本文已从6月15日发布的版本更新，包括来自CLC Bio的其他信息。
CLC生物该公司本周宣布，它已与Ion Torrent和丹麦奥胡斯大学医院合作，开发一种用于基于测序的分子诊断的集成软件和硬件解决方案。
该项目从丹麦国家先进技术基金会获得了200万美元的资助。vwin德赢ac米兰合作
两家公司计划开发一个用户友好的IT基础设施，以分析高通量测序仪产生的数据，从而根据患者的DNA样本更快、更准确地分析和诊断患者。
该项目预计需要三年时间完成，旨在开发一种可用于分子诊断研究以及医院和门诊临床诊断的IT解决方案。
CLC Bio将修改其基于研究的Genomics Workbench和Genomics Server，以确保这些工具满足分子诊断工作流程的要求。
CLC首席执行官托马斯·克努森(Thomas Knudsen)表示，新软件的一个特点是安全的数据管理模块BioInform．有了这一功能，该软件将能够跟踪用户的活动，以便多个用户可以从头开始重新分析相同的数据。克努森说，这一功能还将确保该系统符合美国食品和药物管理局对诊断软件的要求。
其他模块将能够提供与疾病相关的基因活动的更专业的信息。例如，该软件将能够识别不同类型结肠癌的特定生物标记物，这些标记物表明该疾病的风险增加。
尽管该公司在这个项目上与Ion Torrent合作，就像其基于研究的对手一样，该软件将与多个平台上产生的序列数据一起工作。Knudsen说，这与CLC Bio平台独立的总体战略是一致的，这样它就可以处理来自快速发展的测序平台的数据集，并适应行业中的新参与者。
目前，该公司的通用研究软件可以处理Illumina、Life Technologies和Roche的测序仪产生的数据。今年2月，太平洋生物科学公司将CLC Bio列入合作伙伴名单，为其测序平台提供支持软件，该平台计划于今年下半年上市(BioInform 2/19/2010）.
此外，这并不是CLC Bio和Ion Torrent合作的第一个项目。今年早些时候，两家公司宣布，他们将合作确保CLC Bio的IT基础设施与Ion Torrent的测序平台兼容，该平台计划于今年晚些时候推出。BioInform 4/30/2010）.
球员们
除了与Ion Torrent合作外，Knudsen表示，该公司还将与奥胡斯大学医院的医生密切合作，以更好地了解诊断过程。
他说:“他们在这个项目中的作用是解释他们的工作流程，这样我们就可以在诊断过程中制作支持他们完整工作流程的软件。”“当然，这将(涉及)突变、基因组重排和基因重复。在分析方面，我们将研究患者DNA上的不同遗传特征，将相似患者与没有这些疾病的人进行比较。”
基于这些知识，CLC将为Genomics Workbench和Genomics Server创建“专门的扩展”。他说，这些扩展将自动分析患者数据，并提供有关疾病遗传联系的详细分析。
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Lasse Görlitz, CLC Bio的全球公关和营销负责人告诉记者BioInform在三年的时间里，该公司将开发一系列较小的模块，医院将使用匿名数据进行测试。
“我们将推出测试版，以便获得反馈。最终，在这三年的时间里，我们将拥有一整套适用于分子诊断的工具，”他说。
他补充说，该公司的目标是使软件对用户友好，这样买家就不需要有详细的信息学知识来操作它。该公司预计将在一年内推出更小的模块进行测试。
当它完成时，该软件将建立工作流管道来注册和分析产生的序列数据，将结果与存储在系统中的现有患者数据进行比较，并生成详细的报告。希望基于对数据集的分析，诊所能够做出最适合患者的治疗决策。
在记者发稿前，记者未能联系到Ion Torrent就其在合作中的角色发表评论。
无论是Knudsen还是Görlitz都不会直接评论Ion Torrent在开发软件中的具体角色，以及为什么该公司被选为该项目，尽管Knudsen确实指出，Ion Torrent声称其音序仪将减少运行时间到一到两个小时，而不是其他技术的一周。
他说:“如果病人患有某种急性疾病，(你希望)在几个小时内得到答案，而不是等上一周。”
CLC预计，一旦它的软件准备好进入市场，它将被全球的医院和诊所采用。
Görlitz说:“我认为最终你会在每个PI的办公室里看到某种测序仪器和一台小型计算机。”