纽约 - 热门渔民科学周三表示,它一直与螺旋和罗莎琳德合作,为SARS-COV-2开发一种新的基因分型方法,旨在加快识别出现的病毒新型变种。
该项目由国家生物医学成像和生物工程研究所的未公开金额作为国家卫生学院的一部分,以增加SARS-COV-2测试能力。
“我们的方法使得可以在明显更大的样品上进行监测测试,并迅速确定样品中存在哪种变体,”NIH Radx倡议的eIHRAD倡议的共同潜在研究人员中存在的样品中存在。“如果我们开始看到我们无法使用基因分析测定中的已知标记分配谱系的趋势,它是一种预警,即新的变体可能正在出现并有助于确定应向哪些样本进行测序。这是显着的,因为新兴变体有可能避毒疫苗,导致诊断测试性能问题,或引起更严重的疾病。“
1月,团队及其合作者发表了一个预印迹在Medrxiv描述基于PCR的方法,其允许SARS-COV-2的变异无关检测,并且可以将谱系分配给病毒变体。它还描述了如何使用该方法如何用于快速开发目前循环菌株的目标面板。
Rosalind的基于云的分析平台担任合作中的集中工具,以实时从实验室聚合和分析数据。Thermo Fisher表示,它已更新其Taqman SARS-COV-2突变面板,包括四个标记,可以检测omicron和delta变体。
根据该团队的说法,该方法可以在执行实时PCR的任何测试实验室中实现,并“允许在美国的SARS-COV-2监控努力进行大规模扩大。”从程序生成的数据将通过Rosalind Tracker网站获得。