圣地亚哥-基因根据宾夕法尼亚大学进行的全基因组关联研究的结果,慢性阻塞性肺疾病的危险因素在男性和女性之间存在很大差异。
宾夕法尼亚大学的一名研究人员周三在美国医学信息协会年度研讨会上发表的一篇论文中公布了这一结果。AMIA出版其所有科学会议的同行评议文集。
尽管吸烟是慢性阻塞性肺病的主要危险因素,遗传因素也有助于肺功能和疾病风险。之前的GWAS,比如这项研究,基于英国生物银行的数据,回到直到2015年-也发现了与慢性阻塞性肺病相关的变异,但他们没有按患者的性别检查风险因素。
宾夕法尼亚大学生物统计、流行病学和信息学的博士后研究员Jaehyun Joo说,女性吸烟可能与男性有不同的COPD风险因素,需要不同的治疗。
Joo和他的同事从英国生物银行的数据中,对12958名慢性阻塞性肺病患者和11311名女性患者进行了性别分层GWAS,另外还有大约20万名对照组。他们开发了一种名为SnpSetTest的基于r的软件工具,在经过一些修改后,在基于通用基因的关联研究(VEGAS)之后进行分析。维加斯的方法是第一个在2010年出版澳大利亚研究人员。
“这个包使用了一种不同于原始VEGAS实现的方法来更有效地计算集级p值。软件下载页面.
除了运行VEGAS分析,宾夕法尼亚大学的团队还使用SnpSetTest将snp水平的GWAS结果与这项由美国国立卫生研究院资助的基于基因的研究结果进行比较。
先前的研究使用NIH COPDGene队列,一个10,000名受试者,高表现型队列的吸烟者,患有和不患有慢性阻塞性肺病,发现与性别相关的遗传因素表明女性患严重的,早发性慢性阻塞性肺病的高风险,但根据研究人员的说法,关于基因如何影响慢性阻塞性肺病的性别分化的研究还很少。
此外,过去的观察性研究发现,吸烟者肺功能下降和戒烟后肺功能恢复存在性别差异,女性通常比男性更快地出现这些现象。
Joo和他的同事推测,这些差异可能有遗传基础。他说:“目前缺乏针对性别的遗传风险因素的研究。”
GWAS揭示了17个男性“重要的”全基因组位点,14个女性,Joo说。其中9个位点在女性和男性中重叠,8个位点专门针对男性的COPD风险,5个位点针对女性。值得注意的是,在男性中,染色体5q31.1区域上的C5orf56位点“令人信服地与COPD相关”,但在女性中完全没有,研究人员报告说。
他们在CFDP1、TMEM170A和CHST6中发现了其他强烈的男性特异性关联。在ASTN2和TRIM32中,女性特异性关联最强。宾夕法尼亚大学的研究人员称这些“有望在功能研究中进行研究,以更好地理解慢性阻塞性肺病的性别二型性”。
他们写道:“虽然大多数关联是在性别之间共享的,但也有几个地区具有性别特异性。”
研究人员说,他们没有从功能上验证性别特异性基因成分来支持他们的统计结果。“未来的实验研究可以探索我们的发现,阐明观察到的差异背后的机制,”他们写道。
在他的AMIA演讲中,Joo还指出,英国生物银行的数据缺乏种族多样性,研究队列几乎全部由欧洲血统的人组成。