芝加哥——天谱公司最近推出了Edge平台,这是一个为病理学家提供在线访问人工智能模型的平台,通过单个苏木素和伊红染色切片来识别具有潜在重要生物标志物的样本。该平台旨在帮助医生决定是否订购可能表明有资格进行靶向治疗和临床试验的基因组测序。
与此同时,这家总部位于芝加哥的分子实验室和信息学公司表示,它将在美国各地建立一个病理学实验室网络,为改进该公司的人工智能模型贡献数据,目标同样是为靶向治疗和临床试验识别患者。这个网络被称为NAPA,类似于Tempus综合分子评价(TIME)试验这是一个有3年历史的网络,为癌症患者提供类似的服务。
NAPA还将帮助Tempus开发、测试和改进新的算法。Tempus创始人兼首席执行官埃里克•莱夫科夫斯基表示:“在开发算法时,我们希望与NAPA网络中的合作伙伴进行测试,以确定它是否真的足够好,可以用于临床。”“如果是,我们会在全国或国际上推广。”
该公司于3月21日推出了名为Tempus Histogenomics的Edge模型组合,其中将包括数字病理算法,以预测生物标志物的潜力,包括微卫星不稳定性和来自H&E切片的患者的同源重组缺失状态,这些患者的活检样本通常没有测序。
莱夫科夫斯基说:“Edge的核心是开始探索如何帮助病理学家使用技术和人工智能产生更大的见解。”vwin德赢ac米兰合作
通常情况下,对癌症进行评估的患者会进行活组织检查,然后将组织送到病理学实验室,在显微镜下进行检查。Tempus和它的合作伙伴将幻灯片数字化,因此该公司可以应用其人工智能来自动化发现恶性肿瘤的过程。
根据莱夫科夫斯基的说法,Edge希望解决训练机器检查活检细胞的形态和结构,然后预测患者是否有基因突变的问题。他说:“Edge就是利用技术帮助病理学家……在他们vwin德赢ac米兰合作工作的时候就能发现各种诊断见解,而不是需要一周、两周或三周后才能得到。”
“你要确保正确的人接受基因检测。当一个病人很有可能接受一种特定的治疗时,你要努力确保不会耽误几周的时间。”
Edge的设计目的是减少关于病理结果的开放式问题的数量,而NAPA是一个跨机构共享去识别数据的网络,并部署Tempus信息工具。莱夫科夫斯基表示,这两种方法都是为了加速向数字病理学的过渡。
PathNet Labs是一个多州的数字病理实践网络,它已经实现了工作流程的自动化,是Edge的早期采用率者,也是NAPA网络的成员。
PathNet首席执行官Matthew Leavitt说,Tempus技术使他的公司能够建议患者实vwin德赢ac米兰合作时进行分子检测,而不必等待数周的实验室返回手动产生的病理结果。
“我们得到这个结果的时间框架使我们能够回到病人身边说,‘嘿,我们不仅知道你患有前列腺癌,而且我们知道你的前列腺癌很可能对(靶向治疗)有反应。莱维特说,如果患者在基因测试后符合条件,那么与Tempus的临床试验网络人员交谈,他们会为你安排一个临床试验。
这种实时信息还弥合了莱维特所说的“肿瘤学界和外科界之间的巨大鸿沟”,在这种鸿沟中,外科医生可能会进行不必要的侵入性手术,因为他们不知道有一个基因标记表明,一种已批准或正在研究的药物可能治疗特定的肿瘤。
“它改变了病人的一切,”莱维特说,他是美国前卫生与公众服务部部长迈克·莱维特的兄弟,也是一名执业病理学家。
莱维特还创立了Lumea公司,致力于病理学工作流程的数字化。莱维特说:“除非你是数字化的,否则你无法获得计算病理学。”
PathNet使用Lumea技术,尽管vwin德赢ac米兰合作后者不像Tempus那样提供计算分析服务。
他说,Tempus和Lumea已经在同步他们的技术平台,以支持PathNet,它准备在未来几个月里在Edge上运行,阿肯色州vwin德赢ac米兰合作只有一名病理学家。莱维特说:“当我们解决了这些问题后,我们将把它推广到整个PathNet网络。”
PathNet在2022年的一个主要目标是使用Edge来识别具有高微卫星不稳定性肿瘤的前列腺癌患者,这些患者可能受益于PARP抑制剂。
莱维特解释说:“目前,msi高的肿瘤需要多次昂贵的(免疫组化或分子测序)检测,而且这种情况非常罕见,对每个人都进行检测并不实际。”“如果我们能够识别出这些患者,那么我们将极大地加快PARP抑制剂的临床试验,并能够向我们提供诊断护理的农村社区和服务不足社区的患者提供(试验)。”
莱夫科夫斯基说,他设想未来病理学将获得与一线临床医生同样的决策支持。“总有一天,病理学家会配备非常强大的工具,可以实时获取大量信息,所以从有人进来的那一刻起,这些病理学家就能够做出令人难以置信的精确判断。病人的病情以及他们下一步应该考虑做什么。”