芝加哥-在经历了2020年的增长之后，荷兰生物信息公司Enpicom将2021年视为多元化进入多组学的一年，并开始释放个性化医疗的一些希望，同时其客户将继续应对COVID-19大流行。
总部位于荷兰s'Hertogenbosch的Enpicom公司开发了一种名为免疫基因组(IGX)的生物信息技术，这是一种基于云的软件即服务(SaaSvwin德赢ac米兰合作)平台，用于管理、存储、分析、可视化和解释T和B细胞序列数据。虽然它可以整合来自其他来源的信息，但它是专门用于处理分子免疫组学数据的。
该公司发言人表示:“SaaS方法消除了部署时间，大幅降低了维护成本，并确保用户始终能够访问最新版本的IGX平台。”
去年11月，Enpicom扩大了与Neogene Therapeutics的合作关系1.1亿美元A轮融资该公司正在采用IGX来管理和分析T细胞测序数据。Enpicom表示，他们已经定制了自己的平台，以帮助技术适应位于阿姆斯特丹的Neogene公司的工作流程。vwin德赢ac米兰合作
上个月，Enpicom和MiLaboratories宣布建立战略伙伴关系将millaboratories的MiXCR免疫序列测序软件集成到IGX中。位于加州索拉纳海滩的millaboratories生产一种人类T细胞受体分析试剂盒，免疫细胞分析服务，以及分析免疫细胞分析的软件工具和算法。
Enpicom于2017年由首席执行官Jos Lunenberg、CTO Alvise Trevisan和CSO Nicola Bonzanni成立，是一家有限责任公司，两年前从阿姆斯特丹自由大学分离出来。该公司目前约有30名员工。
根据Lunenberg的说法，用于处理基因组其他部分的算法并不适用于免疫组学数据。“这一小段DNA或RNA是独一无二的，因为它是如此的多样化，”他说。
鲁南伯格说:“有机会把一些独特的东西推向市场，因为有很多公司专注于基因组的其他部分。”他指出，免疫治疗和抗体开发目前是制药业快速增长的领域，部分原因是全球都在竞相开发和管理有效的COVID-19疫苗。
卢尼伯格说:“任何对免疫学感兴趣的人，无论是从基本的转译到更多的临床，还是与免疫疗法的开发或发现有潜在关系的人，都可以从我们的产品中受益。”
Bonzanni说，Neogene公司正在尝试开发使用T细胞受体的个性化疗法。
“当然，这带来了许多挑战，”他说，其中最重要的是数据管理，因为当必须查看每个个体的序列时，数据量会激增。
“在此基础上，他们提出了一个基于免疫基因组学的主张。他们开发了tcr……因此他们需要一个专门的系统来处理这类数据，”Bonzanni说。
“这就是我们的平台的亮点所在，因为它不是一个通用基因组平台。它是一个组织这种特定数据的平台。”
Lunenberg指出，Neogene只是新兴抗原治疗开发市场上的一家公司，尽管该公司最近因筹资而上了新闻。
Enpicom本身是由风险投资投资的，最近在2020年5月又追加了110万欧元(140万美元)的a轮融资，该轮融资为120万欧元2019年3月关闭．
该公司也收到了一些奖助金来自欧盟委员会和个别欧洲国家和地区。
今年9月，Enpicom在精准医疗领域又向前迈进了一步，宣布玛格丽特公主癌症中心(位于多伦多的大学健康网络的一部分)成为IGX的用户。具体来说，玛格丽特公主高级科学家特雷弗·普厄的实验室希望将全面基因组分析作为常规临床测试的一部分，为癌症患者选择治疗方法。
根据Enpicom，普尤实验室正试图了解克隆转移在癌症和非癌症细胞中的临床意义，使用的技术包括细胞游离DNA、免疫库测序和单细胞RNA测序。Pugh在一份声明中说:“IGX为我们提供了灵活性、易用性、数据集成和数据共享的可能性——我们认为所有这些标准都对适当支持我们的科学工作极为重要。”
像玛格丽特公主癌症中心这样大的机构——以及它们所属的国际科学协会——都需要数据管理和共享能力，Lunenberg说。
“抗体开发人员也是如此，”他说。“在抗体开发领域，有很多服务提供商也需要能够与客户分享他们的发现工作结果。”
Lunenberg说，IGX的数据管理能力“广泛适用”。
Enpicom发布版本2.02020年4月。该版本支持单细胞测序数据和批量测序数据工作流。
V2.0的增强包括IGX-Compare应用程序，它允许用户比较任意两个数据集，以可视化和优先级匹配克隆;以及更广泛的数据支持，支持从10x Genomics或Adaptive Biotechnologies上传易于注释的克隆表。该公司表示，新版本还具有更多的克隆型分组定义和V/J基因使用绘图。
另一个平台更新预计在今年年初。Enpicom表示，它将“进一步扩展可用的功能，为抗体开发人员提供直观的端到端解决方案。”
Bonzanni表示，在2021年，Enpicom将通过发布一个模块，最终包含三个不同的应用程序，来整合更多的下游分析。他没有提供更多细节。
然而，邦赞尼也表示，Compare被证明在开发COVID-19疗法和疫苗方面是有用的。例如，研究人员可能会研究免疫系统中的某些东西是否可以解释为什么一些感染新型冠状病毒的患者出现严重症状，而另一些则没有。
“Compare应用程序可以让你比较大量的序列，”Bonzanni说。他解释说，这很重要，因为在免疫组学中没有真正的参考基因组。
“可能有数十亿种可能性。没有一个完整的参考数据库，你可以直接去那里查看。这就是为什么你需要这种特殊的算法，”Bonzanni说。
Bonzanni继续说:“它允许你在不同的个体、不同的样本、不同的剧目和不同的免疫系统之间进行比较。”“了解其中的差异是潜在开发新疫苗或诊断方法的关键。”
Enpicom软件目前完全面向研究人员，但Bonzanni指出，该公司最终希望将其软件应用到临床环境中。
免疫组学和免疫基因组学现在可能代表着小众空间，但Enpicom预计这些相关领域在不久的将来将呈指数级增长。
“我们的免疫系统保存了我们所有疾病的历史。它就像是所有这些疾病的图书馆，”Bonzanni说。它也为那些克服了这些条件的人提供了“解决方案”的概要。
邦赞尼解释说:“你可以想象一个未来，这个未来可能会很遥远，也可能不会很遥远。在这个未来，你可以观察一个人的免疫系统，也许可以发现这个人过去得过什么病，”而且将来可能会得什么病。