芝加哥——上个月,Qiagen从Wellcome Sanger研究所购买了“癌症体细胞突变目录”(COSMIC)数据库的独家商业许可和发行权。双方表示,该协议的条款未披露,但将使数据库的分布范围远超以往。
总部位于英国剑桥的威康桑格公司一直在提供COSMIC许可计划2015年3月以来但据COSMIC主管西蒙·福布斯(Simon Forbes)称,95%的用户来自学术界或医疗保健系统,根据桑格的学术条款和条件,他们可以免费访问。
《福布斯》表示,COSMIC的开发者希望“最大化我们在市场上的影响力”,并维持“一个大规模、长期、长期的未来”。这包括在数据库的基础上添加分析工具和专门的策展等“深刻的”产品。
福布斯表示:“因为我们是桑格研究所的成员,所以我们专注于科学卓越和数据可持续性。”“我们在一段时间前决定,我们永远不会在一个慈善资助的机构中发展一个大规模的商业团队。”
他说,桑格对这样的技术转让“很有热情”,但在建立大规模销售团队的问题上,桑格内部总是存在vwin德赢ac米兰合作一定程度的不安,这导致了与凯杰的讨论,并最终达成了授权协议。
Qiagen Digital Insights (QDI)是Qiagen旗下的数据和生物信息学部门,负责产品和解决方案的副总裁Frank Schacherer表示:“这与我们所提供的产品完美契合,也非常符合我们在如何取得成功、如何将其带给全球所有用户方面的专业知识。”QDI包括了一系列生物信息学公司和技术,这些公司和技术可以追溯到30多年前,而且不仅仅包括软件。
总部位于德国希尔登的Qiagen在全球拥有销售团队,分布在北美、欧洲、亚太和拉丁美洲。Schacherer说,虽然在非洲没有专门的销售人员,但该公司在那里有分销商。
《福布斯》表示:“我们希望维持这种良性循环,即一小部分用户支付足够的费用来维持团队,这样世界其他地区的用户就能从这些发展中受益。”
目前,COSMIC的商业用户包括制药和生物技术公司、诊断实验室和支持其他授权方的信息公司。QDI完全属于第三类,并且已经是被许可方。
Schacherer说:“在我们讨论购买COSMIC的独家商业版权之前,我们已经对数据的质量有了第一手的了解。”
COSMIC拥有超过2万名用户,包括研究人员、生物信息学家和临床医生。体细胞突变数据库是根据约2.7万份科学和临床报告以及500项独立的癌症基因组研究整理而成的,涵盖了1500多种癌症。
COSMIC仍然是一个非营利组织,学术研究人员仍然可以免费获取数据。商业授权的费用根据组织的规模和预期用途而有所不同,与桑格的COSMIC团队合作进行研究的公司可以免收费用。
商业组织也可以通过COSMIC网站免费获取信息,并通过网站内嵌入的工具进行分析,不过下载数据需要付费。据桑格说,可下载的数据集包含比网页版本更广泛的注释。
商业许可费支持COSMIC数据库和桑格研究所其他项目的发展。
商业机会
COSMIC于17年前,也就是2004年2月4日启动,作为基因数据的公共资源。当时,癌症基因组学还处于起步阶段,但发展迅速。“精准医疗还处于相当早期的阶段,但显然有很大的可能性,”福布斯说。
“随着我们身边的科学和文学的发展,我们也需要发展,”福布斯说。但是COSMIC组织是由慈善机构和有特定期限的赠款资助的,这使得数据库难以长期持续。
福布斯说:“我们希望确保我们是完全可用的、完全可靠的、完全可持续的,以真正支撑世界上相当多的癌症基因组学研究。”
《福布斯》表示,2015年增加商业牌照的决定“真正关注的是我们的发展,这样我们就可以做更多令人兴奋的事情,而不仅仅是收集数据。”“我们可以开始帮助人们解读它。”
从那时起,COSMIC团队从9名完全由慈善机构资助的员工发展到28人。
《福布斯》表示:“我们发展的商业业务使我们能够在市场上产生更大的影响,提供更多的数据,提供更多的见解,并真正展望一个我们从未有过的更深刻的未来。”
然而,据《福布斯》(Forbes)报道,Schacherer领导的团队在凯杰的商业经验远比桑格丰富。
“这些学术数据库和资源的主要挑战是,一旦你创建了它,你如何继续维护和更新它,并保持它与所有成千上万的用户相关和有价值?”Schacherer说。
像赠款这样的“基础设施”资助往往有一到五年的固定期限,并不意味着是可持续的。
对学术用户免费访问和向商业客户销售的混合模式在Qiagen(凯杰)的人类基因组突变数据库(HGMD)中运行良好,该数据库由卡迪夫大学开发。Qiagen获得了HGMD的权利2014年收购了Biobase.
Schacherer称HGMD为遗传突变的“黄金标准”。他认为COSMIC在体细胞癌症突变方面扮演着类似的角色。
Qiagen不仅通过收购Biobase,还通过收购聪明才智CLC,OmicSoft,N-of-One.该数据库现在包括40多个数据库,涵盖3.3万个和超过2000万个发现;据该公司称,每天新增约5000个新发现。
Qiagen的支持团队现在与大约9万名用户合作。
Schacherer说:“关键是要有高质量的科学内容,你可以利用这些内容在软件中产生见解。”他补充说,桑格为COSMIC提供的手工策划使内容更加可信和可靠。
Schacherer说很难估计COSMIC的市场潜力。他说,每一家从事癌症研究的制药公司和生物技术公司都是其销售目标,但数以百计的诊断实验室也是如此,尤其是在美国和欧洲。
“除此之外,还有一个庞大的、不断变化的信息专家群体在开发新的工具,以探索数据的各个方面和组合,并为这些部门提供服务,”福布斯补充道。
Schacherer表示,制药和MDx都代表了COSMIC的巨大潜在增长领域,特别是拥有多个小型实验室的实体。他指出,上个月,Qiagen已经与制药公司就COSMIC的授权进行了一些讨论。
福布斯补充道:“我真的很期待听到这些对话的进展,它教会了我们关于市场的什么,教会了我们关于客户需求的什么,然后我们可以确保把这些信息带回COSMIC,这样我们就可以调整设计。”
Schacherer表示,Qiagen能够将客户反馈反馈给Sanger,以便那里的科学专家能够改进COSMIC,这是“基础”。
Schacherer估计,这一合作关系将需要6到9个月的时间才能全面运作。据《福布斯》报道,一旦完成交接,桑格将根据Qiagen从市场上收到的反馈,寻找更多的策展人和信息专家。他说:“这将以更好的解决方案告诉我们,我们想在哪里投资,我们应该在哪里发展,我认为这是开始令人兴奋的地方。”
Schacherer说,Qiagen对与Sanger共同开发额外的技术来支持COSMIC的想法持开放态度,尽管这不是授权协议的一部分。
未来的发展方向
与此同时,桑格已经在围绕COSMIC开发新工具。
去年夏天,该组织引入了一项癌症突变普查,提供了蛋白质结构特性的度量标准,以帮助研究人员解释COSMIC中已经存在的3500万编码突变。这是对建立已久的COSMIC基因普查的补充。
福布斯说,基因突变普查将特别有助于诊断专家解释意义不明的基因变异。
《福布斯》表示:“我们的目标非常明确,就是要给人们提供健壮的数据,而不是简单的黑箱算法。”“这是一系列用来解释(意义未知的变量)的实际测量,并开始说明哪些变量比我们已知的更重要。”
很快,COSMIC将发布一款更面向临床的产品,福布斯表示,该产品将基于现有药物评估突变的可治疗性。
福布斯表示,他很高兴收到Qiagen销售团队的反馈,因为这将帮助桑格调整COSMIC和相关的生物信息学工具,以满足用户基础的需求。他称信息学方面很重要,“确保我们为诊断行业提供这些突变类型中最有用的见解。”
对于那些意义未知的变异,药物使用者也是如此。福布斯说:“如果你在精确医疗领域没有任何药物,如果你不能治疗任何疾病,你是否能诊断出它也就不重要了,所以我们正在确保我们正在开发的洞察力能告诉诊断医生哪些VUS重要,哪些不重要,哪些突变重要,哪些不重要。”
他说,对于制药研究人员来说,知道如何在分层人群中描述和理解药物靶点同样重要。
福布斯表示,双方都希望这是一段长期的合作关系。“这样的合作关系不会持续一年、两年或三年,”他说。
Schacherer说,Qiagen已经联系了COSMIC现有的商业客户,解释了这一转变,并表示他们的反应“非常积极”。
他补充说,在不久的将来,Qiagen会有更多关于COSMIC的消息。Qiagen将于下周公布其2020年第四季度和全年财务业绩。