台湾精准医疗计划(TPMI)和赛默飞世尔科技(Thermo Fisher Scientific)正在合作对100万台湾人进行基因分型，并为众多常见疾病开发多基因风险评分，目的是为汉族人口推进精准和预测医学。
根据合作伙伴周二发布的一份声明，这个耗资1600万美元的项目最近达到了一个里程碑，自2019年启动以来，已经登记了超过50万名参与者，使其成为美国和欧洲以外最大的人口研究。
“到目前为止，(几乎)所有的多基因风险评分研究都是在欧洲进行的，”台湾中央研究院生物医学科学研究所所长、TPMI创始人郭培彦(Pui-Yan Kwok)表示。“考虑到汉族人约占世界人口的五分之一，TPMI(旨在)解决这个问题。”
主要从欧洲队列中开发的PRSs已经表明有限的效用这强调了对其他人群进行基因分型的重要性。
Kwok补充说，台湾是进行这项研究的完美地点，因为其相对的基因同质性、高质量的医疗体系、使用电子病历的历史相对较长，以及由台湾国家健康保险组织持有的大量患者数据。
正在从16个参与的医疗中心招募个人加入该方案，每月的招募人数约为2万人。郭说，截至上周，注册人数已达到约55万人。
TPMI最初与Thermo Fisher合作，为这项研究设计了定制的基因分型微阵列。该序列运行在Axiom平台上，包含70多万个遗传标记，其中包括一些被认为是中国汉人后裔特有的基因标记，它们也与严重的药物反应有关。
Thermo Fisher拥有超过1000万个标记库，在定制其阵列方面具有相当大的灵活性。
“相对高效和快速，我们可以为TPMI等客户构建全新的定制数组。我们还可以在他们学习的过程中迭代这些阵列，”该公司的副总裁兼微阵列基因解决方案总经理查德·卡特说。
未来，合作伙伴还将共同为汉族人开发常见疾病的PRS。
Kwok说，这项研究的目标是100万人，以便获取足够的数据来计算即使是低流行情况下的PRS。
“如果我们有100万人，”他说，“那么在患病率为1%的情况下，我们就会有1万例。”
“每种疾病所需的病例数量是不同的，”他补充说。“例如，对于高血压，你需要[大约]10万例病例才能得到读数，而对于像前列腺癌这样的疾病，你可能只需要[大约]3000或4000例。”
目前，与诊断或治疗相比，PRSs对研究更有用。
“我们还不知道PRSs在临床环境中有多大价值，”芬兰FinnGen群体遗传学研究的科学主任Aarno Palotie说。“但我们知道它们是重要的研究工具，我们应该利用PRSs进行高质量的研究，这样我们就可以了解常见疾病的遗传方面。”
亚历山大·查尼是西奈山伊坎医学院精神病学、遗传学和基因组科学的副教授，也是西奈山医学院的负责人百万健康发现计划他说，“我们还没有到一个多基因风险评分可以指导治疗的阶段。”
为了阐明恰尼和帕洛蒂的观点，最近的一项研究发现，对于同一种疾病，不同的PRSs可以提供不同的结果多样化的风险估计对同一个人。
FinnGen是一个公私合作的人口健康研究项目，旨在对50万名芬兰生物银行参与者进行基因分型。帕洛蒂说，到目前为止，该项目已经招募了超过53万人，尽管最终完全分析的样本数量可能会更少，因为“在最后阶段，我们将进行一些样本的优先排序。”
Thermo Fisher也参与了FinnGen的研究，TPMI承认了目前PRS的局限性，并表示希望TPMI的研究将推动该领域向前发展，无论是通过招募的参与者数量，还是通过增加PRS知识的集体池的多样性。
“未来的愿景肯定是朝着临床平台的方向努力，”Carter说。
合作者的目标是通过与其他研究人员合作分析通过这项研究收集到的数据来促进这项工作。
根据台湾的《个人资料保护法》，TPMI将所有参与者的资料保存在一个无法通过互联网访问的数据库中，原始数据也不会公开。
“我们接受研究人员的问题，并帮助他们进行分析，”郭说。“他们不碰任何个人数据。”
郭教授说，在开展积极的研究合作之前，TPMI仍在等待更多的案例出现。到目前为止，只有16个合作机构提交了研究计划。然而，随着项目接近目标注册人数，这种情况可能会改变。
除了为研究目的而制定PRSs外，TPMI还开发了软件，将这些结果报告给参与者，并计划在项目进展时推出。
“在这一点上，患者只得到所有已知变异的基因检测报告，”郭说。“在大约6个月到1年的时间里，他们将获得(某些)条件下的PRS地位。当新的条件出现时，我们会给他们提供这些条件。”
范德比尔特大学(Vanderbilt University)内科学和生物医学信息学副教授乔纳森·莫斯利(Jonathan Mosley)警告说，转化研究结果可能会缓慢地实现，而且效果有限，重要的是不要过度承诺。
他说:“若能结合有效的预防策略，使用策略性策略预测常见的慢性疾病是最有价值的。”
他以2型糖尿病、非酒精性脂肪肝和胰腺癌为例。他说，前两种病症的发病率上升，很大程度上是由于环境或生活方式的快速变化，而不是由于基因，尽管基因确实会影响个人对它们的脆弱性。
他说:“目前，这些疾病的一级预防主要是通过改变生活方式，如饮食、体育锻炼和减肥。”“在我看来，采用精确医疗方法来对抗肥胖流行病的广泛影响可能不是最好的策略。”
另一方面，胰腺癌的早期检测至关重要，因为它严重受基因影响，不能通过简单的生活方式干预来调节。
Kwok说，PRSs是否会影响个人的生活方式选择和筛查决定，是“我们非常期待发现的事情。”
他补充说:“我们真的在努力思考什么对病人最有用，什么对医疗系统最有用。”“如果我们真的能抓住那些早期的高危人群，如果我能挽救一些生命，那就值得我毕生的努力。”