纽约(基因组网)- Rheonix公司和纽约大学牙科学院的研究人员开发了一种基于核酸和抗体的寨卡病毒检测方法。
在最近的两项研究中,一个在《公共科学图书馆•综合》,另一个在可视化实验杂志(木星)这篇论文的作者、纽约大学牙科学院教授丹尼尔·马拉默德(Daniel Malamud)说,在美国,这种检测方法可以对病毒进行基于唾液的快速检测,同时还提供了有关感染时间的信息,这可能对临床医生有用,特别是在治疗孕妇方面。
也许更值得注意的是这种检测方法的开发过程,Malamud说,这种方法在未来可以轻松快速地应用于其他新出现的传染病。
事实上,寨卡病毒的工作源于Malamud的实验室和Rheonix之前的合作,双方开发了一种艾滋病毒测试,使用Rheonix的CARD卡带和Encompass optimal微流体系统,同时测试表明疾病的抗体和核酸。
在HIV病毒中,抗病毒抗体通常在感染后一周到10天出现,而HIV核酸出现得更早。血清学检测通常用于患者的初步诊断,如果检测结果为阴性,则转到核酸检测。然而,Malamud说,这些患者中有一部分从未完成后续检测,因此需要进行快速同步抗体-核酸检测。
此外,在资源有限的地区,基于pcr的检测可能过于昂贵,无法广泛使用。纽约大学- rheonix检测使用逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP),这通常比实时PCR更便宜。
寨卡病毒检测同样使用RT-LAMP检测病毒RNA。对于测试的免疫分析部分,研究人员使用高密度肽微阵列,其中包含完整的ZIKV蛋白,分为3,423个独特的肽,每个肽由15个独特的氨基酸和14个氨基酸重叠组成,以寻找宿主免疫球蛋白M (IgM)和免疫球蛋白G (IgG)的粘合剂。
同时检测寨卡病毒核酸和宿主抗体可以在疾病的各个阶段进行检测。与艾滋病毒一样,核酸首先出现,抗体反应随后出现,IgG抗体首先出现,然后是IgM抗体。
“如果你有这三种东西——核酸、IgG抗体和IgM抗体——你就有了感染的时间表,这对孕妇尤其重要。你可以问,你是什么时候被感染的,我们是怎么治疗你的?”马拉默说。
他说,与现有的检测方法相比,这种检测方法的速度也有了改进,特别是在血清学检测方面。他说,从寨卡病毒的常规血清学检测中获得结果可能需要数周时间,而纽约大学的核酸-抗体联合检测结果只需不到一个小时。
研究人员使用含有寨卡病毒的样本进行了大部分初步检测,但后来开始在实际患者样本中验证该测试。到目前为止,该测试已被证明是针对寨卡病毒的特异性测试,测试对象是可能出现类似症状的登革热等传染病患者。Malamud和他的合著者Maite Sabalza(纽约大学博士后研究员)现在正致力于在来自巴西和其他国家的其他患者样本中验证该测试。
Rheonix负责科学和临床事务的高级副总裁理查德·蒙塔尼亚(Richard Montagna)说,然而,从商业角度来看,这种测试可能更多地是一种概念验证,而不是一种实际的临床产品。
特别是“从美国公共卫生的角度来看,我认为大多数人都认为(寨卡)问题已经过去了,”他说。“当我们进入温暖的季节时,它是否会再次出现,我们不知道。因此,从市场的角度来看,目前是否还有市场存在,这是一个真正的问题。”
尽管如此,Montagna说公司已经收到了许多对测试感兴趣的人的询问。
“我们自己可能不会让它通过FDA,”他说。“但我们相信,我们已经有了一个框架,如果已经进入这个市场的人有兴趣,我们当然愿意与他们交谈。”
Montagna说,更重要的是,寨卡病毒检测和之前的HIV检测的发展表明,Rheonix及其纽约大学的合作者可以迅速开发出用于Encompass Optimum平台的核酸和血清学联合检测。
“从我们的立场来看,我认为最重要的信息是,我们经历的这个过程真的很短,”他说。“大概六到八周的时间,我们就完成了。让我们假设下一个新出现的传染病来了,甚至是再出现的传染病来了。我们可以迅速做出反应。”
Montagna说,寨卡病毒的研究工作是美国国家卫生研究院资助开发艾滋病毒检测的结果。公司收到了拨款,150万澳元小企业创新研究第二阶段资助,2015年。2016年收到656414美元SBIR第I/II期赠款用于寨卡工作。
Rheonix目前正在与美国食品和药物管理局(fda)合作进行研究,以支持其Encompass平台的临床版本,即Encompass MDx,以及初步的检测-淋病、衣原体和阴道的三倍性传播感染测试。
Montagna说,FDA最近批准了一项涵盖仪器和测试的内部和外部研究的方案,并补充说,该公司预计将在4月底完成内部研究,之后将开始外部试验。
他说:“我们在美国各地设立了12个收集点,我们还有四个测试点,我们将在那里运送仪器,让它们进行外部试验。”“因此,这将是第一次有希望的测试,不仅能让(FDA)批准仪器,而且还能批准化验方法。”