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两台新的生命科学计算机在最新的世界最快超级计算机Top500排行榜上首次亮相，加入了另外三台超过24.7万亿次浮点运算基准的生命科学机器的行列，进入了当前版本的两年一次的榜单。
其中一个新系统是一个8,640核的系统，位于乔治亚理工学院的系统生物学研究中心，由企鹅计算公司建造。vwin德赢ac米兰合作这台计算机在Top500榜单上排名第98位，每秒运算53.1万亿次。系统生物学中心的负责人杰弗里·斯科尔尼克(Jeffrey Skolnick)正在使用该系统对蛋白质和细胞模型进行大规模计算机模拟。
另一个新项目是一个35.8万亿次浮点运算，4000核的戴尔系统“角斗士”，今年早些时候安装在霍华德休斯医学研究所的Janelia农场园区，以支持一系列生命科学研究活动。
太平洋西北国家实验室环境分子科学实验室的一台97.1万亿次浮点运算，18176核的惠普集群仍然是榜单上最快的生命科学机器，从去年11月发布的上一版排名的48位下降到第57位。BioInform 12/4/2009）.
另外两个生命科学系统仍未进入11月份的榜单:东京大学人类基因组中心的太阳微系统(Sun Microsystems)刀片系统，其运算速度为54万亿次浮点运算，核数为5,760个，从半年前的84位降至现在的96位;亚利桑那州立大学和转化基因组研究所的30.1万亿次浮点运算的戴尔系统，从最近的排名第222位跌至第332位(列表中生命科学系统的详细信息见表1）.
去年11月，健康信息公司Cerner的一个24万亿次浮点运算、5712个核的惠普集群在去年11月的榜单上排名第375位，但目前的版本没有达到24.7万亿次浮点运算的标准。
目前世界上运算速度最快的机器仍然是位于美国能源部橡树岭领导计算中心的“美洲虎”Cray XT5超级计算机，其最高运算速度为每秒1.75千万亿次，理论峰值运算能力为每秒2.3千万亿次。
一个新系统，中国的“星云”，首次出现在第二位。这台机器位于中国深圳的国家超级计算中心，采用曙光TC3600 Blade系统，搭载英特尔X5650处理器和英伟达特斯拉C2050 gpu。在Linpack基准测试中，它达到了每秒1.271千万亿次，这使它在Top500榜单上落后于捷豹，但它的GPU加速器使它在理论峰值能力方面优于捷豹，这是Top500榜单上的最高水平，接近每秒3千万亿次。
IBM和惠普仍然是超级计算机的主要供应商。在11月份的榜单中，惠普稍稍失去了对IBM的领先优势，目前在500强系统中占有185个席位，而IBM占有198个。六个月前，惠普的安装系统为210套，IBM为186套。
Cray和戴尔紧随其后，分别有21台和17台上榜。制造商排名详见表2）.
集群仍然是Top500榜单中最受欢迎的系统架构，目前有424个基于集群的系统上榜，而半年前只有417个(具体请参见下面的表3）.
英特尔处理器占主导地位，目前有406台机器使用英特尔芯片，而六个月前只有402台。AMD宣称有49套系统，高于6个月前的42套;IBM Power处理器从11月的52个下降到目前的42个(具体请参见下面的表4）.
在操作系统方面，Linux现在占据了Top500中所有机器的91%，有455个系统，而去年11月的排名是446个。Unix系统紧随其后，有22个系统上榜，其次是“混合”操作系统，有17个。
完整的Top500排名是可用的在这里．
