纽约——一个美国研究团队利用转录组学数据集来识别可能有助于治疗COVID-19的现有药物。
首先，加州大学旧金山分校Marina Sirota实验室的研究人员从三项对感染SARS-CoV-2的人类细胞的研究中获得了基因表达谱，包括上调和下调的基因。然后，他们将其与培养的人类细胞中药物诱导基因表达的公开数据集进行比较。
Sirota实验室的研究科学家Tomiko Oskotsky周三在美国人类遗传学学会的虚拟会议上说:“我们的假设是，如果一种药物的基因表达特征与COVID-19相反，这种药物可能具有治疗作用。”
该算法将从SARS-CoV-2研究中提取的三种图谱与1300多种可用药物进行比较，为每种图谱-药物组合创建一个基因表达逆转评分。在102种命中的药物中，25种药物逆转了三种概况中的两种，4种药物逆转了三种概况:抗菌药物巴氨苄青霉素;氟哌啶醇，一种用于治疗精神分裂症的抗精神病药物;氯法齐明，一种用于治疗麻风病和结核病的药物;还有丙戊酸，一种用于治疗癫痫和双相情感障碍的精神药物。
奥斯科茨基说:“这些不是我们想到的治疗COVID-19的第一个(药物)，更不用说病毒感染了。”“所以，从三个转录组特征的分析中发现它们具有潜在的治疗作用是很有趣的。”
Sirota实验室的药物重新定位管道之前已经返回了治疗克罗恩病和早产的候选药物。由于全球COVID-19病例总数超过4400万例，而且大流行在几个大洲重新加速，对治疗的需求仍然紧迫。此前用于治疗埃博拉的雷姆德西韦(Remdesivir)已显示出前景，中和抗体正在研发中，但研究人员仍在寻找有助于减缓疫情蔓延的治疗方法。
在加州大学旧金山分校格拉德斯通研究所Melanie Ott的实验室和西奈山伊坎医学院Adolfo Garcia-Sastre的实验室进行的后续验证研究中，研究人员测试了25种药物中的16种，这些药物逆转了三种情况中的两种，根据它们的副作用情况和可用性选择。在这两个实验室之间，16种药物中的11种在两种人类细胞系试验中显示它们可以抑制病毒感染，氟哌啶醇、氯法齐明和环孢素都显示出病毒抑制作用。
Oskotsky指出，该研究在从实际COVID-19患者身上提取的转录组谱方面受到限制。只有一个档案是由病人样本生成的。
研究人员还将他们的研究结果发表在BioRxiv10月23日预印本, 2020年。
奥斯科茨基说，该小组计划研究联合疗法，并利用电子病历数据进一步探索针对COVID-19的药物重新定位。