纽约(GenomeWeb)——美国国立卫生研究院的国家过敏和传染病研究所(NIAID)计划建立非洲生物信息学卓越中心(ACEs)，该中心将为整个非洲大陆的研究人员提供高性能计算基础设施、生物信息学工具、指导和培训。
该计划得到了美国国立卫生研究院基金会的资金和后勤支持，其目标是建立一个专门中心网络，为非洲研究人员提供他们所需的资源，以开展围绕疟疾、结核病和艾滋病毒等传染病的独立和合作生物医学研究，并开发更有效的药物和疫苗。
NIAID与生物信息学咨询公司BioTeam、英特尔公司和EMC合作，今天在马里巴马科的科学、技术和技术大学(USTTB)正式启用了第一个中心。第一个中心作为概念验证，为NIAID提供了测试其计划有效性的机会，确定需要改进的领域，并为其未来的计划提供信息。如果这一初步努力取得成功，NIAID计划寻求额外的资源，在非洲大陆的其他机构建立另外四个这样的中心。
美国驻马里大使馆临时代办Susan Solange Zelle在该中心的开幕式上指出，最近的埃博拉疫情“提醒我们，我们需要建立强大的卫生系统来预防和抗击疾病，利用最新技术增强了解病原体的能力，并与全球网络共享信息。vwin德赢ac米兰合作我们希望这是西非的第一个项目，将在其他国家得到复制，并为非洲中心生物信息学能力的可持续发展做出贡献。”
BioTeam、Intel和EMC为第一个中心提供了价值约75万美元的软硬件实物捐赠。具体来说，BioTeam提供了一个定制版本的SlipStream设备，加载到英特尔的HP ProLiant DL Server产品线的系统上。EMC则提供安全的存储资源。
在硬件方面，英特尔提供了一款HP ProLiant DL580 Gen8服务器，这是该公司DL服务器系列产品的最高端的实现之一。英特尔生命科学和分析总经理科坦·帕拉贾佩(Ketan Paranjape)告诉GenomeWeb，他的公司为马里中心选择了这个系统，因为它能够处理多个用户，并根据需要进行扩展。它还提供高性能，易于安装、运行和连接到现有的基础设施，如测序仪器，他说。
英特尔提供的系统的特殊配置是一个HP四插座x86服务器，它配备了4个英特尔E7-4800 v2处理器，96个内存插槽和9个PCIe Gen3.0插槽，以获得更大的带宽。与其他惠普系统相比，它预装了4tb的存储空间，并提供了更高的存储性能——每秒12gb。它的零售价略高于5万美元。Paranjape说，该系统还经过优化，可与常用的开源生物信息学软件包一起工作，如基因组分析工具包、BWA和Blast。
巴马科中心还配备了定制版BioTeam的SlipStream服务器设备这款手机预装了Galaxy生物信息学分析软件。BioTeam的高级科学顾问Anushka Brownley告诉GenomeWeb，该公司对设备的标准版本进行了一些重新设计，以便它可以在英特尔基础设施上运行(它一直在戴尔平台上运行)，并利用英特尔基础设施提供的更大的存储、内存和计算能力。
当前SlipStream设备的基本配置包括两个Intel Xeon E5-2690处理器(总共16核)和384gb的随机存取存储器。她说，英特尔系统提供60个核心和1tb内存，因此“我们不得不从根本上重新设计Galaxy系统利用(基础设施)的方式。”根据该中心的分析需求，该系统应该能够支持数十个用户，根据布朗利的说法。
同时，来自NIAID网络基础设施和计算生物学办公室(OCICB)的研究人员将负责培训巴马科的研究人员使用他们的新基础设施。本周，来自生物信息学和计算生物科学分支的成员在美国科技大学结核病研究所提供了一些现场培训，今后还将提供额外的远程培训。他们将使用在巴马科ACE设立的远程学习设施，配备视频会议功能。此外，NIAID的一些研究人员将担任中国科技大学生物信息学硕士项目的兼职教授，该项目将于下周启动。