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DIY生物的世界

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在过去,我们可能用“diy生物学”来描述喜欢大自然的人的爱好。也许这仍然是正确的,但一群新的爱好者已经出现在现场。这一代人是在凝胶电泳和带有gfp克隆试剂盒的高中实验室长大的,他们想要一种更亲力亲为的方法。他们不满足于过去的追求,比如观鸟、养蚂蚁和在玻璃盘子里发芽。他们也不是严格意义上的生物学家;许多DIYbio成员,正如他们所知,是工程师和程序员,他们决心以一种新的方式研究生物学并改变世界。

我喜欢这种刺激。我仍然记得第一次克隆DNA片段时的那种兴奋感。从连接酶滴入试管的那一刻起,到我从蓝色细菌海洋中的白色菌落中分离出DNA的那一刻,看着凝胶,确定地知道我构建了一个新的质粒,我被迷住了。这听起来可能很怪,但我甚至买了自己的《Old and Primrose》基因操作原理,则称分子克隆,在温暖的夏夜下班后,把它们从头到尾读一遍。听说有热情的业余爱好者试图在他们的厨房里制造细菌传感器,这种兴奋感又重新点燃了。我必须知道更多。

作为一个组织,DIYbio仍然是一个新兴的快速发展的组织。麦肯兹·考威尔(Mackenzie Cowell)在完成生物学本科学位并在麻省理工学院的国际基因工程机器小组工作后,于2008年初开始了DIYbio。近几个月来,该组织的会员人数已增至540多人,在美国、加拿大和英国各地都有分会。

这是一个奇怪的组合。我加入了西雅图DIYbio小组,希望找到志愿者来帮助我做一些DIY生物信息学项目。相反,我发现大多数成员都想做基因工程。他们还坚信,开源软件运动的理念一旦应用于业余生物技术,就会给世界带来巨大的好处。vwin德赢ac米兰合作

与乔纳森·克莱恩(Jonathan Cline)交谈,他是旧金山的DIYbio项目经理和现实生活中的电气工程师,让我对DIYbio哲学有了一些见解。我了解到,作为一个整体,这个团队非常热衷于低成本地建造东西,分享信息和工具,并为爱好者寻找方法来进行实验,并将数据贡献给公共数据库。克莱因的梦想场景是拥有标准化的生物部件,这些部件具有可预测的行为,这样这些部件就可以结合起来,细胞就可以按照预期的方式运行。他举了一个例子,把计算逻辑放到带有记忆电路的单元中。该电路将有多个启动子,两个不同深浅的绿色荧光蛋白基因,以及一个可以创建反馈回路的放大器。细菌对刺激的反应会变成绿色,一段时间后,它们会切换到产生另一种颜色的绿色荧光蛋白,变成红色。

在另一种情况下,缺乏维生素的人可能会吞下含有能制造维生素的细菌的药片。当细菌到达肾脏时,pH传感器会导致细菌自我毁灭。我花了好几个月的时间,通过添加一个化学信号,让细菌根据一个命令,产生大量特定的蛋白质。尽管如此,把细菌当成可编程机器人的想法对我来说还是很新鲜的,尤其是很明显,其中一些程序员对他们的生物操作系统知之甚少。

有些哲学概念也令人费解。我花了多年时间与试图将科学教育带给公众的团体合作,所以当听到克莱因和其他一些diy生物的人确信生物学信息被故意锁在某个地方并隐藏起来时,我感到不安。是的,确实有些期刊文章需要订阅,但对我来说,这似乎并不是那么可怕。许多本科课程的课堂笔记都在网上,很容易找到。我试图指出,NCBI有可搜索的教科书,你可以在亚马逊上花不到10美元买到一本二手的《旧的和报春花》(Old and Primrose),但克莱不听。

对我来说,diy生物学的逻辑,即教人们如何建造自己的凝胶盒,必然会使科学研究更便宜,并不是很有吸引力。在我的预算中,最高的开支总是工资,而不是凝胶盒。幸运的是,diy生物爱好者将免费工作,因为很明显,他们将需要大量的时间来解决错误和学习生物学。最近,该小组的一个宣传项目——制造能检测三聚氰胺的细菌——遭遇了挫折,因为参与该项目的人员没有意识到某些质粒只能在某些细菌群中复制。没错,你不能只写一个大肠杆菌质粒在乳酸菌假设它是可行的。不管我们怎么想,我们都很难忽视学习曲线。

如果我听起来有点怀疑diy者能完成任何有用的事情,那并不是因为我认为这些问题真的很难解决。我对此表示怀疑,因为我知道生物学并不像工程师们想象的那样可预测。一个有十亿个细菌的培养环境是一个有一千亿个个体的培养环境,这些个体的行为会根据一天中的时间和给予它们的食物而有所不同。当然,在恒化器中,情况有点不同,但还没有人在谈论在家里建造恒化器。我也持怀疑态度,因为我从经验中知道,这种工作需要时间和耐心。我怀疑,如果DIYbio项目有所贡献,那可能是因为它吸引了像我这样的人的想象力,这些专业人士自愿加入进来,提供建议,并在场外享受热情。

你可以在www.diybio.org

Sandra Porter博士是Geospiza的教育主管。她的博客地址是scienceblogs.com/digitalbio

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