仅仅几个月前,两家公司都发生了重大变化,Sema4正在深化与Core Informatics的关系。
Sema4,6月从纽约西奈山医疗系统分离出来该校最近同意在其两个主要实验室设施实施“核心信息学科学平台”的几个模块,包括一个实验室信息管理系统。
与此同时,Core Informatics正被赛默飞世尔科技公司(Thermo Fisher Scientific)收购,后者在3月份收购了总部位于康涅狄格州布兰福德的Core,收购金额不详。收购完成后,赛默飞世尔将Core转移到一个新的数字科学部门,该部门还包括赛默公司信息学和色谱组的LIMS资产。
数字科学业务部门的研发副总裁安东尼·乌佐(Anthony Uzzo)称,简单的定制和在云中运行的能力是Platform for science的主要卖点。
Core Informatics联合创始人、前总裁乌佐表示:“它为(客户)提供了扩展能力。”
“传统上,LIMS需要大量的自定义代码,”Uzzo补充道。他说,他在前Core的团队希望创建一个平台,“允许科学家执行实验室工作流程,允许他们集成到云连接仪器的开放生态系统中。”
Uzzo说,科学平台的基本原则是“通过配置数据管理解决方案来满足他们独特的需求和要求,使科学家能够应对变化,而不需要IT人员进行大量的定制,这通常困扰着行业中的其他LIMS部署。”
他补充说:“利用这种灵活的基础,我们已经构建和部署了我们所有的产品,其中不仅包括我们的LIMS,还包括我们的电子实验室笔记本电脑和我们的SDMS(科学数据管理系统),以促进自动化数据捕获和与各种科学仪器的交换。”
此外,科学平台很快将与ThermoFisher.com和fishsci.com链接,为实验室提供一种简单的方法来跟踪试剂和耗材的使用和库存水平,然后根据需要重新订购。
“随着我们从一个更学术的实验室转变为一个商业实验室,能够更有效地跟踪我们所有的材料是非常重要的,”今年9月成为Sema4 Genomics总裁兼首席运营官的杰米·科芬(Jamie Coffin)说。
这次升级是在Core Informatics之后一年进行的介绍了科学平台的验证版本,针对生物制药和临床基因组学行业的监管实验室。科学平台提供Core的LIMS、电子实验室笔记本、科学数据管理系统和合作产品。它还提供了该公司为生物银行、下一代测序、质量控制和分析开发的商业预配置科学应用程序的访问。
Sema4接管了西奈山位于康涅狄格州和纽约市经clia认证的基因组测序实验室。这家羽翼未丰的公司每年处理大约10万个样品,将在这两个设施中升级为“平台到科学”。
科芬说,Sema4实验室的主要业务是生殖基因组学,包括新生儿筛查,尽管它正在加强在肿瘤学方面的工作。
科芬说:“我们有自己的LIMS,但有点过时。”科芬最近曾担任SourceMed的首席执行官,该公司为门诊手术中心提供收入周期管理软件,此前曾在戴尔和IBM的医疗保健部门担任高管职位。
他补充说:“在过去的一年里,团队一直在评估市场上许多不同的LIMS,我们决定与Core合作,主要是因为我们与赛默飞世尔(Thermo Fisher)有着长期的合作关系,以及他们在基因组学领域的强大经验。”
自2014年以来,Core一直在支持康涅狄格州的实验室,主要是基因组学研究和NGS。“现在,作为一个商业实体,Sema4的那些人真的想对市场上所有的LIMS产品进行全面审查,”Uzzo说。“他们想要一种能够处理实验室运行的各种基因组学技术,并能够在实验室现在和将来的规模上运行的机器。”
科芬表示,Core/Thermo的胜出主要是因为该技术是基于云计算的。vwin德赢ac米兰合作
“我们正在寻找一种可以帮助我们在企业环境中运行实验室的东西。它具有非常强烈的企业环境气息,”科芬谈到科学平台时说。“我们认为我们可以相当高效地构建这个企业级应用程序。”
Sema4仍处于实施的规划阶段,但已经在科学平台软件中构建了运行实验室的工作流程。科芬说:“当我们将它整合起来时,我们将在很大程度上使用它来运行整个实验室的操作。”
科芬说:“现在基因组学领域发生的很多事情都是关于如何将事情自动化。”他提到了在基因组学实验室中使用机器人来准备样本。他说:“这使我们能够通过这些工具构建一套核心工作流,并将所有这些功能自动化,并能够在整个企业中作为集成工作流运行。”
科芬继续说道:“我们将临床实验室作为一种接触患者的方式,并能够同意他们的方式,使我们不仅能够将数据用于研究,而且能够在我们发现患者的新情况时使用这些数据,从而能够重新联系患者,并告诉他们他们的情况。”
“如果我们看到一个患有某种疾病的病人,我们已经做了一些基因组测试,我们已经看到他们有某种基因型,适合正在进行的特定临床试验,我们实际上可以联系到病人,然后抓住他们,说,‘你愿意参加这项临床试验吗?这在这个行业里是前所未有的。”