本文已更新,以包括弗雷德里克健康正在集成的实验室的完整列表。
芝加哥——在引进一年后基因组学附加到其核心平台,电子健康记录供应商Meditech开始向客户介绍这项名为“浩瀚基因组”的技术。vwin德赢ac米兰合作至少有一个早期采用者对以太坊有很大的计划,以太坊旨在在标准的临床工作流程中,为临床医生提供基于基因检测的可操作结果。
今年第一季度,位于马萨诸塞州韦斯特伍德的Meditech公司与位于密苏里州克林顿市的金谷纪念医疗保健公司(Golden Valley Memorial Healthcare)一起投入使用。Meditech实验室信息系统和基因组学产品经理Jennifer Ford表示,Golden Valley主要将该技术用于肿瘤学的药物基因组学。vwin德赢ac米兰合作
马里兰州弗雷德里克的医疗系统弗雷德里克健康公司(Frederick Health)将于今年春天与浩瀚基因组公司(Expanse Genomics)合作,成为第二个采用该附加组件的组织。该公司预计,Meditech将在一两年内全面支持整个组织范围内的精准医疗计划,不过该计划将分阶段推出。
Frederick首席信息官Jackie Rice指出,对从业者来说,转向浩瀚基因组公司将是一次“文化变革”,因此卫生系统的精准医疗项目面临着艰巨的教育任务。为了让临床医生更容易适应这种变化,它最初将使用有限数量的用例。
弗雷德里克精准医学和遗传学临床主任帕特里夏·赖斯(Patricia Rice)说:“我们必须采取循序渐进的方法,这样我们就不会把这些基因信息放在人们面前,让他们感到不舒服。”
玛莎·费林(Marsha fears)是Meditech公司的内科专家,她的任务是让临床医生了解浩瀚基因公司(Expanse Genomics),并对他们进行培训。她说,外科医生经常声称他们不需要了解遗传学。“不,你需要,”她坚持说。“如果你的病人有rrr -1突变,如果你给他们使用琥珀胆碱作为麻醉剂,他们就有患恶性高热的风险。”
弗雷德里克的精准医学和遗传学项目包括肿瘤学、神经学和心脏病学的遗传遗传学,卫生系统正在众多专业领域加强药物基因组学。据注册护士杰基·赖斯(Jackie Rice)说,该项目还包括以精准医疗为重点的临床试验。
虽然弗雷德里克健康是一个社区卫生系统,但它通过与包括总部位于休斯顿的MD安德森癌症中心在内的组织合作,有一个临床试验项目。
“Gene-informed方法”
通过浩瀚基因组公司,Meditech将在每位患者的电子图表的前面显示基因组信息。帕特里夏·赖斯表示,任何具有临床意义的项目都将在系统中进行标记。
“我们必须非常小心,”她说。“真正了解遗传学的提供者并不多,除非他们刚刚从医学院毕业,所以我们有一个很大的议程摆在我们面前,那就是教育他们,让他们在使用这些基因数据时感到舒服。”
弗雷德里克健康公司希望为临床医生提供帕特里夏·赖斯所说的“基因知情方法”,以照顾每个病人。“这就是为什么我们对精准医疗和遗传学项目采取了如此广泛的立场。”
她指出,该组织的药房主任已经聘请了一名药学博士,就药物基因组学决策与处方者进行磋商,最初是在行为健康方面。她预计,这位将于7月上任的新员工,将通过介入解释为什么EHR会因为潜在的药物基因相互作用而标记处方,从而减少药物失败和医院再入院,从而为弗雷德里克健康公司和患者节省资金。
福特说:“我们会在医生下订单之前阻止他们,给他们一些应该做什么的教育,”比如联系药剂师。“我们希望确保我们提前完成了检查。”
帕特里夏·赖斯(Patricia Rice)说,通常由卫生系统内的每个部门决定进行哪种基因检测,不过她和精准医疗项目的其他人可以提供指导。
Frederick Health还致力于教育付款人基因组学对预防服务和患者安全的好处。杰基·赖斯说:“最终,这将使支付人为预防健康买单更有意义。”“付款人还没到。”
互操作性问题
据Patricia Rice介绍,尽管Frederick Health拥有众多分子实验室合作伙伴,但该组织最初将与Caris Life Sciences、Ambry Genetics、Foundation Medicine、Pro-GeneX和NeoGenomics Laboratories整合,这主要是因为这些公司在将患者与临床试验相匹配方面经验丰富。
“我们将允许Frederick与这些实验室连接,简化他们的工作流程,以便与实验室连接,然后整理数据,”Meditech的Ford说。
这些实验室连接是Meditech计划的一部分,目的是克服电子病历供应商的一些问题支持临床基因组学在他们的系统中。然而,他们没有解决缺乏明确的行业标准用于在电子病历中显示基因型。
福特说,国际健康等级7 (HL7)标准在历史上已经“失效”,因为电子病历无法区分生殖系和体细胞突变。浩瀚基因公司承诺解决这一差距。
身为儿科医生、生物化学遗传学家和临床遗传学家的费林说:“能够区分生殖细胞和体细胞突变,你知道我一生中花了多少时间来阅读报告,弄清楚这种(突变)是从哪里来的吗?”“仅此一个简单的常识,就能为肿瘤学家节省很多时间。”
福特说,Meditech花了五年时间确保结构化的基因组数据进入电子病历,并与参考实验室建立个人联系。Meditech依赖HL7接口标准将报告从实验室转移到EHR,但供应商还使用来自智能医疗对象(IMO)的本体来构建数据。
福特表示,目前,私人股本公司Thomas H. Lee Partners正在收购IMO,该公司已与Meditech合作开发药物基因组基因和结果的编码结构和统一本体。合作伙伴最近开始研究癌症基因。
电子病历集成在整个行业中仍然是零敲碎打的。上周,Guardant Health宣布计划将癌症测试整合到Epic Systems的电子病历中.然而,Meditech希望减轻客户的负担。
Meditech是第一家整合临床决策支持公司first Databank的药物基因组学内容的电子病历供应商。Frederick Health正通过Meditech与FDB合作,为临床决策提供支持,确保处方者在订购药物时能看到药物基因组信息。
Jackie Rice指出,FDB每两周更新一次数据库,新信息出现在Meditech EHR中,因为它来自内容供应商。
“这就是[使用]云的好地方,因为基因组医学的变化真的很快,”怕怕说。
我公司是成立于1969年由马萨诸塞州总医院实用多功能编程系统(MUMPS)的开发人员之一开发的,MUMPS是一种编程语言,仍然支撑着现代电子病历中的一些技术,但在过去几年里,Meditech系统已经完全迁移到云平台上。vwin德赢ac米兰合作
fear回忆起几分钟前,当临床药物遗传学实施联盟(CPIC)刚刚改变了抗精神病药物Abilify(阿立哌唑)的处方指南时,他为一家精神病院进行了一次药物基因组学演示。
“我去开Abilify,我们接到通知说(病人有)细胞色素P450突变,你必须把这种药的剂量减半,”怕怕说。“这完全不是我们的计划。这是在后台实时发生的,我甚至还没有读到(新规定)。”
费林说,如果他们选择激活该功能,浩瀚基因组公司将成为当前和未来医疗技术新客户的标准。Meditech正在为其整个客户群提供该技术,包括vwin德赢ac米兰合作综合交付网络、学术卫生系统以及社区、农村和安全网保健提供商。
“我真的认为,人们不应该只在学术环境中接受这种尖端护理,”福特说。“他们应该能够去他们的医院,无论他们在哪里,也能够获得同样的临床决策支持,同样正确的处方,同样的人口分析,任何学术中心都可能能够做到。”
Meditech还在其平台中构建了分析,包括人口水平的分析。福特表示,预计今年晚些时候会有新的以基因组学为重点的分析技术的消息。
由于基因数据非常敏感,而且受到美国《基因信息非歧视法案》等法律的保护,费琳说她希望尽可能多地将处理过程自动化。
她说:“如果你有一个电子病历,它基本上可以管理信息,管理基因型和表型,处理其中的分析,就会有更少的人接触这些数据。”“作为一名临床医生,这对我来说非常重要。”
“精准营养”和其他挑战
福特说,医疗科技仍然通过浩瀚基因组公司向电子病历提供基因检测报告的PDF文件,以防医生需要参考这些报告,尽管PDF中的所有数据在来自实验室时都以离散数据的形式存储在电子病历中,因此它可以推动临床决策支持。
fear说,PDF报告有很多信息可以解释突变,尽管其中一些对医生来说可能是“压倒性的”,这就是为什么Meditech希望同时包括PDF和离散数据。
“获得这些离散结果的原因是,第一,我们可以开始建立患者的遗传历史,”福特说。“然后我们可以将其用于临床决策支持,无论是药物基因组学或肿瘤学临床决策支持,还是遗传临床决策支持。”
EHR中的患者遗传史可以将突变分为生殖系或体细胞。她说:“为了治疗目的,我们可以快速了解突变的位置。”
她补充说,Meditech和Frederick Health仍在研究何时将基因组信息——特别是体细胞突变——提交给精准医疗项目或肿瘤科。
弗雷德里克健康公司最终希望所有的外部实验室都能与医疗科技公司整合,所有的临床医生都能通过电子病历获得基因组服务。该组织没有提供实现这一目标的时间表。
明年的一个优先事项是通过弗雷德里克健康公司的EHR将营养基因组学纳入临床实践。帕特里夏·赖斯表示,精准医疗项目将与卫生系统的体重管理项目合作,进行一项暂时被称为“精准营养”的努力。
她补充说,体重管理项目的医学主任克里斯汀·康利(Kristin Conley)已经在她的病人身上寻找可能导致炎症的非遗传生物标记物。
帕特里夏·赖斯说:“我们还希望加入一个为我们的营养需求进行基因检测的小组。”“我要说的是,营养基因组学——精准营养——作为一个领域还处于起步阶段。我们将像它一样发展壮大。”