植物相关微生物基因本体论增加了超过700字的持续三年的基因本体论术语发展计划，并将其作为八篇论文的一部分在BMC微生物学的特别增刊中提出。
PAMGO联盟开发本体论的目标是解决微生物-宿主相互作用领域词汇的缺乏，并帮助研究人员更好地挖掘全基因组序列，并允许他们进行跨基因组分析。
PAMGO是一个成立于2004年的多机构合作项目，包括弗吉尼亚理工学院和州立大学的弗吉尼亚生物信息研究所;马里兰大学医学院基因组科学研究所;康奈尔大学;北卡罗来纳州立大学;威斯康星大学麦迪逊分校;纽约州奥罗拉的威尔斯学院;以及英国的欧洲生物信息研究所。
通过开发新的GO术语，科学家们希望改善来自基因组序列和高通量微阵列的数据挖掘结果，以及揭示微生物和宿主的蛋白质组学分析。
PAMGO项目负责人、八篇论文中的五篇的合著者、弗吉尼亚生物信息学研究所研究员布雷特·泰勒说:“社区驱动的基因本论资源是向前迈出的一大步，它允许研究人员在微生物物种之间对微生物-宿主环境相互作用中涉及的许多过程进行比较。”
他补充说，他希望科学界能够根据自己的研究成果为这种受控词汇做出贡献。
密西西比州立大学兽医学院的研究员菲奥娜·麦卡锡说:“对传染病研究人员来说，将GO扩展到包括特定于病原体功能的术语是一个分水岭。”她不是PAMGO项目的成员，而是基因本体论联盟的成员，该联盟致力于本体论的开发。“现在我们可以使用现有的GO工具来功能模拟宿主-病原体的相互作用，”她补充说。
——维维安·马克思
生物信息学的笔记
牛津基因技术公司正在与Ovwin德赢ac米兰合作ptra系统公司合作。这项合作旨在可视化和分析来自高分辨率扫描仪的数据，目前正处于初始软件开发的测试阶段。
Genedata和先正达正在就LC-MS和GC-MS代谢组学原始数据处理和分析的生物标志物发现进行合作。先正达增加了Genedata的Refiner MS，以将质谱数据集成到生物标志物发现项目中。
非营利研究组织国家基因组资源中心将与基因技术公司Floragenex合作。vwin德赢ac米兰合作Floragenex将把其专有的基因组发现和应用工具带到NCGR的测序和生物信息学能力中。
数据点
500万美元
遗传学公司为正在进行的扩张计划筹集的资金。
资助基金
419585美元/ 2008财政年度
生物网络:系统生物学的集成环境
受助人:Michael Baitaluk，圣地亚哥超级计算机中心
开幕时间:2008年9月15日;截止日期:2012年6月30日
这笔赠款将帮助将生物网络(Keck研究生院和圣地亚哥超级计算机中心开发的生物医学分析环境)扩展为模块化、可扩展的软件平台，在该平台上可以有效地管理和集成更广泛的复杂生物数据。
145105美元/ 2008财政年度
基因组数据中有效推论的统计算法
受助人:乔治·卡塞拉，佛罗里达大学
开始时间:2008年9月1日;截止日期:2011年8月31日
Casella将利用这笔资金开发适用于SNP关联遗传学的数据方法，以及基于贝叶斯层次模型和Metropolis-Hastings搜索算法的时间过程数据的聚类方法，具体目标是开发一种新的分类器，将聚类或基因模式与临床结果相关联。