Rosalind，这家公司的前身是OnRamp Bioinformatics，一直在为那些需要解释基因组数据但没有广泛编程或生物信息学专业知识的研究人员提供服务。
上周，该公司推出了罗莎琳德诊断监测(dcm)平台，该平台用于监测新的SARS-CoV-2变种，并评估它们如何影响COVID-19诊断检测检测病毒的能力。
这家总部位于圣地亚哥的公司将向诊断测试制造商和监管机构提供罗莎琳德?美国食品和药物管理局警告今年1月，他担心某些SARS-CoV-2检测可能因病毒基因组突变而出现假阴性，并建议检测制造商偶尔进行检测在网上评估他们的测试，以监测性能与变异。
罗莎琳德在美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)的一份合同的帮助下开发了DxM快速加速诊断(RADx)程序支持SARS-CoV-2诊断试剂的开发和商业化。该公司表示，它在2月份收到了合同，但直到上周产品发布后才宣布获得联邦资助。合同价值还没有出现在美国国立卫生研究院的网站上，该公司表示，它还没有获得公开这一信息的批准。
Rosalind首席执行官兼创始人Tim Wesselman提到了该平台的可扩展性和公司赢得RADx Tech合同的专业知识。
三月对罗莎琳德来说是具有里程碑意义的一个月。该公司在本月初的虚拟基因组生物学和技术进展(AGBT)会议上正式公布了其更名，并介绍了一种新的产品vwin德赢ac米兰合作基于云的单单元数据分析模块在会议期间。
该新模块是该公司核心Rosalind平台的第三个版本的一部分，能够基于web的协作、分析和解释在10x Genomics的Chromium平台上生成的单细胞数据。用户可以通过图形用户界面从FASTQ数据文件生成和注释单细胞集群，并执行下游分析。
Rosalind现在完全集成了几个10x Genomics技术，包括Cell Ranger管道和Loupe浏览器。以前，Rosalind用户必须将Cell Ranger数据从云端导入到Loupe的本地安装中。“现在是一个完整的端到端体验，”韦塞尔曼说。
该技术的基本使用和nCounter分析是vwin德赢ac米兰合作免费的，价格为每月49美元起，加上学术研究人员使用的其他Rosalind分析的单位费用。还有更全面的订阅。
至于改名一事，韦塞尔曼表示已经酝酿了一段时间。
OnRamp Bio成立于2013年，介绍了2017年面向生命科学研究人员的Rosalind基因组学分析平台，该平台似乎与Congenica、DNAnexus、Illumina公司的BlueBee以及Genestack，尤其是在多组学和单细胞数据管理方面。
最终，据韦塞尔曼说，客户对Rosalind这个名字的了解超过了公司的实际名称，他们经常把OnRamp称为Rosalind，这是为了纪念早期的DNA研究人员Rosalind Franklin。
“罗莎琳德真的定义了我们所做的一切，”他说。“此外，当回到我们的价值观和我们所代表的一切时，这个名字真的击中了我们的核心，以及我们在赋予科学家权力方面所代表的东西。”
韦塞尔曼说，这些价值包括简化生物学和生物信息学的一些复杂性，以加速精准医疗的采用。
他说:“我们认为，一切都从赋予科学家权力开始，让他们具备协作能力，以互动和可视化的方式将他们的知识与他人交流，这样他们就不会被技术所阻碍。”vwin德赢ac米兰合作
他还表示，本着富兰克林本人的精神，该公司希望在科学领域赋予女性和少数族裔权力。韦塞尔曼说:“核心是确保我们认可像罗莎琳德这样的科学家，并确保这些伟大的贡献不会被撇在一边。”
公司的新标志不仅像玫瑰花瓣一样向富兰克林的名字致敬，它是为了说明DNA的横截面视图，而不是更常见的双螺旋侧面视图。“我们采取了一种全新的观点，可以看到大局，结合多组学，结合合作，所以我们想，为什么不得到基因组的自上而下的视图呢?”Wesselman说。
这些花瓣还代表了科学家、企业合作伙伴、见解，甚至是罗莎琳德希望在多元环境中聚集在一起的碱基对。
韦塞尔曼将Rosalind产品比作为科学家设计的办公软件和谷歌Docs。他表示:“(我们使)他们能够以协作的方式将所有组学(数据)整合在一起。”
Rosalind公司战略营销合作副总裁Jay Gerlach表示:“我们试图让单细胞分析像常规的批量基因表达分析一样简单。”“我们的想法实际上是利用这些……日益复杂和庞大的数据集，并减少它们，以便更广泛的基础可以访问它们。”
位于加州拉霍亚市的桑福德·伯纳姆·普雷比斯医学发现研究所的发育、衰老和再生项目副教授马克西米利亚诺·德安吉洛(Maximiliano D’angelo)去年采用了罗莎琳德，并开始使用新的单细胞分析技术。vwin德赢ac米兰合作
从历史上看，D'Angelo的研究实验室对该机构的生物信息学核心进行了遗传分析。VWIN娱乐网站他说，当他开始在工作中加入更多的单细胞分析时，这个核心被证明不太适合他的研究需求，尤其是因为结果会以电子邮件的形式返回，不符合实验室的工作流程。
此外，他的实验室没有计算机编程经验，运行计算核心的计算机科学家也不精通生物学，因此调整是一个繁琐的过程。
“我们已经从堆芯获得了所有数据。我们该怎么做?我们如何分析这个东西?”德安杰洛说。最终，他开始向单细胞基因组学方面的研究人员询问其他选择。为桑福德·伯纳姆·普瑞比斯提供试剂和其他湿实验室产品的10x基因组公司的联系人让他找到了罗莎琳德。
“我们喜欢它的界面。它很容易使用。虽然没有经验，但我们真的可以继续做下去。”
在单细胞模块启动之前，D'Angelo在Rosalind中进行了二次分析，然后必须将结果导出到Loupe进行聚类，然后再将信息重新导入到Rosalind进行进一步分析。现在，它们都被整合了。
D'Angelo说:“这是我在RNA测序分析中使用的第一个(系统)，它真的可以让你轻松地获得结果和分析数据，而不知道如何编程或改变分析的具体细节。”
他建议，Rosalind的可视化功能也有助于为拨款申请准备图表。“获得这些有时是一种痛苦。你必须采用不同的软件或核心。”“在罗莎琳德，这一切都是一体的。”
自2018年以来，该技术已支持Rvwin德赢ac米兰合作NA-seq，通过测序检测转座酶可及染色质(ATAC-seq)和染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)。Rosalind现在从大约50个知识库中提取，包括通路、转录和调控、病毒学、药理学、细胞和组织类型、基因本体和几种疾病状态。
该软件还集成了用于单细胞RNA-seq分析的开源Seurat平台，并与NanoString的nCounter兼容去年与NanoString达成了协议．
韦塞尔曼说，这些合作是罗莎琳德打破数据孤岛目标的一部分。
该公司还有许多其他合作伙伴，包括活动主题对于表观遗传学研究，科学交流为互动基因组分析服务，和一个与ScaleMatrix和Cloudian签订三方协议为了提高效率。
然而,一个2018年与Advaita合作结合数据分析的技术已经解散。韦塞尔曼说:“我们在这个平台上得到了很好的采用，客户真的很喜欢这个解决方案，并从中看到了巨大的价值。”但他说，两家公司因为“在商业模式和经济上的意见分歧”而产生了友好的分歧。
罗莎琳德通过销售和营销伙伴关系在近二十多个国家拥有客户。该公司在美国以外没有任何办事处，但韦塞尔曼表示，他正在“积极努力”建立海外业务，但他没有透露细节。
该公司在美国雇佣了大约24名员工。韦塞尔曼说，他预计到年底员工人数将增加到30人左右。
自成立以来，罗莎琳德筹集了数额不详的早期风险投资，但自2019年以来就没有了。韦塞尔曼表示，公司目前现金流为正，并通过收入获得充足资金。他说:“虽然我们目前的业务资金充足，但我们可能会考虑额外的增长融资，以加速我们的增长计划和国际扩张。”
韦塞尔曼补充说，他致力于至少在未来四到五年内保持公司的独立性。