芝加哥-杰克逊实验室已经转向微软的人工智能技术来管理其快速发展vwin德赢ac米兰合作Jax临床知识库(CKB)，希望为癌症治疗提供最新的临床见解。这种合作也有助于为研究工作提供信息。
具体来说，Jax正在应用微软的人工智能产品“汉诺威计划”(Project Hanover)，该产品依靠机器阅读、深度学习和基于概率的逻辑，使肿瘤委员会能够在不断扩大的生物医学研究领域中进行分类，寻找合适的癌症治疗方法。总部位于华盛顿雷德蒙德的微软公司表示，这项技术有助于人类管理员“不遗漏任何事实”。vwin德赢ac米兰合作
微软医疗保健公司副总裁Peter Lee上周在拉斯维加斯的HLTH会议上宣布了这次合作，微软在一篇博客文章中分享了他的一些想法。
李在帖子中说:“对于像癌症治疗这样真正重要的事情，每天都有数千篇新的研究论文发表，我们实际上有机会让机器阅读所有的论文，并帮助癌症专家委员会回答有关最新研究的问题。”
在贾克斯大学汉诺威的一项研究中，一位人类管理员从823篇提及该药物的科学论文样本中，只提取了两名患者对一种针对特定突变的药物的相关反应。据位于缅因州巴尔港(Bar Harbor)的实验室临床基因组市场开发副主任苏珊·莫卡斯(Susan Mockus)说，汉诺威在几秒钟内将论文堆减少到43篇，并能够提取23条有关患者反应的相关信息。
“效率、规模和相关性，所有这些组成部分使汉诺威平台如此强大，”在康涅狄格州法明顿的杰克逊基因组医学实验室工作的莫卡斯说。
莫卡斯说，Jax和微软目前正在撰写他们的研究结果，准备提交给至少一家未指明的学术期刊。
Jax CKB包含有关癌症相关基因突变、癌症药物和患者对这些药物反应的结构化数据。这个知识库帮助临床医生和研究人员将突变信息与潜在的治疗方法和临床试验相匹配。
然而，正如许多其他生物医学研究机构一样，Jax一直在努力跟上PubMed每天索引的约4000篇新论文，其中约200篇与癌症有关，Mockus说。
汉诺威计划帮助贾克斯对文献进行分类。“阅读和查找相关论文并不能很好地利用主题专业知识。我们可以用机器使这一过程自动化。”
汉诺威对每篇论文的相关性进行了排名。由于它不代表临床医生做出决定，Jax的策展人和临床医生以及与之合作的提供者组织可以直接获得潜在相关的文献，只检查少数候选论文。
莫卡斯说:“这确实帮助球队提高了效率。”
到目前为止，Jax在小范围内实现了微软的技术。vwin德赢ac米兰合作她说:“这是我们拥有高精确度和高召回率的时刻。”“我们已经用它从汉诺威的产品中手动提取(知识)，现在他们正在构建工具，使其自动进入临床知识库的工作流程。”
Jackson实验室于2014年开始构建CKB，并于两年后启动，以支持对来自其内部基因组实验室的数据的解释。
莫卡斯说:“当我们开始建立这个数据库时，我们知道这是一个很好的工具，我们想在社区内分享它，让肿瘤医生也能做出决定。”“但我一直知道，规模会有问题。”
莫卡斯说，一位同事把她介绍给了汉诺威计划的首席研究员Hoifong Poon，认为他有可能解决规模问题。
Poon说，这次合作将使微软和Jax通过突破因文献数量庞大而导致的分子数据解释的瓶颈，探索“现实世界证据的新前沿”。
微软研究运营的精确健康自然语言处理主管Poon说，人类擅长策划和识别文本和数据集的相关部分。然而，要跟上每天在PubMed上出现的成千上万篇新的生物医学论文的步伐，他们在这种规模上做得并不那么好。
“人类和计算机实际上有很多互补的方面，”潘说。
他把汉诺威比作自动化的大海捞针。
他说:“大部分干草堆实际上看起来一点也不像针，所以这就是人工智能可以发挥作用的地方。”“尽管机器阅读在这一点上还远远不够完美，但它实际上可能非常好……可以剔除很多不相关的东西，然后把焦点放在实际上看起来像是针的候选者上。”
这允许用户将他们的手工工作缩小到这个候选列表中。“他们专注于验证每个候选事实是否确实正确”，并值得提交给肿瘤委员会进行解释，潘说。
其中一个用户是缅因州癌症基因组学计划(MCGI)，这是一个jax运行的项目，与缅因州的卫生系统和肿瘤学实践合作，提供体细胞检测结果和解释服务。
MCGI成立于2016年，自2017年以来一直在招募患者，一直在使用临床知识库帮助生成报告，并向代表其成员医院召开会议的肿瘤委员会提供信息。它登记了1100名患者，大多数来自人口稀少的地区，那里基本上是一个农村州，没有学术肿瘤学临床实践。
MCGI医学总监Jens Rueter是缅因州布鲁尔农村地区的一名实习肿瘤学家，他说:“有了基于人工智能的系统的支持，最终将是有帮助的，因为它以更快、更高效和有效的方式筛选所有信息，所以最终你真的能在你需要的时候获得个人患者的最新信息。”
Rueter说:“如果你今天做肿瘤检查，而检查结果是一周前提交的，这是一种相当常见的情况，那么你就想知道今天的最新信息，而不是一周前的。”“你会想知道在这一周的时间里积累了什么证据。”
据Rueter说，MCGI实际上正在记录基因组肿瘤委员会的讨论记录，并将这些记录分发给临床医生，以便在决策过程中添加主观成分。他说，临床医生经常利用会议记录向付款人证明基因组知情治疗的合理性，尤其是适应症外处方。
Rueter表示，全州范围内的项目正在与Jax合作，设计将结果信息纳入CKB的策略。“我可以想象，在未来，这些经验数据也可以反馈到任何类型的人工智能算法中，”他补充说。
当然，微软是数十家甚至数百家提供医学文献梳理技术的公司之一。vwin德赢ac米兰合作
莫卡斯说，汉诺威不仅仅是提供药物名称来验证文献的相关性，而是做得更深入，但它并没有试图成为一种包罗万象的技术，承诺提出临床建议。vwin德赢ac米兰合作她说，这不仅仅是一个“黑盒子”，策展人知道这个系统向他们展示了什么。
潘说，策展人在寻找突变和潜在治疗方法之间的关系方面最需要帮助，比如肿瘤中的突变对某种特定药物是敏感还是耐药。
生物医学之外的自然语言处理倾向于研究二元关系或文本中的单个短语，但医学太过复杂，无法处理如此简单的概念。
“我们需要超越二进制读取”，并开始考虑癌症类型和证据类型，潘说。
“覆盖面真的很重要，因为如果你错过了一个事实，可能意味着病人的生或死，”潘说。“你真的没有很多冗余，因为你最有价值的事实可能只在这篇论文中提到过一次，所以我们真的需要解决这个更复杂的语言现象。”
Mockus说，目前jax和微软的合作只专注于实体和血液肿瘤的体细胞突变，但未来有可能扩大范围。
例如，她设想利用汉诺威研究表观遗传学和微生物群系可能对肿瘤药物产生的影响。莫卡斯说:“临床知识库非常适合整合这些内容，但我们还是需要汉诺威帮助我们确定相关内容。”