英伟达正与牛津纳米孔技术公司(英国国民健康服务的一个分支机构)以及两家主要的制药公司合作，开发该技术公司所说的英国最强大的超级计算机。vwin德赢ac米兰合作
这台名为“剑桥-1”的超级计算机将采用英伟达DGX SuperPod超级计算基础设施，该基础设施基于该公司最近推出的A100图形处理器(GPU)和相关的DGX A100, DGX A100是一个装有8个A100处理器和相关服务器硬件的盒子，以提高计算速度。
英伟达官员表示，剑桥-1将配备80台DGX A100单元，具有400千万亿次的计算能力，使其跻身世界前30强超级计算机之列。这家总部位于加州圣克拉拉的公司预计初始成本约为5,000万美元。
英伟达创始人兼首席执行官黄仁勋周一在该公司本周在线举行的年度GPU技术大会(GTC)上发表主题演讲时表示:“剑桥-1超级计算机将成为英国的创新中心，并进一步推动英国研究人员在关键医疗保健和药物发现方面的开创性工作。”vwin德赢ac米兰合作
面对新冠肺炎疫情，英伟达正在加快超级计算机的建设，预计剑桥-1将在年底前上线。这台超级计算机是该公司在英国剑桥建造的人工智能卓越中心的一部分。
英伟达此前突出显示它的服务器如何帮助美国和中东的大型项目了解新型SARS-CoV-2，并加速对COVID-19潜在疗法的研究。
最初的剑桥-1合作伙伴，包括牛津纳米孔、伦敦盖伊和圣托马斯NHS基金会、伦敦国王学院、葛兰素史克和阿斯利康，将于2021年初开始转移到该平台上。英伟达医疗副总裁金伯利·鲍威尔在与记者的视频会议上表示:“我认为我们有大量的潜在机会进行大规模的工业研究，我们将在明年上半年启动。”
鲍威尔说:“我们希望为这些人工智能研究人员和科学家先驱提供一台超级计算机，这样他们就可以进行非常大规模的研究，我们就可以取得令人难以置信的医学突破。”
英伟达将与这些合作伙伴进行大规模的研究。它还将邀请初创公司和大学研究人员访问剑桥一号，试图建立一个生物信息生态系统。鲍威尔说:“现在我们可以提供实际操作的GPU训练营和黑客马拉松和比赛，因此我们可以吸引越来越多的从业者，特别是来自AI医疗保健研究领域的从业者，来理解和解决人工智能的问题。”
英伟达和牛津纳米孔已经合作了好几年。值得注意的是测序公司的GridIon Mk1仪器具有Nvidia Volta GV100卡，所以基调用只需要10%的GPU资源。牛津纳米孔的其他设备，包括手持的MinIon Mk1C和较大的PromethIon型号，也包含英伟达的图形处理器。
鲍威尔解释说，人工智能是纳米孔测序的碱基调用的“核心”。她说，今年2月发布的牛津纳米孔读取的开源Bonito基调用程序运行在英伟达技术上。vwin德赢ac米兰合作
通过剑桥-1，牛津纳米孔希望能够训练新的分析算法，以追求持续的性能改进。
牛津纳米孔的一位发言人通过电子邮件表示:“这些年来，我们的许多性能改进都是由于改进了分析方法，而不是改进了纳米孔设备产生的原始数据。”“简而言之，信息已经在信号中了。”
发言人说，随着计算能力的增长和计算时间的缩短，研究人员应该能够回到早期的纳米孔序列数据，并使用改进的算法重新分析它，并补充说，超级计算机还应该支持更大的数据规模。
该发言人表示:“利用超级计算机和人工智能提供的额外分析能力部署到最大的数据集，对于深入研究纳米孔测序提供的丰富数据，以及大规模匹配变体和表型特别有用。”
该公司表示，在未来，这种类型的计算平台，加上新的人工智能算法，也应该使更多的研究人员能够获得蛋白质测序和分析。
同样在周一的GTC 2020上，英伟达表示将与葛兰素史克合作，在这家制药巨头正在伦敦建设的人工智能中心部署新的Nvidia Clara Discovery软件套件，用于管道开发和计算药物发现。GSK正在投资数量不详的DGX A100单元，还将获得Cambridge-1来为其人工智能能力提供动力。
GSK高级VO、人工智能和机器学习全球主管Kim Branson在一份声明中表示:“除了在英国丰富的生态系统中汇集医学、遗传学和人工智能交叉领域的最优秀人才外，我们还在构建新的算法和方法。”
具体来说，Clara Discovery旨在解决将新药推向市场的高成本、慢流程和高失败率的问题。鲍威尔说:“我们正在研究如何从葛兰素史克正在生成的新生物医学数据集中提取信息，比如医学成像和基因组学。”
随着测序成本的下降，鲍威尔预计英伟达的客户在未来几年将生成许多艾字节的数据。她解释说:“基因组学对于药物发现的一个非常重要的阶段是一个非常强大的数据源，这个阶段就是选择你的生物靶标。”“如果你没有选择正确的生物靶标，你就是在为整个过程的失败做准备，所以提高这种能力是非常重要的。”
鲍威尔表示，英伟达仍在努力了解与GSK的合作将在基因组学方面投入多少。她说，这两家公司最近进行了单细胞基因组数据交互分析聚类的演示。
鲍威尔说:“这是我们将共同应对的新工作量。”“我们很高兴能够探索新生物医学数据和人工智能技术的所有领域，从中提取价值。”
牛津纳米孔并不是唯一一家与英伟达合作的基因组学公司。在周二的另一份声明中，基因组数据压缩软件制造商PetaGene表示，已将其旗舰PetaSuite生物信息分析平台集成到英伟达的Clara Parabricks Pipelines中。来自英国剑桥的PetaGene已经完成了声称其PetaSuite无损压缩软件可以将存储成本和数据传输时间比BAM和gzip FASTQ文件减少60%到90%。
根据PetaGene在GTC上展示的新数据，这种集成软件将Parabricks管线的基因组分析速度提高了29%。翻译基因组学研究所(TGen)代表PetaGene进行了分析和验证。
“在TGen，我们在处理大量庞大的基因组文件方面有着悠久的历史。随着我们工作流程的成熟和规模的扩大，我们一直热衷于用最有效的工具和系统从头开始构建我们的基因组学基础设施，”TGen科学计算副总裁Glen Otero在一份声明中说。“对我们来说，PetaGene和Nvidia Clara Parabricks pipeline是独立的明确选择。让它们像这样互操作是很重要的，事实上，这种组合进一步加速了总体性能，这是非常棒的。”
Clara Parabricks pipeline来自英伟达收购测序分析软件开发商Parabricks去年年底被收购。密歇根大学(University of Michigan)的分支机构Parabricks开发了一种依赖于gpu的技术，可vwin德赢ac米兰合作以将整个基因组的分析速度加快到不到一小时。