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NIH授予基因本体论联盟270万美元用于改进知识库

纽约(基因组网)-美国国立卫生研究院下属的国家人类基因组研究所向基因本体论(GO)联盟提供了270万美元的资助,用于其2017 - 2022年的资助周期。这是授予该联盟的最新赠款,将用于继续扩展和改进其生物系统的计算表示,或知识库。

GO联盟是一个生物信息学倡议,旨在为科学界在复杂生物系统中基因功能的不断发展的知识开发一种计算表示。它包括来自世界各地机构之间的研究合作,由杰克逊实验室的Judith Blake、斯坦福大学的Michael Cherry、劳伦斯伯克利国家实验室的Suzanna Lewis、加州理工学院的Paul Sternberg和南加州大学的Paul Thomas共同领导。

托马斯在一封电子邮件中说:“我们正专注于改进人类基因功能,因为GO注释在生物医学研究中广泛使用,在解释高通量组学实验中发挥着重要作用。”

该财团于2001年首次从NHGRI获得资金,此后从该机构获得了总计5400万美元的赠款资金。托马斯补充说,在过去5年里,超过3万篇同行评议的论文使用了GO的分析。

他进一步指出:“新周期的一个特别创新部分是软件和数据结构,将更简单的氧化石墨烯注释结合到基因功能的复杂系统级表示中,如生化和调控途径。”“有了这些系统表示,GO的用户不仅可以进行组学实验解释中常用的标准富集分析,还可以进行更新的基于网络的分析。”

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