注意:这个故事已经更新，反映了Regeneron没有为我们所有人测序样本。
芝加哥- Regeneron制药公司与110个不同的研究合作伙伴涉及基因测序，但没有一个比最近宣布的更大西奈山百万健康发现计划．
这家总部位于纽约的生物制药公司的目标是在五年的时间里至少登记和排序100万西奈山卫生系统患者的外显子，为研究人员提供数据集，以评估基于基因的精准医疗的潜力，并为潜在的新疗法发现和发展产生新的见解。
新项目将由查尔斯·布朗夫曼个性化医学研究所管理，服务于西奈山卫生系统和西奈山伊坎医学院，并将与布朗夫曼研究所内的其他项目协同工作，包括多模态数据科学、患者的深度表型和新疗法的测试。
这使其他Regeneron测序合作相形见绌，包括在Geisinger卫生系统,科罗拉多个性化医疗中心,加州大学洛杉矶分校．“为了真正帮助我们理解我们所知道的关于人们生病的原因，关于生物学，我们需要的不仅仅是成千上万。我们将需要数百万个人，”Gonçalo Abecasis说，他是纽约塔利敦再生基因中心的副总裁和分析基因组学和数据科学的负责人。
这是由私营部门发起的规模最大的测序项目之一，也许仅次于由南非Aurum研究所，全球健康创新，以及初创公司IndyGeneUS．其他类似规模的项目，如美国的All of Us和百万老兵项目，以及英国的英国生物银行，都是由政府资助的。
再生基因中心为英国生物银行进行测序。
在西奈山项目中，Regeneron将对100万人进行全外显子组测序，但该公司将对非欧洲血统的一小部分患者进行全基因组测序，因为有色人种历来在遗传研究中代表性不足。据项目负责人、伊坎西奈山医学院精神病学、遗传学和基因组科学副教授亚历山大·查尼介绍，Regeneron还将对所有100万名患者进行类似微阵列的基因分型，以分析“基因组子集区域的常见变异”。
查尼说，最终目标是对每一个西奈山病人的整个基因组进行测序，但不一定是在Regeneron合作的背景下。
Abecasis说:“我不认为我们有一个明确的承诺，在那里做一个精确数量的基因组，但如果几年之后我们真的做了一个基因组都没有，我会感到惊讶。”他指出，Regeneron的标准方法是从外显子体测序开始，因为该公司认为，蛋白质编码变异是“针对特定基因的好处(和风险)最能提供信息的”。
Abecasis说，在制药和生物技术公司中，Regeneron可能是少数进行目标识别和药物开发测序的公司，而不是主要依赖公共数据库。他说:“我们认为，有一个优势是能够指导产生的东西，而不是等待公共项目。”
该公司已经能够从其他聚焦基因组学的合作中推进几个研究项目。
值得注意的是，Regeneron已经开发了IL-4阻滞剂Dupixent (dupilumab)治疗严重哮喘。Abecasis说，在研究这种化合物的遗传根源时，Regeneron还发现同样的变异与其他疾病有关，包括湿疹。该公司还基于从基因组数据库中获得的见解，致力于治疗哮喘和慢性阻塞性肺病的IL-33抑制剂。
最近的研究中,发表在《新英格兰医学杂志上个月，他讨论了基于对超过50万个外显子体的分析，CIDEB中罕见的编码变体的鉴定，这些编码变体可以预防肝硬化。Abecasis说:“如果没有我们大规模的测序合作伙伴关系，这是不可能的。”
Abecasis说:“我们将从像50年前那样通过试验和错误来设计药物的想法转变为更多地由生物学驱动的想法。”“我们真的需要大规模的数据来了解这些人之间的关系。”
领导人称这个新项目为“西奈山百万健康发现”，它是某种形式的产物协作从西奈山和2016年开始的Regeneron，从卫生系统BioMe生物银行的DNA和血浆样本中对整个外显子进行测序和分析。查尼说，早期的项目最终招募了大约7万名患者。
新项目中的所有100万名患者将来自西奈山医疗系统(Mount Sinai Health System)，该系统每年约有13.3万名住院患者和370万人次门诊。
查尼说，在一个单一的医疗保健系统中保留这样一个规模的项目，其优势在于将基因组数据与摄入调查以及去识别的患者记录联系起来。他说:“如果你的目标是了解遗传学如何在现实世界的临床实践中得到应用，那么像《我们所有人》这样的设计并不是真正实现这一目标的方法。”
查尼补充说，由美国退伍军人事务部管理的百万老兵项目“更符合这一目标”，因为所有参与者都在退伍军人医疗系统中接受治疗，而退伍军人医疗系统已有几十年的电子健康记录。然而，他指出，退伍军人事务部严重倾向于男性，只是因为退伍军人人口的性质。
查尼说，西奈山百万计划的总体目标是招募不同类型的患者，以了解基因对健康的影响。当然，每个研究人员都有自己的目标。
查尼说:“这个项目将使我了解特定的基因变异是如何在个体患者和他们的家庭中导致严重的疾病，如精神分裂症和双相情感障碍。”
“像这样的资源的真正价值在于，它不会只达到一个目的，”他补充说。“它将为不同的研究小组实现许多目的。”
软件公司Vibrent Health也为“我们所有人”提供技术平台，为“西奈山百万”提供中央信息平台和数字工vwin德赢ac米兰合作具，以支持招募、患者同意、数据收集、参与和保留参与者。虽然Charney表示，未来将“考虑”为入选者提供患者门户，但患者不必被迫下载应用程序并在Vibrent平台上创建个人资料来参与这项研究。
“我们研究的真正挑战是，如何在一个中心在短时间内对100万人实施知情同意?”恰尼说。
Abecasis解释说，传统的让人接触患者进行临床研究的方法无法扩展到一个试图登记100万人的项目。
Abecasis说:“因为这是在线的，而且是已经采集的样本，这比说‘我要亲自问你，我会安排一次随访，让你提供血液样本’要有效一些。”
这种网上获取同意的方法产生于COVID-19大流行的早期，当时纽约是美国的早期热点，西奈山在中央公园建立了一家野战医院，以应对预期的患者激增。
查尼指出，卫生系统的内科研究人员知道，他们需要在治疗COVID-19患者的同时对他们进行研究，但他们很快了解到，隔离病房的病人在他们的家人甚至无法前来探望的情况下，不希望医院工作人员接近他们进行研究。相反，西奈山医院提出了一个替代方案，将血液样本放在一边，直到患者更愿意被要求同意进行研究。
“当我们这样做的时候，我们发现90%的人在我们联系他们的时候都想参与进来，”查尼回忆说。“这是一次大开眼界的经历。”
为了推广西奈山百万项目，卫生系统正在组建一个由20名左右的工作人员组成的团队，从临床医生到研究人员到营销人员，向医护人员和患者宣传这一研究机会。
查尼反驳了耶鲁大学生物医学信息学家在一篇文章中提出的对隐私的担忧纽约时报文章关于这个项目。
查尼说:“我失眠是因为要确保我们从病人那里收集到的所有数据都得到了保护，只有极少数直接向我汇报的人会知道参与研究的人的名字。”“作为这项研究的首席研究员，责任由我来承担。”
查尼也承认，总体来说，参与遗传学研究的安全性是一个“需要整个社会讨论的更大问题”。“这是该领域需要时刻深入思考的一个大问题，不仅仅是现在，而是永远。”