纽约——新的研究表明，“黑色素集中激素受体2”编码基因MCHR2的序列重复数量可以提示德国牧羊犬罹患一种被称为先天性特发性巨食管(CIM)的神经肌肉消化疾病的风险，这种疾病会影响吞咽、食物向胃的运动和幼犬的生存。
克莱姆森大学的遗传学和生物化学研究员、资深作者Leigh Anne Clark在一份声明中说:“通过确定德国牧羊犬CIM的主要基因贡献者，我们为育种者提供了一种工具，他们可以使用它来减少疾病发生率，同时保持遗传多样性。”
对于一个纸发表在公共科学图书馆遗传学周四，来自克莱姆森大学、国家人类基因组研究所和美国和英国其他中心的研究人员初步收集了530只带有或不带有CIM的宠物或服务犬的血液或口腔拭子样本，并结合了另外750多只德国牧羊犬的表型线索。
在这些狗群中，研究小组发现，这种情况在雄性德国牧羊犬中大约是前者的两倍，与狗的大小无关，这表明对雌性具有潜在的保护作用。之前的研究表明，德国牧羊犬是最明显的CIM风险，尽管也有一些其他品种的狗，从大丹犬或拉布拉多寻回犬到腊肠犬和迷你雪纳瑞犬的描述。
研究人员继续进行了连锁不平衡分析和全基因组关联研究，涉及59只患有CIM的德国牧羊犬和53只来自同一品种的未受影响的对照犬，缩小了犬基因组第12号染色体上的CIM相关位点。
随后，他们对另外3只受影响的雌性德国牧羊犬进行了更详细的全基因组重测序，并对1300多只其他家养狗进行了可用的基因组序列数据，重点关注MCHR2中的33碱基对可变数串联重复序列(VNTR)，该基因与德国牧羊犬CIM风险的增强有关。
在研究基于MCHR2 VNTR基因型和生物性别预测CIM的可能性之前，研究小组使用了数百只受CIM影响或未受CIM影响的狗的基因分型数据，分析了该位点的等位基因变体。
“在超过75%的狗身上，性别和MCHR2重复序列可以准确预测情感状态，”作者报告说，“现在有一种基因测试可以促进旨在减少疾病发病率的繁殖决策。”
研究小组注意到，与cim相关的重复，位于MCHR2的第一个内含子中，在狼和其他家养犬种中最常出现在两个副本中，而在大多数德国牧羊犬中发现的是一个或三个副本等位基因。
研究人员解释说，在德国牧羊犬中，CIM风险与单拷贝重复等位基因密切相关，特别是当该等位基因在MCHR2序列的两个副本中都存在时。由于VNTR跨越一个T-box转录因子共识结合序列，他们推测结合位点可能影响MCHR2的表达和与cimi相关的黑色素聚集激素活性。
基于他们目前的发现，作者建议未来的研究工作可能会提供更多关于VNTR和德国牧羊犬和其他犬种的CIM的性别相关风险和其他胃肠道疾病的见解。