总部位于英国的软件公司Repositive从Innovate UK获得了5万英镑(约78,100美元)的SMART赠款，该公司将用于开发其在基因组学领域的第一个商业产品，该应用程序将帮助研究人员利用包含敏感信息的数据集，而不损害数据的安全性和贡献者的隐私。
Repositive已经开发了一个所谓的免费数据发现平台，目前正在进行beta测试，该平台使用由公共、半公共和专有数据存储库开发人员提供的元数据，使潜在用户更容易看到他们的基因组数据集。它的目的是使研究人员更容易地访问他们项目所需的数据，并提供一个与社区同事开展合作的论坛。今年3月,Repositive筹得30万英镑(约合44.6万美元)这笔资金将用于支持该平台的开发，该平台计划于今年9月全面推出。
与此同时，来自Innovate UK的新资金将支持新型隐私保护技术的开发和商业化，该技术将允许用户对包含敏感信息的基因组数据集进行查询，并从这些数据集中提取基本的高级统计数据，而不需要可能损害个人基因组参与者隐私的访问级别，Repositive首席执行官Fiona Nielsen告诉GenomeWeb。她说:“这是一种中间技术，它允许你在数据之上添vwin德赢ac米兰合作加一层，(然后)对该层进行查询，从而允许你(在不看到)底层敏感数据的情况下提取统计数据。”
Repositive打算在未来6个月内利用现有资金开发概念验证工具。尼尔森表示，该公司随后将寻求额外的资金来支持实际产品的开发，预计该产品将在大约八个月内完成。她表示:“我们认为，在我们的产品达到适销对路的程度并开始真正销售之前，我们仍需要进行另一轮投资。”“我们预计，在我们开始从销售中获得可观收入之前，我们需要一轮投资来支持我们至少一年半。”
一旦技术开发阶段完vwin德赢ac米兰合作成，Repositive将在2017年公开发布之前先进行内测。当该产品最终进入市场时，reposive将作为其现有平台的一部分提供付费服务尼尔森告诉GenomeWeb，大型财团、制药公司和其他大型数据库的保管者，他们希望将自己的数据提供给合作者或客户，但由于隐私问题、移动超大数据集的困难以及在不同位置维护相同数据的多个副本的问题而无法这样做。她说，该计划是提供查询服务，订阅费尚未确定，订阅费将涵盖客户希望该服务运行的时间。
Repositive是英国慈善机构DNAdigest的衍生产品。尼尔森在离开Illumina的职位后创办了这家慈善机构和公司，目的是相同的:开发改善数据获取和促进更有效数据共享的机制。在Illumina，尼尔森研究了癌症的遗传变异，还致力于构建针对肿瘤学的诊断和分析工具。她告诉基因组网说:“我们(当时)生产了大量数据，但其他人无法获得这些数据，我们也无法访问其他人的数据。”“只有当你有大量数据进行比较时，解释才有可能……所以无论我做多少分析个人基因组的工作，都不会产生很大的影响，因为如果我们无法获得大量数据(用于比较)，我们永远不会达到精准医疗的这一点。”
她说，DNAdigest的成立是为了促进良好的数据共享实践，以及现有的支持共享的工具和组织。reposive通过提供一个使基因组数据集更加可见的平台，以及围绕共同研究兴趣发起合作的论坛，形成了这枚硬币的另一半。
就像个人可能会使用TripAdvisor网站选择最适合自己需求的酒店一样，Repositive的目标是充当一个中介，告诉研究人员他们可以使用哪些数据集，并帮助他们从许多可能的选项中筛选出最适合他们目的的来源。研究人员可以使用一个简单的界面来搜索公开的人类基因组数据集，并确定哪些数据与他们的项目和研究最相关。该公司使用开发人员提供的元数据从多个存储库中获取并索引了这些数据集，数据集的描述包含在存储库中。
Repositive并不在内部托管数据集，而是提供到数据位于平台中的存储库的链接，以便用户可以直接从数据源访问和下载数据集(如果数据集是公开的)，提交存储库(如dbGAP)中受限制数据集的访问应用程序，或者购买商业数据库的许可。
除了dbGAP, Repositive还在其系统中建立了由欧洲生物信息学研究所、基因本体论、序列阅读档案和阵列快车等维护的索引数据库，并继续寻找其他资源。事实上，数据集不必来自大型财团。尼尔森说，例如，个人用户积累了数据，他们希望将这些数据广泛用于与其他数据集结合进行更深入的分析，也可以在Repositive平台中注册他们存储库中的元数据。
除了让这些单独的数据集更容易找到之外，Repositive还致力于通过“允许平台的用户对不同的数据描述进行评论和标记”来改进这些开发人员包含在其存储库中的元数据，尼尔森说。她说，其目的是帮助这些开发人员提供更完整、更有用的数据集描述。
该公司还与一些大型存储库合作，以更结构化的方式捕获他们的元数据，使公司更容易使用其应用程序编程接口将这些数据集的元数据拉入他们的平台。
尼尔森说:“这符合我们的共同利益。“他们希望提高数据集的可见性，我们越容易展示元数据，我们就越容易为他们的数据集带来流量。”她补充说，该公司还在与一些有兴趣在Repositive的系统中展示其数据集的商业数据库供应商进行谈判，希望能吸引那些不介意为更精心管理的公共数据集付费的潜在客户。
Repositive的数据发现平台自去年以来一直处于内测阶段。尼尔森表示，到目前为止，用户对该平台的反应是积极的，用户报告说，它使搜索相关数据集变得更简单，更节省时间。对于测试版，Repositive精心挑选了一些用户，并与他们一起测试平台，删除错误，并添加新功能。测试版增加的一个新功能是首先显示关于每个数据集的简单元数据，只有在用户表示对特定数据集感兴趣时才提供额外的描述。尼尔森解释说，这似乎比立即显示关于数据集的所有元数据更可取。
尼尔森表示，下一次测试将在9月份平台推出时进行，届时将有多个用户加入该系统。她说，观察社区的参与水平将是特别有趣的，因为许多beta测试者表示有兴趣从其他研究人员那里获得关于他们通过现有存储库提供的数据集的反馈。
她说:“我们的目标是尽可能方便地访问数据，通过启用技术解决方案和支持良好数据访问治理的软件，我们越能帮助用户访问公共存储库或其他机构中的数据，就越好。”“这就是我们正在提供的产品，而目前，我们还没有看到任何其他公司在他们提供的产品中有这样的专注。”