途，而另一些人则在面对一个不容忍异议的政权时，表达了他们对战争的反对。
与此同时，美国科学家(其中一些具有乌克兰或俄罗斯背景)一直在努力支持他们的同事，并保持现有项目和合作继续进行。
这场战争还在俄罗斯和乌克兰之间造成了深刻的分歧，一旦直接的袭击平息，这种分歧可能很难修复。例如，一名来自基辅的医学遗传学家最初同意为本文接受采访，但当她听说这篇文章将涵盖来自两国的研究人员时，她退出了参与，因为可以说这两国的研究人员受到的影响非常不平等。“俄罗斯正在对乌克兰发动一场残酷的战争，”她在一封电子邮件中写道。“不断面临失去生命和家园的风险，与俄罗斯科学家可能经历的经济困难是无法相比的。”
密歇根州奥克兰大学(Oakland University)生物科学系教授塔拉斯·奥莱克塞克(Taras Oleksyk)的研究重点是人类种群遗传学和进化基因组学。他在乌克兰长大，现在仍有家人在乌克兰，他说很多人要么正在抗击俄罗斯入侵者，要么正在接收难民。“我正在尽我所能帮助他们，”他在一封电子邮件中写道。
奥列克塞克还在乌日霍罗德国立大学担任教职。乌日霍罗德国立大学位于乌克兰西部，靠近喀尔巴阡山脉，距离斯洛伐克边境不远，他继续在那里为研究生教授基因组学的在线课程。他说，一周前，“在我上一节课的时候，大多数人都是从防空洞登陆的。”
3月初，奥莱克塞克在Facebook(最近在俄罗斯被禁止)上发出了充满激情的呼吁，这些呼吁也被发布在UzhNU的网站上问俄罗斯的朋友二是公开反对战争，不相信政府的宣传吸引人的致国际社会支持乌克兰。
但是，尽管有战争的恐怖，奥莱克塞克并没有停止思考乌克兰基因组学研究的未来。2018年前后，他帮助启动了乌克兰基因组多样性项目，该项目寻求从全国各地的乌克兰人那里生成全基因组数据。一年前，这个项目发表第一个结果是GigaScience该研究分析了乌克兰不同地区招募的97个志愿者的DNA样本的测序和基因分型数据。奥莱克塞克说:“我们正在进行一个更大的项目，希望战争一结束就能开始。”
研究人员来自乌克兰大学、奥克兰大学、密歇根大学、华大基因以及乌克兰不同地区的医院和公司，初步研究代表了“乌克兰迄今为止最大的基因变异调查，创建了一个公共参考资源，旨在为大量研究不足的人口提供医学研究数据，”作者说。据该论文称，资金来自华大基因、乌兹别克斯坦大学、美国国家癌症研究所和奥克兰大学。
但这项研究也未能摆脱政治因素的影响。Oleksyk说，圣彼得堡国立大学反对发表该研究结果的预印本BioRxiv2020年8月因为该分析使用了此前发表的另一项研究——俄罗斯基因组计划(Genome Russia)的数据，而这些数据已从公共领域移除。在用来自人类基因组多样性项目(HGDP)的俄罗斯人群的数据替换了有争议的数据后，Oleksyk的团队撤回了原始的预印本，并重新发布了一份新版本2020年11月．
然而，就连几个月后出版的杂志也遭到了俄罗斯的反对，“一名俄罗斯安全官员甚至骚扰了(没有成功)的编辑。GigaScience”,Oleksyk说。他说，那篇论文一直有些晦涩，直到上周才首次被引用，也就是在论文发表一年多之后，但所有的数据仍然是公开的。
“俄罗斯基因组”项目并非如此，该项目最初由奥莱克塞克牵头;Vladimir Brukhin，俄罗斯生物学家和生物信息学家;以及美国国家癌症研究所前实验室主任、遗传学家斯蒂芬·奥布莱恩。2011年，奥布莱恩从任职了25年的NCI退休，2012年初，他在圣彼得堡国立大学(也被称为圣彼得堡大学，或SPbU)任职，在那里他帮助创建了迪奥多西斯·多布詹斯基基因组生物信息学中心，并担任该中心的CSO。2013年，他还在佛罗里达州的诺瓦东南大学(Nova Southeastern University)担任教职，目前仍在留任。
奥布莱恩说，在俄罗斯的职位由俄罗斯政府所谓的慷慨拨款资助mega-grant程序这个项目对他很有吸引力，因为他知道自己的领域需要更多的生物信息学家，而优秀的程序员在俄罗斯也很多。他说，事实上，他在新中心招募和培训的程序员都是他合作过的最好的。“他们就是善良、聪明、能干。”
“俄罗斯基因组计划”的想法源于一种认识，即许多其他国家——包括美国和中国——已经开始了他们自己的人口基因组计划，以更好地了解他们的人口历史和特定人群的疾病风险，但“缺口在俄罗斯，”O'Brien说。他回忆说，最初，这个项目获得了极大的热情，也获得了资金。
2015年，他和他的两名合作组织者描述了俄罗斯基因组计划的大纲GigaScience而在科学他写道，它“有望填补(人类人口遗传学)的最大空白之一，即俄罗斯联邦的广阔地区，不仅提供了这些地区的医学基因组学，还提供了历史上和史前欧亚民族的移民定居点。”
他们写道，该项目得到了俄罗斯科学院(Russian Academy of Sciences)和俄罗斯教育和科学部(Russian Ministry of Education and Science)的认可，“尽管政治外交仍在继续，但俄罗斯基因组计划能够也应该成为一个基于共同立场、以改善人类健康和改善为共同目标的国际合作的典范。”
根据项目的网站该计划的目标是建立一个包含至少3000名来自俄罗斯不同地区的俄罗斯人全基因组测序数据的数据库。
然而，那时俄罗斯已经入侵了克里米亚。奥莱克塞克说:“我对俄罗斯对乌克兰的政策感到厌恶，尽管我继续与为这个项目做出贡献的同事们一起工作，但我无法让自己再次来到俄罗斯。”
俄罗斯基因组计划确实做到了发布一个最初的分析对264个俄罗斯人的基因组进行了分析，其中包括60个来自俄罗斯西部和东西伯利亚的新测序样本基因组学2019年3月。该研究的作者隶属于俄罗斯、美国、荷兰和波多黎各的机构，并列出了来自俄罗斯各机构和机构的资助。
但是，虽然为该项目生成的数据最初是公开的，但SPbU后来删除了它，留下了论文一个失效链接．奥莱克塞克说:“我仍然对这起事件感到非常不安，我辛辛苦苦获得的数据完全被浪费了，因为社区无法使用它们。”
此外，奥布莱恩说，到那时，俄罗斯基因组计划已经失去了俄罗斯当局和一些没有参与该计划的俄罗斯科学家的支持，他最终解散了他在SPbU的团队。2019年，他在同样位于圣彼得堡的ITMO大学担任了一个新职位，带着他的许多学生，在那里他仍然是计算机技术中心基因组多样性实验室的教授和CSO。
与此同时，“俄罗斯开始传出普京相信美国正在开发针对俄罗斯的基于基因的武器的报道”，当局正在“组织一个不同的俄罗斯基因组项目，现在由普京的女儿领导，”奥莱克塞克说。该项目,据媒体报道该组织由玛丽亚·沃龙特索娃(Maria Vorontsova)领导女儿弗拉基米尔·普京总统。
“突然之间，当她宣布这个消息的时候，当报纸抱怨有一个美国领导人的时候，当我们发表第一篇数据论文的时候，人们对我和多布赞斯基中心的热情变坏了，”奥布莱恩说。
在ITMO大学，他的团队继续研究进化和比较基因组学，主要是动物物种，这些数据是免费和公开的。“我很乐意去做，即使是我认为很无聊的项目，因为我希望孩子们能站起来，希望他们得到实践，希望他们在西方寻找博士后工作时具有竞争力，”他说。他说，他以前在俄罗斯的许多学生最终都在国外找到了工作，包括美国、英国、法国、日本和南美。2020年疫情爆发时，情况变得更加困难，但研究仍在继续。
然而，在今年2月24日，“一切都变了，”他说。随着西方世界一致谴责俄罗斯入侵乌克兰，对俄罗斯实施制裁，期刊暗示他们可能停止发表俄罗斯科学家的研究成果，奥布莱恩说，他在ITMO大学的许多团队成员——据最新统计，大约有12人——以及其他在俄罗斯的同事决定离开俄罗斯。
他说，虽然Facebook和Twitter等西方社交媒体网络在俄罗斯被关闭，但“互联网仍在运行，大学里的人有vpn(虚拟专用网络)”，可以随时了解乌克兰战争的消息。
“我试图安慰他们，建议他们不要参加示威活动，因为他们会逮捕他们，”他说，这可能会导致长期监禁。他也一直在努力为他们在国外谋得职位。例如，他的一位前同事在佛罗里达州的一所大学获得了为期四个月的富布赖特奖学金。奥布莱恩说:“他是在最后几架飞往美国的飞机上离开的。”他现在正在考虑如何与仍在圣彼得堡的妻子再次见面。“事实是，我们所有人都感到无助。”
奥布莱恩说:“我认为基因组学(在俄罗斯)有未来，进展得不错，但2月24日之后，我不再指望它了。”
SPbU转化生物医学研究所的算法生物技术中心是另一个长期与西vwin德赢ac米兰合作方科学家合作的地方。成立于2014年在俄罗斯的巨额资助项目下，该项目目前由俄罗斯生物信息学家真主安拉Lapidus领导，他在美国工作了十多年，包括在联合基因组研究所担任了7年的小组组长。该机构此前由来自俄罗斯的加州大学圣地亚哥分校(University of California, San Diego)计算机科学与工程教授帕维尔·佩夫茨纳(Pavel Pevzner)领导。
自2017年以来，该中心的研究人员在圣彼得堡组织了一个名为“生物信息学:从算法到应用”的年度会议(BiATA)，吸引了包括美国、英国和加拿大在内的众多海外知名演讲者。经过两年的虚拟形式，这次会议本来应该是混合今年7月会议邀请了来自美国和德国的演讲者，但目前尚不清楚会议能否按计划进行。BiATA的组织者没有回应记者的置评请求，截至上周，有两位受邀演讲者还没有听说任何计划中的改变。
佩夫茨纳没有参与组织这次会议，他说，他预计对俄罗斯的制裁“将很快使俄罗斯的实验基因组研究完全停止”。
“更重要的是，入侵引发了受过教育的人才(包括生物学家和生物信息学家)的大量流失，他们最近逃往第比利斯、埃里温、伊斯坦布尔和其他几个仍有来自俄罗斯航班的城市，”他在本月早些时候的一封电子邮件中说。“所有这些人的下一步是在西方找工作。在我的一生中，我从未见过这么多俄罗斯生物信息学家试图在西方找到职位。”
D.是在战争开始时离开祖国的俄罗斯生物信息学家之一，他们没有确定的未来。他要求匿名，因为他所在的机构不知道他目前在亚美尼亚的下落，他最近在那里为自己的博士论文进行了答辩。
他已经有兴趣在国外攻读博士后，要么去美国，要么去法国，但当战争开始时，他不确定这是否还会是一个选择。“俄罗斯一直有一种非正式的惯例，‘如果你不喜欢，你随时可以离开，’”他说。“这个大会与一个可能糟糕但理智的政府合作。现在，我不确定这是否明智。”
虽然他认为俄罗斯今后不太可能禁止其科学家离开俄罗斯，但“这种可能性不是零，也不是可以忽略的，”他说。因此，他的选择是开放的——回到俄罗斯一段时间，或者直接去国外攻读博士后——并在目前的地点远程工作。他说:“我现在觉得很安全，如果我的博士后选择不起作用，我有一些应急计划。”
D.说，目前，他的团队与美国和法国科学家的合作仍在继续，尽管他相信美国的资助将很快停止。一周前，Gmail和YouTube在俄罗斯还在运行，而他在俄罗斯的同事们正在使用vpn来掌握最新消息。
他说，“科学家们明白俄罗斯科学家大多是反对战争的，这真的很好，尽管这些机构的负责人必须签署一些支持军事行动的文件。”“我甚至不确定他们是否愿意签字，但他们必须签字。”他说，他本人在几份反对战争的请愿书上签名，但他并不认为自己是政治活动家。
至于他的未来，他还不确定。“很难预测任何事情，”他说。“首先，炸弹必须停止下落，然后你可以环顾四周，试着了解情况。”
俄罗斯的其他研究人员则更直言不讳地表达了他们对战争的反对，他们常常冒着巨大的个人风险。俄罗斯政府已经拘留了数千名抗议者，并威胁将那些将俄罗斯在乌克兰的军事行动称为“战争”的人处以最高15年的监禁。
入侵之初，生物信息学家、斯科尔科沃科技学院(Skoltech)教授米哈伊尔·盖尔芬德(Mikhail Gelfand)帮助组织了一封俄罗斯科学家抗议战争的公开信。vwin德赢ac米兰合作
在一封电子邮件中，他说他认识的许多科学家都离开了俄罗斯，包括他的一些学生，他们现在在美国、土耳其、格鲁吉亚、以色列、黑山、塞尔维亚和捷克共和国等国家远程工作。“他们有不同的理由，在大多数情况下，这不是一次单程旅行，”他指出，不过这种情况可能会改变。“动机多种多样，但就(冲突的)最初几天而言，大部分动机是情感、个人或政治方面的。”
Gelfand说，现在推测这场战争对俄罗斯科学的中期或长期影响还为时过早，但他肯定不会回到入侵前的样子。“取而代之的是什么，没人知道，”他说。