德国分子诊断公司curretis推出了一家子公司，该公司预计将为其核心的传染病诊断业务做出贡献，同时将公司推向新的应用领域，并扩大合作机会。
的新的子公司该公司名为Ares Genetics，总部位于奥地利维也纳，将利用细菌基因组数据库来识别抗生素耐药性标记，并开发用于解释和治疗指导的信息学。它还计划将该数据库授权给制药公司用于药物开发。
2014年西门子将其微生物业务出售给Beckman Coulter, curretis从西门子手中收购了遗传抗生素耐药性和易感性数据库(GEAR)后，决定成立Ares Genetics。该数据库包含超过1.1万个细菌的基因组序列数据，以及这些菌株对21种不同抗生素的耐药性信息。
该公司对利用该数据库进行现有业务很感兴趣。该公司已经使用其基于pcr的Unyvero平台筛选了一些抗生素耐药性标记，并认为GEAR数据库对于识别新的生物标记物并纳入其分析至关重要。但是，该公司也发现了其他潜在的商业机会，包括将数据库用于研究耐药机制、药物开发和制定治疗决策报告的研究目的。
curretis首席商务官阿希姆•普拉姆(Achim Plum)表示:“这让我们想到，围绕GEAR有一种完全不同、更广泛的商业模式，它有自己的风险-收益配置，这让我们得出结论，我们宁愿在子公司中追求这种模式。”普拉姆将兼任Ares董事总经理。
curretis还利用了Andreas Posch的专业知识，他于3月份从西门子加入curretis。波施是西门子生物信息学主管，负责GEAR项目。普拉姆和波施现在正在Ares公司组建一个小型核心团队。
Plum说，在短期内，Ares将专注于使用GEAR中的数据来识别和验证抗生素耐药性标记，Curetis可以将这些标记纳入其分子诊断测试中。普拉姆说，该公司基于PCR技术的Unyvero平台已经包含了一些抗生素耐药性标记，但该公vwin德赢ac米兰合作司计划增加这些标记。
尽管GEAR中的数据都是使用下一代测序技术生成的，但Plum说，在短期内，curretis没有计划将其PCR测试迁移到NGS。vwin德赢ac米兰合作Plum预计，从数据库中识别出的生物标志物可以在两到三年内开始纳入Curetis的测试中。
Plum说，同样在近期或中期，Ares计划以某种公私合作伙伴关系的形式，将该数据库作为学术和临床研究界的研究平台，使研究人员能够使用该数据库研究耐药性机制。
其中一个合作伙伴将是萨尔大学临床生物信息学小组负责人安德烈亚斯·凯勒(Andreas Keller)。Plum表示，Keller的团队与西门子合作开发了GEAR数据库，并将继续与curretis合作进一步开发它。
普拉姆说，另一个中期目标将是与制药公司达成研发和许可协议，这些公司可以利用GEAR数据库开发更好的药物。他说，一旦“GEAR数据库中描述了作用机制，并且知道了微生物中产生耐药性的原因，这将是药物研究开发更有效药物的良好起点。”
Posch说，从长远来看，该公司计划开发基于GEAR的解释工具，这样就可以对临床标本进行测序，与数据库进行比较，并快速确定耐药性谱。
Posch说，开发这样的工具还需要进一步的开发。例如，“该数据库是从细菌分离物开发出来的，因此仍有必要进行一些开发，使其适用于真正的临床标本，”他说。例如，宏基因组NGS测序是一个快速发展的领域，因此数据库理想情况下能够处理这样的样本，其中不仅包括致病病原体的基因组数据，还包括患者携带的非致病菌的基因组数据，他说。
Plum说，在这种类型的应用中，Ares将作为生物信息学公司，为开发基于ngs的测试的诊断公司开发功能。
Plum说:“这种产品的开发在合理的时间框架内是可行的，但这种产品的采用在一定程度上取决于将NGS作为传染病检测的常规前线技术的市场，这可能还需要几年的时间。”vwin德赢ac米兰合作
Plum预计，即使基于ngs的传染病检测市场增长，它也不会很快取代基于pcr的检测。他说，这些技术将与基于ngs的检测共存，最初用于有问题和难以诊断的病例。尽管Plum表示，curretis并没有转向基于ngs的测试的计划，但随着市场朝着这个方向发展，Ares提供的解读产品将成为该领域的战略足迹。
随着基于ngs的传染病检测市场的增长，像GEAR这样的数据库可以在快速识别致病病原体方面发挥重要作用，并从基因组数据中获得完整的耐药性概况。但这并不是为这一目的而开发的唯一数据库。
的数据库就是这样一个数据库综合抗生素耐药性数据库(CARD)，由加拿大麦克马斯特大学的研究人员开发。CARD数据库包括策划的参考序列，截至2016年8月，它包括2441个模型参考序列，以及850多个与抗性相关的snp。同时包含2260个抗性检测模型，其中大部分为蛋白同源模型。
国家生物技术信息中心也有一个病原体检测项目，其重点是对vwin德赢ac米兰合作引起食源性疾病的四种细菌群进行测序。与此同时，例如，其他生物信息学管道是针对病原体的TBProfiler这是一种治疗结核病的药物。
在欧洲，由政府资助的欧洲抗菌素耐药性监测网络一直在收集抗菌素耐药性数据，牛津大学的一个团队正在开发一种名为Mykrobe预测鉴定细菌种类及耐药谱。
Posch说，Ares的目标主要是通过GEAR数据库的庞大范围使自己与众不同，该数据库不仅包括超过1.1万种病原体的全基因组测序数据，还包括“抗生素敏感性的全面表型数据”。因此，GEAR“今天已经使我们能够监测过去30年耐抗生素病原体的出现和传播，并包含了许多新的耐药遗传机制的数据，”他补充说。